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3675 16 Aug 07 jari 3   Copyright (C) 2005 Nicklas Nordborg
5425 23 Sep 10 nicklas 4   Copyright (C) 2006 Jari Häkkinen, Nicklas Nordborg, Martin Svensson
827 27 Jun 05 nicklas 5
2304 22 May 06 jari 6   This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
2304 22 May 06 jari 7   Available at http://base.thep.lu.se/
827 27 Jun 05 nicklas 8
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827 27 Jun 05 nicklas 21   ------------------------------------------------------------------
827 27 Jun 05 nicklas 22
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7087 03 Mar 16 nicklas 60   import="net.sf.basedb.util.formatter.ValueTypeFormatter"
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6045 03 Apr 12 nicklas 73   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.list.ListColumnUtil"
1980 14 Feb 06 nicklas 74   import="java.util.Enumeration"
845 29 Jun 05 nicklas 75   import="java.util.Set"
1980 14 Feb 06 nicklas 76   import="java.util.HashSet"
1980 14 Feb 06 nicklas 77   import="java.util.List"
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1980 14 Feb 06 nicklas 79   import="java.util.Collections"
1980 14 Feb 06 nicklas 80   import="java.util.Collection"
1980 14 Feb 06 nicklas 81   import="java.util.Arrays"
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827 27 Jun 05 nicklas 83 %>
827 27 Jun 05 nicklas 84 <%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
827 27 Jun 05 nicklas 85 <%!
1980 14 Feb 06 nicklas 86   private static final ItemContext defaultContext = Base.createDefaultContext("name", "name,valueType,requiredForMiame,itemTypes,description");
1980 14 Feb 06 nicklas 87   private static final Item itemType = Item.ANNOTATIONTYPE;
4907 28 Apr 09 martin 88   
4907 28 Apr 09 martin 89   private static void registerExportUtils(ItemContext cc)
4907 28 Apr 09 martin 90   {
4907 28 Apr 09 martin 91     // Register formatter
4907 28 Apr 09 martin 92     cc.setObject("export.formatter.&categories(name)", new NameableFormatter());
7087 03 Mar 16 nicklas 93     cc.setObject("export.formatter.valueType", new ValueTypeFormatter());
4907 28 Apr 09 martin 94     
4907 28 Apr 09 martin 95     // Register dataloader
4907 28 Apr 09 martin 96     String typeParameter = "annotationType";
4907 28 Apr 09 martin 97     ItemQuery<AnnotationTypeCategory> categoryQuery = AnnotationTypeCategory.getQuery();
4907 28 Apr 09 martin 98     categoryQuery.include(cc.getInclude());
4907 28 Apr 09 martin 99     categoryQuery.join(Hql.innerJoin("annotationTypes", "atp"));
4907 28 Apr 09 martin 100     categoryQuery.restrict(Restrictions.eq(Hql.alias("atp"), Expressions.parameter(typeParameter)));
4907 28 Apr 09 martin 101     categoryQuery.order(Orders.asc(Hql.property("name")));
7604 25 Feb 19 nicklas 102     cc.setObject("export.dataloader.&categories(name)", new ItemQueryLoader<AnnotationType>(categoryQuery, typeParameter));
7088 03 Mar 16 nicklas 103
7088 03 Mar 16 nicklas 104     // The item types collection -- loader return Set<Item> which need EnumFormatter -> Item.name()
7088 03 Mar 16 nicklas 105     cc.setObject("export.dataloader.@itemTypes", new AnnotationTypeItemTypesLoader());
7088 03 Mar 16 nicklas 106     cc.setObject("export.formatter.@itemTypes", new EnumFormatter<Item>(Item.class));
7089 03 Mar 16 nicklas 107     
7089 03 Mar 16 nicklas 108     // Enumeration values
7089 03 Mar 16 nicklas 109     cc.setObject("export.dataloader.enumeration", new AnnotationTypeEnumerationLoader());
7604 25 Feb 19 nicklas 110     cc.setObject("export.formatter.enumeration", new ToStringFormatter<Object>());
7089 03 Mar 16 nicklas 111     
4907 28 Apr 09 martin 112   }
827 27 Jun 05 nicklas 113 %>
827 27 Jun 05 nicklas 114 <%
1980 14 Feb 06 nicklas 115 final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(pageContext, true);
827 27 Jun 05 nicklas 116 final String ID = sc.getId();
1980 14 Feb 06 nicklas 117 final String cmd = request.getParameter("cmd");
1980 14 Feb 06 nicklas 118 final String root = request.getContextPath()+"/";
