src/core/net/sf/basedb/util/listable/SourceItemTransformerChain.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
6774 17 Mar 15 nicklas 1 /**
6774 17 Mar 15 nicklas 2   $Id$
6774 17 Mar 15 nicklas 3
6774 17 Mar 15 nicklas 4   Copyright (C) 2015 Nicklas Nordborg
6774 17 Mar 15 nicklas 5
6774 17 Mar 15 nicklas 6   This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
6774 17 Mar 15 nicklas 7   Available at http://base.thep.lu.se/
6774 17 Mar 15 nicklas 8
6774 17 Mar 15 nicklas 9   BASE is free software; you can redistribute it and/or
6774 17 Mar 15 nicklas 10   modify it under the terms of the GNU General Public License
6774 17 Mar 15 nicklas 11   as published by the Free Software Foundation; either version 3
6774 17 Mar 15 nicklas 12   of the License, or (at your option) any later version.
6774 17 Mar 15 nicklas 13
6774 17 Mar 15 nicklas 14   BASE is distributed in the hope that it will be useful,
6774 17 Mar 15 nicklas 15   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
6774 17 Mar 15 nicklas 16   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
6774 17 Mar 15 nicklas 17   GNU General Public License for more details.
6774 17 Mar 15 nicklas 18
6774 17 Mar 15 nicklas 19   You should have received a copy of the GNU General Public License
6774 17 Mar 15 nicklas 20   along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
6774 17 Mar 15 nicklas 21 */
6774 17 Mar 15 nicklas 22 package net.sf.basedb.util.listable;
6774 17 Mar 15 nicklas 23
6796 24 Mar 15 nicklas 24 import java.util.HashSet;
6774 17 Mar 15 nicklas 25 import java.util.List;
6774 17 Mar 15 nicklas 26 import java.util.Set;
6774 17 Mar 15 nicklas 27
6774 17 Mar 15 nicklas 28 import net.sf.basedb.core.Item;
6774 17 Mar 15 nicklas 29
6774 17 Mar 15 nicklas 30 /**
6774 17 Mar 15 nicklas 31   Chains together one or more source item transformers. Each step in the
6774 17 Mar 15 nicklas 32   chain should take over from the previous in the sense that the
6774 17 Mar 15 nicklas 33   {@link SourceItemTransformer#getSourceItemType()} of step N+1
6774 17 Mar 15 nicklas 34   must match the {@link SourceItemTransformer#getTargetItemType()} 
6774 17 Mar 15 nicklas 35   of step N.
6774 17 Mar 15 nicklas 36
6774 17 Mar 15 nicklas 37   @author Nicklas
6774 17 Mar 15 nicklas 38   @since 3.5
6774 17 Mar 15 nicklas 39 */
6774 17 Mar 15 nicklas 40 public class SourceItemTransformerChain 
6774 17 Mar 15 nicklas 41   implements SourceItemTransformer 
6774 17 Mar 15 nicklas 42 {
6774 17 Mar 15 nicklas 43
6774 17 Mar 15 nicklas 44   private final List<SourceItemTransformer> chain;
6774 17 Mar 15 nicklas 45   
6774 17 Mar 15 nicklas 46   private final Item source;
6774 17 Mar 15 nicklas 47   private final Item target;
6774 17 Mar 15 nicklas 48   
6774 17 Mar 15 nicklas 49   /**
6774 17 Mar 15 nicklas 50     Create a new source item transformer chain. The chain
6774 17 Mar 15 nicklas 51     must contain at least one element and all steps must have
6774 17 Mar 15 nicklas 52     matching source and target item types.
