src/core/net/sf/basedb/util/overview/validator/PlatformValidator.java

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
4740 05 Feb 09 nicklas 1 /**
4740 05 Feb 09 nicklas 2   $Id$
4740 05 Feb 09 nicklas 3
4740 05 Feb 09 nicklas 4   Copyright (C) 2008 Nicklas Nordborg
4740 05 Feb 09 nicklas 5
4740 05 Feb 09 nicklas 6   This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
4740 05 Feb 09 nicklas 7   Available at http://base.thep.lu.se/
4740 05 Feb 09 nicklas 8
4740 05 Feb 09 nicklas 9   BASE is free software; you can redistribute it and/or
4740 05 Feb 09 nicklas 10   modify it under the terms of the GNU General Public License
4740 05 Feb 09 nicklas 11   as published by the Free Software Foundation; either version 3
4740 05 Feb 09 nicklas 12   of the License, or (at your option) any later version.
4740 05 Feb 09 nicklas 13
4740 05 Feb 09 nicklas 14   BASE is distributed in the hope that it will be useful,
4740 05 Feb 09 nicklas 15   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
4740 05 Feb 09 nicklas 16   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
4740 05 Feb 09 nicklas 17   GNU General Public License for more details.
4740 05 Feb 09 nicklas 18
4740 05 Feb 09 nicklas 19   You should have received a copy of the GNU General Public License
4740 05 Feb 09 nicklas 20   along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
4740 05 Feb 09 nicklas 21 */
4740 05 Feb 09 nicklas 22 package net.sf.basedb.util.overview.validator;
4740 05 Feb 09 nicklas 23
4740 05 Feb 09 nicklas 24 import net.sf.basedb.core.BasicItem;
4740 05 Feb 09 nicklas 25 import net.sf.basedb.core.DbControl;
5136 15 Oct 09 nicklas 26 import net.sf.basedb.core.FileStoreEnabled;
4740 05 Feb 09 nicklas 27 import net.sf.basedb.core.Item;
4740 05 Feb 09 nicklas 28 import net.sf.basedb.core.Platform;
4740 05 Feb 09 nicklas 29 import net.sf.basedb.core.PlatformVariant;
4740 05 Feb 09 nicklas 30 import net.sf.basedb.core.Project;
4740 05 Feb 09 nicklas 31 import net.sf.basedb.core.RawBioAssay;
4740 05 Feb 09 nicklas 32 import net.sf.basedb.util.overview.Fix;
4740 05 Feb 09 nicklas 33 import net.sf.basedb.util.overview.OverviewContext;
4740 05 Feb 09 nicklas 34 import net.sf.basedb.util.overview.Validator;
4740 05 Feb 09 nicklas 35 import net.sf.basedb.util.overview.Node;
4740 05 Feb 09 nicklas 36
4740 05 Feb 09 nicklas 37 /**
4740 05 Feb 09 nicklas 38   Validator implementation for platforms/variants. Validation rules:
4740 05 Feb 09 nicklas 39   <ul>
4740 05 Feb 09 nicklas 40   <li>Access denied: {@link Validator#DENIED_PLATFORM}
4740 05 Feb 09 nicklas 41   <li>Non-default platform: {@link Validator#NONDEFAULT_PLATFORM}
4740 05 Feb 09 nicklas 42   </ul>
4740 05 Feb 09 nicklas 43
4740 05 Feb 09 nicklas 44   @author Nicklas
4740 05 Feb 09 nicklas 45   @version 2.10
4740 05 Feb 09 nicklas 46   @base.modified $Date$
4740 05 Feb 09 nicklas 47 */
4740 05 Feb 09 nicklas 48 public class PlatformValidator
4764 16 Feb 09 nicklas 49   extends NameableNodeValidator<Platform>
4740 05 Feb 09 nicklas 50 {
4740 05 Feb 09 nicklas 51   
4740 05 Feb 09 nicklas 52   public PlatformValidator()
4740 05 Feb 09 nicklas 53   {
4740 05 Feb 09 nicklas 54     super(null, Validator.DENIED_PLATFORM);
4740 05 Feb 09 nicklas 55   }
4740 05 Feb 09 nicklas 56   
4740 05 Feb 09 nicklas 57   /* 
4740 05 Feb 09 nicklas 58     From BasicNodeValidator class
4740 05 Feb 09 nicklas 59     -----------------------------
4740 05 Feb 09 nicklas 60   */
4740 05 Feb 09 nicklas 61   /**
5218 18 Jan 10 jari 62     Checks if the platform is the same as
4740 05 Feb 09 nicklas 63     the default for the project.