1980 14 Feb 06 nicklas 119 final String mode = request.getParameter("mode");
1980 14 Feb 06 nicklas 120 final String callback = request.getParameter("callback");
1980 14 Feb 06 nicklas 121 final String itemId = request.getParameter("item_id");
1980 14 Feb 06 nicklas 122 final String listPage = "list_annotationtypes.jsp?ID="+ID
1980 14 Feb 06 nicklas 123   +(mode == null ? "" : "&mode="+mode)
1980 14 Feb 06 nicklas 124   +(callback == null ? "" : "&callback="+callback)
1980 14 Feb 06 nicklas 125   +(itemId == null ? "" : "&item_id="+itemId);
1980 14 Feb 06 nicklas 126 final String viewPage = "view_annotationtype.jsp?ID="+ID;
1980 14 Feb 06 nicklas 127 final String editPage = "edit_annotationtype.jsp?ID="+ID;
827 27 Jun 05 nicklas 128
1980 14 Feb 06 nicklas 129 String forward = null;
1980 14 Feb 06 nicklas 130 String redirect = null;
1980 14 Feb 06 nicklas 131 String message = null;
1980 14 Feb 06 nicklas 132 DbControl dc = null;
1980 14 Feb 06 nicklas 133
827 27 Jun 05 nicklas 134 try
827 27 Jun 05 nicklas 135 {
1980 14 Feb 06 nicklas 136   if (cmd == null || "List".equals(cmd))
1980 14 Feb 06 nicklas 137   {
1980 14 Feb 06 nicklas 138     // Display the list page without updatinging the current context
2811 26 Oct 06 nicklas 139     Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, null, defaultContext, true);
1980 14 Feb 06 nicklas 140     redirect = listPage;
1980 14 Feb 06 nicklas 141   }
1980 14 Feb 06 nicklas 142   else if ("UpdateContext".equals(cmd))
1980 14 Feb 06 nicklas 143   {
1980 14 Feb 06 nicklas 144     // Display the list page after updating the current context from the request parameters
1980 14 Feb 06 nicklas 145     Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1980 14 Feb 06 nicklas 146     redirect = listPage;
1980 14 Feb 06 nicklas 147   }
1980 14 Feb 06 nicklas 148   else if ("LoadContext".equals(cmd))
1980 14 Feb 06 nicklas 149   {
1980 14 Feb 06 nicklas 150     // Display the list page after loading a saved context
1980 14 Feb 06 nicklas 151     int contextId = Values.getInt(request.getParameter("context"));
1980 14 Feb 06 nicklas 152     Base.loadContext(sc, contextId, defaultContext);
1980 14 Feb 06 nicklas 153     redirect = listPage;
1980 14 Feb 06 nicklas 154   }
1980 14 Feb 06 nicklas 155
1980 14 Feb 06 nicklas 156   else if ("ViewItem".equals(cmd))
1980 14 Feb 06 nicklas 157   {
1980 14 Feb 06 nicklas 158     // Display the view page for a single item 
1980 14 Feb 06 nicklas 159     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1980 14 Feb 06 nicklas 160     forward = viewPage;
1980 14 Feb 06 nicklas 161   }
1980 14 Feb 06 nicklas 162   else if ("EditItem".equals(cmd))
1980 14 Feb 06 nicklas 163   {
1980 14 Feb 06 nicklas 164     // Display the edit page for a single item (should be opened in a popup)
1980 14 Feb 06 nicklas 165     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1980 14 Feb 06 nicklas 166     redirect = editPage;
1980 14 Feb 06 nicklas 167   }
1980 14 Feb 06 nicklas 168   else if ("NewItem".equals(cmd))
1980 14 Feb 06 nicklas 169   {
1980 14 Feb 06 nicklas 170     // Display the edit page for a new item (should be opened in a popup)
1980 14 Feb 06 nicklas 171     if (!sc.hasPermission(Permission.CREATE, itemType))
827 27 Jun 05 nicklas 172     {
1980 14 Feb 06 nicklas 173       throw new PermissionDeniedException(Permission.CREATE, itemType.toString());
827 27 Jun 05 nicklas 174     }
1980 14 Feb 06 nicklas 175     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1980 14 Feb 06 nicklas 176     cc.setId(0);
1980 14 Feb 06 nicklas 177     redirect = editPage+"&value_type="+request.getParameter("value_type");
1980 14 Feb 06 nicklas 178   }
1980 14 Feb 06 nicklas 179   else if ("UpdateItem".equals(cmd))
1980 14 Feb 06 nicklas 180   {
1980 14 Feb 06 nicklas 181     // Update the properties on an item (will close the popup)
1980 14 Feb 06 nicklas 182     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, null, defaultContext);
4544 25 Sep 08 nicklas 183     final int maxRecent = Base.getMaxRecent(sc);
