doc/src/docbook/overview/index.xml

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
3153 05 Mar 07 nicklas 1 <?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
3159 05 Mar 07 martin 2 <!DOCTYPE part PUBLIC 
3159 05 Mar 07 martin 3     "-//Dawid Weiss//DTD DocBook V3.1-Based Extension for XML and graphics inclusion//EN" 
3192 13 Mar 07 martin 4     "../../../../lib/docbook/preprocess/dweiss-docbook-extensions.dtd">
3159 05 Mar 07 martin 5 <!--
3192 13 Mar 07 martin 6   $Id$
3153 05 Mar 07 nicklas 7
4889 06 Apr 09 nicklas 8   Copyright (C) 2007 Jari Häkkinen, Nicklas Nordborg, Martin Svensson
4889 06 Apr 09 nicklas 9   Copyright (C) 2008 Jari Häkkinen
5824 25 Oct 11 jari 10   Copyright (C) 2011 Jari Häkkinen, Nicklas Nordborg
3159 05 Mar 07 martin 11
3159 05 Mar 07 martin 12   This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
3159 05 Mar 07 martin 13   Available at http://base.thep.lu.se/
3159 05 Mar 07 martin 14
3159 05 Mar 07 martin 15   BASE is free software; you can redistribute it and/or
3159 05 Mar 07 martin 16   modify it under the terms of the GNU General Public License
4477 05 Sep 08 jari 17   as published by the Free Software Foundation; either version 3
3159 05 Mar 07 martin 18   of the License, or (at your option) any later version.
3159 05 Mar 07 martin 19
3159 05 Mar 07 martin 20   BASE is distributed in the hope that it will be useful,
3159 05 Mar 07 martin 21   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
3159 05 Mar 07 martin 22   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
3159 05 Mar 07 martin 23   GNU General Public License for more details.
3159 05 Mar 07 martin 24
3159 05 Mar 07 martin 25   You should have received a copy of the GNU General Public License
4509 11 Sep 08 jari 26   along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
3159 05 Mar 07 martin 27 -->
5824 25 Oct 11 jari 28
3161 06 Mar 07 martin 29 <part id="overviewdoc">
5782 04 Oct 11 nicklas 30   <?dbhtml filename="overview.html"?>
3153 05 Mar 07 nicklas 31   <title>Overview</title>
3428 31 May 07 jari 32
5824 25 Oct 11 jari 33   <partintro id="overview_intro">
3428 31 May 07 jari 34     <para>
5824 25 Oct 11 jari 35       BASE is a freely available software solution designed for
5824 25 Oct 11 jari 36       laboratories looking for a single point of storage for all
5824 25 Oct 11 jari 37       information related to their experimentation and for storing,
5824 25 Oct 11 jari 38       managing, and analysing genomics/transcriptomics data. BASE
5824 25 Oct 11 jari 39       offers a multi-user local data repository featuring a web
5824 25 Oct 11 jari 40       browser user interface, laboratory information management system
5824 25 Oct 11 jari 41       (LIMS) for biomaterials and array production, annotations such
5824 25 Oct 11 jari 42       as clinical information, hierarchical overview of analysis, and
5824 25 Oct 11 jari 43       integrates tools like <ulink
5825 25 Oct 11 jari 44       url='http://www.tm4.org/mev/'>MultiExperiment Viewer</ulink>.
3428 31 May 07 jari 45     </para>
5824 25 Oct 11 jari 46
5824 25 Oct 11 jari 47     <para>
5824 25 Oct 11 jari 48       BASE is <ulink
5824 25 Oct 11 jari 49       url='http://www.gnu.org/licenses/gpl-3.0.html'>GPLv3
5824 25 Oct 11 jari 50       licensed</ulink> and can be freely downloaded and installed by
5824 25 Oct 11 jari 51       anyone. Once installed and configured, the system comprise a
5824 25 Oct 11 jari 52       database layer and a web server coupled to layers of software
5824 25 Oct 11 jari 53       for managing and analysing data in the database.
5824 25 Oct 11 jari 54     </para>
3428 31 May 07 jari 55   </partintro>
3428 31 May 07 jari 56
3159 05 Mar 07 martin 57   <include file="why_base.xml"/>
4421 27 Aug 08 jari 58   <include file="features.xml"/>
3251 18 Apr 07 martin 59   <include file="resources.xml"/>
3428 31 May 07 jari 60 </part>