6774 17 Mar 15 nicklas 53     @throws IllegalArgumentException If the chain is null or empty or have non-matching
6774 17 Mar 15 nicklas 54       transformation steps
6774 17 Mar 15 nicklas 55   */
6774 17 Mar 15 nicklas 56   public SourceItemTransformerChain(List<SourceItemTransformer> chain)
6774 17 Mar 15 nicklas 57   {
6774 17 Mar 15 nicklas 58     if (chain == null || chain.size() == 0)
6774 17 Mar 15 nicklas 59     {
6774 17 Mar 15 nicklas 60       throw new IllegalArgumentException("Chain is null or empty");
6774 17 Mar 15 nicklas 61     }
6774 17 Mar 15 nicklas 62     for (int i = 1; i < chain.size(); i++)
6774 17 Mar 15 nicklas 63     {
6774 17 Mar 15 nicklas 64       Item prevTarget = chain.get(i-1).getTargetItemType();
6774 17 Mar 15 nicklas 65       Item nextSrc = chain.get(i).getSourceItemType();
6774 17 Mar 15 nicklas 66       if (prevTarget != nextSrc)
6774 17 Mar 15 nicklas 67       {
6774 17 Mar 15 nicklas 68         throw new IllegalArgumentException("Source and target mismatch in chain["+i+"]: " + 
6774 17 Mar 15 nicklas 69           nextSrc.name() + " != " + prevTarget.name());
6774 17 Mar 15 nicklas 70       }
6774 17 Mar 15 nicklas 71     }
6774 17 Mar 15 nicklas 72     this.chain = chain;
6774 17 Mar 15 nicklas 73     this.source = chain.get(0).getSourceItemType();
6774 17 Mar 15 nicklas 74     this.target = chain.get(chain.size()-1).getTargetItemType();
6774 17 Mar 15 nicklas 75   }
6774 17 Mar 15 nicklas 76   
6774 17 Mar 15 nicklas 77   /**
6774 17 Mar 15 nicklas 78     Get the source item type of the first step in the chain.
6774 17 Mar 15 nicklas 79   */
6774 17 Mar 15 nicklas 80   @Override
6774 17 Mar 15 nicklas 81   public Item getSourceItemType() 
6774 17 Mar 15 nicklas 82   {
6774 17 Mar 15 nicklas 83     return source;
6774 17 Mar 15 nicklas 84   }
6774 17 Mar 15 nicklas 85
6774 17 Mar 15 nicklas 86   /**
6774 17 Mar 15 nicklas 87     Get the target item type of the last step in the chain.
6774 17 Mar 15 nicklas 88   */
6774 17 Mar 15 nicklas 89   @Override
6774 17 Mar 15 nicklas 90   public Item getTargetItemType() 
6774 17 Mar 15 nicklas 91   {
6774 17 Mar 15 nicklas 92     return target;
6774 17 Mar 15 nicklas 93   }
6774 17 Mar 15 nicklas 94   
6774 17 Mar 15 nicklas 95   /**
6774 17 Mar 15 nicklas 96     Transform the source items into target items by invoking each
6774 17 Mar 15 nicklas 97     step in the transformer chain.
6774 17 Mar 15 nicklas 98   */
6774 17 Mar 15 nicklas 99   @Override
6774 17 Mar 15 nicklas 100   public Set<Integer> transform(TransformContext context, Set<Integer> source) 
6774 17 Mar 15 nicklas 101   {
6774 17 Mar 15 nicklas 102     for (SourceItemTransformer sit : chain)
6774 17 Mar 15 nicklas 103     {
6774 17 Mar 15 nicklas 104       source = sit.transform(context, source);
6774 17 Mar 15 nicklas 105     }
6774 17 Mar 15 nicklas 106     return source;
6774 17 Mar 15 nicklas 107   }
6774 17 Mar 15 nicklas 108
6796 24 Mar 15 nicklas 109   // To test how filters behave when input source set is large
6796 24 Mar 15 nicklas 110   private Set<Integer> appendFakeSources(Set<Integer> existing)
6796 24 Mar 15 nicklas 111   {
6796 24 Mar 15 nicklas 112     Set<Integer> fake = new HashSet<Integer>(existing);
6796 24 Mar 15 nicklas 113     while (fake.size() < 40000)
6796 24 Mar 15 nicklas 114     {
6796 24 Mar 15 nicklas 115       fake.add(-fake.size());
6796 24 Mar 15 nicklas 116     }
6796 24 Mar 15 nicklas 117     return fake;
6796 24 Mar 15 nicklas 118   }
6774 17 Mar 15 nicklas 119 }

Generated on Sat Oct  7 02:38:18 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)