7954 12 May 21 nicklas 184     dc = sc.newDbControl(":Edit "+itemType);
7605 26 Feb 19 nicklas 185     AnnotationType annotationType = cc.getObject("item");
1980 14 Feb 06 nicklas 186     if (annotationType == null)
827 27 Jun 05 nicklas 187     {
1980 14 Feb 06 nicklas 188       Type valueType = Type.valueOf(request.getParameter("value_type"));
1980 14 Feb 06 nicklas 189       annotationType = AnnotationType.getNew(dc, valueType);
1980 14 Feb 06 nicklas 190       message = "Annotation type created";
1980 14 Feb 06 nicklas 191       dc.saveItem(annotationType);
827 27 Jun 05 nicklas 192     }
1980 14 Feb 06 nicklas 193     else
827 27 Jun 05 nicklas 194     {
5060 19 Aug 09 nicklas 195       dc.reattachItem(annotationType, false);
1980 14 Feb 06 nicklas 196       message = "Annotation type updated";
1980 14 Feb 06 nicklas 197     }
5510 19 Nov 10 nicklas 198     JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, GuiContext.item(Item.ANNOTATIONTYPE), annotationType);
7604 25 Feb 19 nicklas 199     ExtensionsInvoker<OnSaveAction> invoker = EditUtil.useOnSaveExtensions(jspContext);
5510 19 Nov 10 nicklas 200     try
1980 14 Feb 06 nicklas 201     {
5510 19 Nov 10 nicklas 202       annotationType.setName(Values.getStringOrNull(request.getParameter("name")));
5510 19 Nov 10 nicklas 203       annotationType.setDescription(Values.getStringOrNull(request.getParameter("description")));
5510 19 Nov 10 nicklas 204       annotationType.setExternalId(Values.getStringOrNull(request.getParameter("external_id")));
5510 19 Nov 10 nicklas 205       annotationType.setMultiplicity(Values.getInt(request.getParameter("multiplicity"), 0));
5510 19 Nov 10 nicklas 206       annotationType.setDefaultValue(request.getParameter("defaultValue"));
5510 19 Nov 10 nicklas 207       annotationType.setRequiredForMiame(Values.getBoolean(request.getParameter("required_for_miame")));
5510 19 Nov 10 nicklas 208       annotationType.setProtocolParameter(Values.getBoolean(request.getParameter("is_protocol_parameter")));
6358 27 Nov 13 nicklas 209       annotationType.setDisableLogOfValues(Values.getBoolean(request.getParameter("disable_log")));
6728 13 Feb 15 nicklas 210       annotationType.setDisableInheritance(Values.getBoolean(request.getParameter("disable_inheritance")));
7244 01 Dec 16 nicklas 211       annotationType.setProjectAnnotations(Values.getBoolean(request.getParameter("project_annotations")));
7616 04 Mar 19 nicklas 212       annotationType.setIdentifier(Values.getBoolean(request.getParameter("identifier")));
5510 19 Nov 10 nicklas 213       if (annotationType.getValueType().canEnumerate())
827 27 Jun 05 nicklas 214       {
5510 19 Nov 10 nicklas 215         annotationType.setEnumeration(!"box".equals(request.getParameter("interface")));
5510 19 Nov 10 nicklas 216       }
5510 19 Nov 10 nicklas 217       
5510 19 Nov 10 nicklas 218       // Options tab
5510 19 Nov 10 nicklas 219       Type valueType = annotationType.getValueType();
5510 19 Nov 10 nicklas 220       if (valueType == Type.INT || valueType == Type.LONG)
5510 19 Nov 10 nicklas 221       {
5510 19 Nov 10 nicklas 222         annotationType.setMinValueLong(Values.getLong(request.getParameter("minValue"), null));
5510 19 Nov 10 nicklas 223         annotationType.setMaxValueLong(Values.getLong(request.getParameter("maxValue"), null));
5510 19 Nov 10 nicklas 224         annotationType.setWidth(Values.getInt(request.getParameter("width"), 40));
5510 19 Nov 10 nicklas 225         if (annotationType.isEnumeration())
1980 14 Feb 06 nicklas 226         {
5510 19 Nov 10 nicklas 227           Object[] values = null;
5510 19 Nov 10 nicklas 228           if (valueType == Type.INT)
5510 19 Nov 10 nicklas 229           {
5510 19 Nov 10 nicklas 230             values = Values.getInt(request.getParameter("values").split("[\n\r]+"));
5510 19 Nov 10 nicklas 231           }
5510 19 Nov 10 nicklas 232           else
5510 19 Nov 10 nicklas 233           {
5510 19 Nov 10 nicklas 234             values = Values.getLong(request.getParameter("values").split("[\n\r]+"));
5510 19 Nov 10 nicklas 235           }