4740 05 Feb 09 nicklas 64   */
4740 05 Feb 09 nicklas 65   @Override
4740 05 Feb 09 nicklas 66   public void postValidate(DbControl dc, OverviewContext context, Node node, Node parentNode)
4740 05 Feb 09 nicklas 67   {
4740 05 Feb 09 nicklas 68     super.postValidate(dc, context, node, parentNode);
5807 14 Oct 11 nicklas 69     Platform platform = (Platform)node.getItem(dc);
5136 15 Oct 09 nicklas 70     PlatformVariant variant = null;
5136 15 Oct 09 nicklas 71     boolean failedVariant = false;
5807 14 Oct 11 nicklas 72     BasicItem parentItem = parentNode.getItem(dc);
5136 15 Oct 09 nicklas 73     try
5136 15 Oct 09 nicklas 74     {
5136 15 Oct 09 nicklas 75       variant = ((FileStoreEnabled)parentItem).getVariant();
5136 15 Oct 09 nicklas 76     }
5136 15 Oct 09 nicklas 77     catch (Throwable t)
5136 15 Oct 09 nicklas 78     {
5136 15 Oct 09 nicklas 79       // Failure to load the variant is detected by other validators
5136 15 Oct 09 nicklas 80       failedVariant = true;
5136 15 Oct 09 nicklas 81     }
4740 05 Feb 09 nicklas 82     String parentTypeName = parentNode.getItemType().toString().toLowerCase();
4740 05 Feb 09 nicklas 83     boolean canChangePlatform = false;
4740 05 Feb 09 nicklas 84     if (parentNode.getItemType() == Item.RAWBIOASSAY)
4740 05 Feb 09 nicklas 85     {
4740 05 Feb 09 nicklas 86       RawBioAssay rba = (RawBioAssay)parentItem;
4740 05 Feb 09 nicklas 87       canChangePlatform = rba.getNumDbSpots() == 0;
4740 05 Feb 09 nicklas 88     }
4740 05 Feb 09 nicklas 89     
5652 10 Jun 11 nicklas 90     
5652 10 Jun 11 nicklas 91     Project project = context.getProject();
5652 10 Jun 11 nicklas 92     if (project != null)
4740 05 Feb 09 nicklas 93     {
5813 18 Oct 11 nicklas 94       if (variant != null)
5652 10 Jun 11 nicklas 95       {
5813 18 Oct 11 nicklas 96         // The item has a platform variant, so we check that
5814 18 Oct 11 nicklas 97         if (!project.isDefaultItem(variant) && !project.isDefaultItem(platform) &&
5814 18 Oct 11 nicklas 98           (project.hasDefaultForItem(variant) || project.hasDefaultForItem(platform)))
5813 18 Oct 11 nicklas 99         {
5813 18 Oct 11 nicklas 100           context.createFailure(Validator.NONDEFAULT_PLATFORM, parentNode, null,
5813 18 Oct 11 nicklas 101             canChangePlatform ? new Fix("Change platform/variant of " + parentTypeName, parentItem) : null,
5814 18 Oct 11 nicklas 102             new Fix("Add '" + variant.getName() + "' as default platform variant to project", project),
5814 18 Oct 11 nicklas 103             new Fix("Add '" + platform.getName() + "' as default platform to project", project)
5813 18 Oct 11 nicklas 104           );
5813 18 Oct 11 nicklas 105         }
5652 10 Jun 11 nicklas 106       }
5813 18 Oct 11 nicklas 107       else if (!failedVariant)
5813 18 Oct 11 nicklas 108       {
5813 18 Oct 11 nicklas 109         // The item only has a platform, so we check that
5814 18 Oct 11 nicklas 110         if (!project.isDefaultItem(platform) && project.hasDefaultForItem(platform))
5813 18 Oct 11 nicklas 111         {
5813 18 Oct 11 nicklas 112           context.createFailure(Validator.NONDEFAULT_PLATFORM, parentNode, null,
5813 18 Oct 11 nicklas 113             canChangePlatform ? new Fix("Change platform of " + parentTypeName, parentItem) : null,
5813 18 Oct 11 nicklas 114             new Fix("Add '" + platform.getName() + "' as default platform to project", project)
5813 18 Oct 11 nicklas 115           );
5813 18 Oct 11 nicklas 116         }
5813 18 Oct 11 nicklas 117       }
4740 05 Feb 09 nicklas 118     }
4740 05 Feb 09 nicklas 119   }
4740 05 Feb 09 nicklas 120   
4740 05 Feb 09 nicklas 121   /**
4740 05 Feb 09 nicklas 122     @return Always null
4740 05 Feb 09 nicklas 123   */
4740 05 Feb 09 nicklas 124   @Override
5651 08 Jun 11 nicklas 125   protected Fix getMissingItemFix(DbControl dc, Node parentNode)
4740 05 Feb 09 nicklas 126   {
4740 05 Feb 09 nicklas 127     return null;
4740 05 Feb 09 nicklas 128   }
4740 05 Feb 09 nicklas 129   // --------------------------------
4740 05 Feb 09 nicklas 130 }

Generated on Sat Oct  7 02:39:01 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)