5510 19 Nov 10 nicklas 236           annotationType.setValues(Arrays.asList(values));
5510 19 Nov 10 nicklas 237           annotationType.setDisplayAsList("list".equals(request.getParameter("interface")));
1980 14 Feb 06 nicklas 238         }
5510 19 Nov 10 nicklas 239       }
5510 19 Nov 10 nicklas 240       else if (valueType == Type.FLOAT || valueType == Type.DOUBLE)
5510 19 Nov 10 nicklas 241       {
5510 19 Nov 10 nicklas 242         annotationType.setMinValueDouble(Values.getDouble(request.getParameter("minValue"), null));
5510 19 Nov 10 nicklas 243         annotationType.setMaxValueDouble(Values.getDouble(request.getParameter("maxValue"), null));
5510 19 Nov 10 nicklas 244         annotationType.setWidth(Values.getInt(request.getParameter("width"), 40));
5510 19 Nov 10 nicklas 245         if (annotationType.isEnumeration())
1980 14 Feb 06 nicklas 246         {
5510 19 Nov 10 nicklas 247           Object[] values = null;
5510 19 Nov 10 nicklas 248           if (valueType == Type.FLOAT)
5510 19 Nov 10 nicklas 249           {
5510 19 Nov 10 nicklas 250             values = Values.getFloat(request.getParameter("values").split("[\n\r]+"));
5510 19 Nov 10 nicklas 251           }
5510 19 Nov 10 nicklas 252           else
5510 19 Nov 10 nicklas 253           {
5510 19 Nov 10 nicklas 254             values = Values.getDouble(request.getParameter("values").split("[\n\r]+"));
5510 19 Nov 10 nicklas 255           }
5510 19 Nov 10 nicklas 256           annotationType.setValues(Arrays.asList(values));
5510 19 Nov 10 nicklas 257           annotationType.setDisplayAsList("list".equals(request.getParameter("interface")));
1980 14 Feb 06 nicklas 258         }
827 27 Jun 05 nicklas 259       }
5510 19 Nov 10 nicklas 260       else if (valueType == Type.STRING)
827 27 Jun 05 nicklas 261       {
5510 19 Nov 10 nicklas 262         annotationType.setMaxLength(Values.getInteger(request.getParameter("maxLength"), null));
5510 19 Nov 10 nicklas 263         annotationType.setWidth(Values.getInt(request.getParameter("width"), 40));
5510 19 Nov 10 nicklas 264         if (annotationType.isEnumeration())
1980 14 Feb 06 nicklas 265         {
5510 19 Nov 10 nicklas 266           String[] values = request.getParameter("values").split("[\n\r]+");
5510 19 Nov 10 nicklas 267           annotationType.setValues(Arrays.asList(values));
5510 19 Nov 10 nicklas 268           annotationType.setDisplayAsList("list".equals(request.getParameter("interface")));
1980 14 Feb 06 nicklas 269         }
827 27 Jun 05 nicklas 270       }
5510 19 Nov 10 nicklas 271       else if (valueType == Type.TEXT)
1980 14 Feb 06 nicklas 272       {
5510 19 Nov 10 nicklas 273         annotationType.setWidth(Values.getInt(request.getParameter("width"), 40));
5510 19 Nov 10 nicklas 274         annotationType.setHeight(Values.getInt(request.getParameter("height"), 10));
1980 14 Feb 06 nicklas 275       }
5510 19 Nov 10 nicklas 276       else if (valueType == Type.DATE)
1980 14 Feb 06 nicklas 277       {
5510 19 Nov 10 nicklas 278         annotationType.setWidth(Values.getInt(request.getParameter("width"), 40));
5510 19 Nov 10 nicklas 279         if (annotationType.isEnumeration())
5510 19 Nov 10 nicklas 280         {
5510 19 Nov 10 nicklas 281           Formatter<Date> dateFormatter = FormatterFactory.getDateFormatter(sc);
5510 19 Nov 10 nicklas 282           Date[] values = Values.getDate(request.getParameter("values").split("[\n\r]+"), dateFormatter);
5510 19 Nov 10 nicklas 283           annotationType.setValues(Arrays.asList(values));
5510 19 Nov 10 nicklas 284           annotationType.setDisplayAsList("list".equals(request.getParameter("interface")));
5510 19 Nov 10 nicklas 285         }
1980 14 Feb 06 nicklas 286       }
5510 19 Nov 10 nicklas 287       
5510 19 Nov 10 nicklas 288       // Item types tab
5510 19 Nov 10 nicklas 289       Set<Item> allItems = Metadata.getAnnotatableItems();
5510 19 Nov 10 nicklas 290       String[] enabled = request.getParameterValues("enabled");
5510 19 Nov 10 nicklas 291       Collection<String> enabledItems = enabled != null ? Arrays.asList(enabled) : new ArrayList<String>();
5510 19 Nov 10 nicklas 292       for (Item item : allItems)
836 28 Jun 05 nicklas 293       {
5510 19 Nov 10 nicklas 294         if (enabledItems.contains(item.name()))
5510 19 Nov 10 nicklas 295         {
5510 19 Nov 10 nicklas 296           annotationType.enableForItem(item);
5510 19 Nov 10 nicklas 297         }
5510 19 Nov 10 nicklas 298         else
5510 19 Nov 10 nicklas 299         {
5510 19 Nov 10 nicklas 300           annotationType.disableForItem(item);
5510 19 Nov 10 nicklas 301         }
836 28 Jun 05 nicklas 302       }
5510 19 Nov 10 nicklas 303       
5510 19 Nov 10 nicklas 304       // Units tab
5510 19 Nov 10 nicklas 305       if (valueType.isNumerical())
827 27 Jun 05 nicklas 306       {
5510 19 Nov 10 nicklas 307         int unitId = Values.getInt(request.getParameter("unit_id"), -1);
5510 19 Nov 10 nicklas 308         if (unitId >= 0) // < 0 = denied or unchanged
5510 19 Nov 10 nicklas 309         {
5510 19 Nov 10 nicklas 310           Unit unit = unitId == 0 ? null : Unit.getById(dc, unitId);
5510 19 Nov 10 nicklas 311           annotationType.setDefaultUnit(unit);
5510 19 Nov 10 nicklas 312         }
5510 19 Nov 10 nicklas 313         
6294 13 Jun 13 nicklas 314         String[] removeUnits = Values.getString(request.getParameter("-UNIT")).split(",");
5510 19 Nov 10 nicklas 315         for (int i = 0; i < removeUnits.length; ++i)
5510 19 Nov 10 nicklas 316         {
5510 19 Nov 10 nicklas 317           int uId = Values.getInt(removeUnits[i], -1);
5510 19 Nov 10 nicklas 318           if (uId != -1) annotationType.removeUsableUnit(Unit.getById(dc, uId));
5510 19 Nov 10 nicklas 319         }
5510 19 Nov 10 nicklas 320         
6294 13 Jun 13 nicklas 321         String[] addUnits = Values.getString(request.getParameter("+UNIT")).split(",");
5510 19 Nov 10 nicklas 322         for (int i = 0; i < addUnits.length; ++i)
5510 19 Nov 10 nicklas 323         {
5510 19 Nov 10 nicklas 324           int uId = Values.getInt(addUnits[i], -1);
5510 19 Nov 10 nicklas 325           if (uId != -1) annotationType.addUsableUnit(Unit.getById(dc, uId));
5510 19 Nov 10 nicklas 326         }
827 27 Jun 05 nicklas 327       }
5510 19 Nov 10 nicklas 328       
5510 19 Nov 10 nicklas 329       // Categories tab
6294 13 Jun 13 nicklas 330       String[] removeCategories = Values.getString(request.getParameter("-ANNOTATIONTYPECATEGORY")).split(",");
5510 19 Nov 10 nicklas 331       for (int i = 0; i < removeCategories.length; ++i)
4544 25 Sep 08 nicklas 332       {
5510 19 Nov 10 nicklas 333         int categoryId = Values.getInt(removeCategories[i], -1);
5510 19 Nov 10 nicklas 334         if (categoryId != -1) annotationType.removeCategory(AnnotationTypeCategory.getById(dc, categoryId));
4544 25 Sep 08 nicklas 335       }
4544 25 Sep 08 nicklas 336       
6294 13 Jun 13 nicklas 337       String[] addCategories = Values.getString(request.getParameter("+ANNOTATIONTYPECATEGORY")).split(",");
5510 19 Nov 10 nicklas 338       for (int i = 0; i < addCategories.length; ++i)
4544 25 Sep 08 nicklas 339       {
5510 19 Nov 10 nicklas 340         int categoryId = Values.getInt(addCategories[i], -1);
5510 19 Nov 10 nicklas 341         if (categoryId != -1) annotationType.addCategory(AnnotationTypeCategory.getById(dc, categoryId));
4544 25 Sep 08 nicklas 342       }
4544 25 Sep 08 nicklas 343       
5510 19 Nov 10 nicklas 344       // OnSave extensions
5510 19 Nov 10 nicklas 345       invoker.render(OnSaveRenderer.ON_SAVE);
5510 19 Nov 10 nicklas 346       dc.commit();
5510 19 Nov 10 nicklas 347       invoker.render(OnSaveRenderer.ON_COMMIT);
4544 25 Sep 08 nicklas 348     }
5510 19 Nov 10 nicklas 349     catch (Exception ex)
2515 14 Aug 06 nicklas 350     {
5510 19 Nov 10 nicklas 351       invoker.render(OnSaveRenderer.onRollback(ex));
5510 19 Nov 10 nicklas 352       throw ex;
2515 14 Aug 06 nicklas 353     }
5510 19 Nov 10 nicklas 354     finally
2515 14 Aug 06 nicklas 355     {
5510 19 Nov 10 nicklas 356       cc.removeObject("item");
2515 14 Aug 06 nicklas 357     }
1980 14 Feb 06 nicklas 358   }
1980 14 Feb 06 nicklas 359   else if ("DeleteItem".equals(cmd))
1980 14 Feb 06 nicklas 360   {
1980 14 Feb 06 nicklas 361     // Delete a single item and then return to the view page
7954 12 May 21 nicklas 362     dc = sc.newDbControl(":Delete "+itemType);
1980 14 Feb 06 nicklas 363     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1980 14 Feb 06 nicklas 364     RemovableUtil.setRemoved(dc, itemType, Collections.singleton(cc.getId()), true);
1980 14 Feb 06 nicklas 365     dc.commit();
1980 14 Feb 06 nicklas 366     redirect = viewPage;
1980 14 Feb 06 nicklas 367   }
1980 14 Feb 06 nicklas 368   else if ("DeleteItems".equals(cmd))
1980 14 Feb 06 nicklas 369   {
1980 14 Feb 06 nicklas 370     // Delete all selected items on the list page
7954 12 May 21 nicklas 371     dc = sc.newDbControl(":Delete "+itemType);
1980 14 Feb 06 nicklas 372     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1980 14 Feb 06 nicklas 373     int numTotal = cc.getSelected().size();
1980 14 Feb 06 nicklas 374     int numRemoved = RemovableUtil.setRemoved(dc, itemType, cc.getSelected(), true);
1980 14 Feb 06 nicklas 375     dc.commit();
1980 14 Feb 06 nicklas 376     if (numTotal != numRemoved)
1980 14 Feb 06 nicklas 377     {
1980 14 Feb 06 nicklas 378       message = (numRemoved == 0 ? "No" : "Only "+numRemoved+" of "+numTotal) + " items could be deleted, because you have no DELETE permission";
1980 14 Feb 06 nicklas 379     }
6192 31 Oct 12 nicklas 380     redirect = listPage;
1980 14 Feb 06 nicklas 381   }
1980 14 Feb 06 nicklas 382   else if ("RestoreItem".equals(cmd))
1980 14 Feb 06 nicklas 383   {
1980 14 Feb 06 nicklas 384     // Restore a single item and then return to the view page
7954 12 May 21 nicklas 385     dc = sc.newDbControl(":Restore "+itemType);
1980 14 Feb 06 nicklas 386     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1980 14 Feb 06 nicklas 387     RemovableUtil.setRemoved(dc, itemType, Collections.singleton(cc.getId()), false);
1980 14 Feb 06 nicklas 388     dc.commit();
1980 14 Feb 06 nicklas 389     redirect = viewPage;
1980 14 Feb 06 nicklas 390   }
1980 14 Feb 06 nicklas 391   else if ("RestoreItems".equals(cmd))
1980 14 Feb 06 nicklas 392   {
1980 14 Feb 06 nicklas 393     // Restore all selected items on the list page
7954 12 May 21 nicklas 394     dc = sc.newDbControl(":Restore "+itemType);
1980 14 Feb 06 nicklas 395     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1980 14 Feb 06 nicklas 396     int numTotal = cc.getSelected().size();
1980 14 Feb 06 nicklas 397     int numRemoved = RemovableUtil.setRemoved(dc, itemType, cc.getSelected(), false);
1980 14 Feb 06 nicklas 398     dc.commit();
1980 14 Feb 06 nicklas 399     if (numTotal != numRemoved)
1980 14 Feb 06 nicklas 400     {
2528 15 Aug 06 martin 401       message = (numRemoved == 0 ? "No" : "Only "+numRemoved+" of "+numTotal) + " items could be restored, because you have no WRITE permission";
1980 14 Feb 06 nicklas 402     }
6192 31 Oct 12 nicklas 403     redirect = listPage;
1980 14 Feb 06 nicklas 404   }
1980 14 Feb 06 nicklas 405   else if ("ShareItem".equals(cmd))
1980 14 Feb 06 nicklas 406   {
1980 14 Feb 06 nicklas 407     // Display a popup window for sharing a single item
7954 12 May 21 nicklas 408     dc = sc.newDbControl(":Share "+itemType);
1980 14 Feb 06 nicklas 409     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1980 14 Feb 06 nicklas 410     MultiPermissions permissions = ShareableUtil.getMultiPermissions(dc, itemType, Collections.singleton(cc.getId()));
1980 14 Feb 06 nicklas 411     dc.close();
1980 14 Feb 06 nicklas 412     cc.setObject("MultiPermissions", permissions);
1980 14 Feb 06 nicklas 413     redirect = "../../common/share/share.jsp?ID="+ID+"&item_type="+itemType.name();
1980 14 Feb 06 nicklas 414   }
1980 14 Feb 06 nicklas 415   else if ("ShareItems".equals(cmd))
1980 14 Feb 06 nicklas 416   {
1980 14 Feb 06 nicklas 417     // Display a popup window for sharing all selected items on the list page
7954 12 May 21 nicklas 418     dc = sc.newDbControl(":Share "+itemType);
1980 14 Feb 06 nicklas 419     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1980 14 Feb 06 nicklas 420     MultiPermissions permissions = ShareableUtil.getMultiPermissions(dc, itemType, cc.getSelected());
1980 14 Feb 06 nicklas 421     dc.close();
1980 14 Feb 06 nicklas 422     cc.setObject("MultiPermissions", permissions);
1980 14 Feb 06 nicklas 423     redirect = "../../common/share/share.jsp?ID="+ID+"&item_type="+itemType.name();
1980 14 Feb 06 nicklas 424   }
4573 10 Oct 08 martin 425   else if ("SetOwnerOfItem".equals(cmd))
2921 15 Nov 06 nicklas 426   {
4573 10 Oct 08 martin 427     // Change owner of items selected on a list page
7954 12 May 21 nicklas 428     dc = sc.newDbControl(":Set owner of "+itemType);
2921 15 Nov 06 nicklas 429     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
4587 15 Oct 08 martin 430     OwnedItem item = (OwnedItem)itemType.getById(dc, cc.getId());
4587 15 Oct 08 martin 431     cc.setObject("OwnedItems", Collections.singleton(item));
4573 10 Oct 08 martin 432     redirect = "../../common/ownership/ownership.jsp?ID="+ID+"&item_type="+itemType.name();
2921 15 Nov 06 nicklas 433   }
4573 10 Oct 08 martin 434   else if ("SetOwnerOfItems".equals(cmd))
2921 15 Nov 06 nicklas 435   {
4573 10 Oct 08 martin 436     // Change owner of items selected on a list page
7954 12 May 21 nicklas 437     dc = sc.newDbControl(":Set owner of "+itemType);
2921 15 Nov 06 nicklas 438     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
4587 15 Oct 08 martin 439     Set<OwnedItem> items = new HashSet<OwnedItem>();
4587 15 Oct 08 martin 440     for (Integer id : cc.getSelected())
4587 15 Oct 08 martin 441     {
4587 15 Oct 08 martin 442       if (id != null) items.add((OwnedItem)itemType.getById(dc, id));
4587 15 Oct 08 martin 443     }
4587 15 Oct 08 martin 444     dc.close();
4587 15 Oct 08 martin 445     cc.setObject("OwnedItems", items);
4573 10 Oct 08 martin 446     redirect = "../../common/ownership/ownership.jsp?ID="+ID+"&item_type="+itemType.name();
2921 15 Nov 06 nicklas 447   }
1980 14 Feb 06 nicklas 448   else if ("ExportItems".equals(cmd))
1980 14 Feb 06 nicklas 449   {
1980 14 Feb 06 nicklas 450     // Run an export plugin in a list context
1980 14 Feb 06 nicklas 451     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1980 14 Feb 06 nicklas 452     final ItemQuery<AnnotationType> query = AnnotationType.getQuery(null);
7954 12 May 21 nicklas 453     dc = sc.newDbControl(":Export "+itemType);
7914 23 Feb 21 nicklas 454     JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, GuiContext.list(itemType), null);
7914 23 Feb 21 nicklas 455     cc.configureQuery(dc, query, jspContext, true);
1980 14 Feb 06 nicklas 456     cc.setQuery(query);
4907 28 Apr 09 martin 457     registerExportUtils(cc);
7604 25 Feb 19 nicklas 458     ExtensionsInvoker<ListColumnAction<AnnotationType,?>> listInvoker = ListColumnUtil.useExtensions(jspContext);
7604 25 Feb 19 nicklas 459     listInvoker.render(new ListColumnExportRenderer<AnnotationType>(cc));
6045 03 Apr 12 nicklas 460     dc.close();
1980 14 Feb 06 nicklas 461     redirect = "../../common/export/index.jsp?ID="+ID+"&cmd=SelectPlugin&item_type="+itemType.name()+"&context_type=LIST&title=Export+annotation+types";
1980 14 Feb 06 nicklas 462   }
1980 14 Feb 06 nicklas 463   else if ("ExportItem".equals(cmd))
1980 14 Feb 06 nicklas 464   {
1980 14 Feb 06 nicklas 465     // Run an export plugin in single-item context
1980 14 Feb 06 nicklas 466     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
4907 28 Apr 09 martin 467     registerExportUtils(cc);
1980 14 Feb 06 nicklas 468     redirect = "../../common/export/index.jsp?ID="+ID+"&cmd=SelectPlugin&item_type="+itemType.name()+"&context_type=ITEM&title=Export+annotation+type";
1980 14 Feb 06 nicklas 469   }
1980 14 Feb 06 nicklas 470   else if ("ImportItems".equals(cmd))
1980 14 Feb 06 nicklas 471   {
1980 14 Feb 06 nicklas 472     // Run an import plugin in a list context
1980 14 Feb 06 nicklas 473     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1980 14 Feb 06 nicklas 474     final ItemQuery<AnnotationType> query = AnnotationType.getQuery(null);
7954 12 May 21 nicklas 475     dc = sc.newDbControl(":Import "+itemType);
7914 23 Feb 21 nicklas 476     JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, GuiContext.list(itemType), null);
7914 23 Feb 21 nicklas 477     cc.configureQuery(dc, query, jspContext, true);
5590 16 Mar 11 nicklas 478     dc.close();
1980 14 Feb 06 nicklas 479     cc.setQuery(query);
1980 14 Feb 06 nicklas 480     redirect = "../../common/import/index.jsp?ID="+ID+"&cmd=SelectPlugin&item_type="+itemType.name()+"&context_type=LIST&title=Import+annotation+types";
1980 14 Feb 06 nicklas 481   }
1980 14 Feb 06 nicklas 482   else if ("ImportItem".equals(cmd))
1980 14 Feb 06 nicklas 483   {
1980 14 Feb 06 nicklas 484     // Run an import plugin in single-item context
1980 14 Feb 06 nicklas 485     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1980 14 Feb 06 nicklas 486     redirect = "../../common/import/index.jsp?ID="+ID+"&cmd=SelectPlugin&item_type="+itemType.name()+"&context_type=ITEM&title=Import+annotation+typey";
1980 14 Feb 06 nicklas 487   }
1980 14 Feb 06 nicklas 488   else if ("RunListPlugin".equals(cmd))
1980 14 Feb 06 nicklas 489   {
1980 14 Feb 06 nicklas 490     // Run another plugin in a list context
1980 14 Feb 06 nicklas 491     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1980 14 Feb 06 nicklas 492     final ItemQuery<AnnotationType> query = AnnotationType.getQuery(null);
7954 12 May 21 nicklas 493     dc = sc.newDbControl(":Run plugin "+itemType);
7914 23 Feb 21 nicklas 494     JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, GuiContext.list(itemType), null);
7914 23 Feb 21 nicklas 495     cc.configureQuery(dc, query, jspContext, true);
5590 16 Mar 11 nicklas 496     dc.close();
1980 14 Feb 06 nicklas 497     cc.setQuery(query);
1980 14 Feb 06 nicklas 498     redirect = "../../common/plugin/index.jsp?ID="+ID+"&cmd=SelectPlugin&item_type="+itemType.name()+"&context_type=LIST&main_type=OTHER&title=Run+plugin";
1980 14 Feb 06 nicklas 499   }
1980 14 Feb 06 nicklas 500   else if ("RunPlugin".equals(cmd))
1980 14 Feb 06 nicklas 501   {
1980 14 Feb 06 nicklas 502     // Run another plugin in single-item context
1980 14 Feb 06 nicklas 503     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1980 14 Feb 06 nicklas 504     redirect = "../../common/plugin/index.jsp?ID="+ID+"&cmd=SelectPlugin&item_type="+itemType.name()+"&context_type=ITEM&main_type=OTHER&title=Run+plugin";
1980 14 Feb 06 nicklas 505   }
1980 14 Feb 06 nicklas 506   else
1980 14 Feb 06 nicklas 507   {
1980 14 Feb 06 nicklas 508     throw new WebException("popup", "Invalid command", "The command {1} is not recognised as a valid command.", cmd);
1980 14 Feb 06 nicklas 509   }
827 27 Jun 05 nicklas 510 }
827 27 Jun 05 nicklas 511 finally
827 27 Jun 05 nicklas 512 {
827 27 Jun 05 nicklas 513   if (dc != null) dc.close();
827 27 Jun 05 nicklas 514 }
1980 14 Feb 06 nicklas 515
1980 14 Feb 06 nicklas 516 if (forward != null)
1980 14 Feb 06 nicklas 517 {
6192 31 Oct 12 nicklas 518   sc.setSessionSetting("alert-message", message);
1980 14 Feb 06 nicklas 519   pageContext.forward(forward);
1980 14 Feb 06 nicklas 520 }
1980 14 Feb 06 nicklas 521 else if (redirect != null)
1980 14 Feb 06 nicklas 522 {
6192 31 Oct 12 nicklas 523   sc.setSessionSetting("alert-message", message);
1980 14 Feb 06 nicklas 524   response.sendRedirect(redirect);
1980 14 Feb 06 nicklas 525 }
1980 14 Feb 06 nicklas 526 else if (message == null)
1980 14 Feb 06 nicklas 527 {
1980 14 Feb 06 nicklas 528   response.sendRedirect(root + "common/close_popup.jsp?refresh_opener=1&wait=0");
1980 14 Feb 06 nicklas 529 }
1980 14 Feb 06 nicklas 530 else
1980 14 Feb 06 nicklas 531 {
1980 14 Feb 06 nicklas 532   response.sendRedirect(root + "common/close_popup.jsp?refresh_opener=1&message="+HTML.urlEncode(message));
1980 14 Feb 06 nicklas 533 }
1980 14 Feb 06 nicklas 534 %>
1980 14 Feb 06 nicklas 535

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