www/admin/extravaluetypes/edit_extravaluetype.jsp

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2658 22 Sep 06 nicklas 1 <%-- $Id$
2658 22 Sep 06 nicklas 2   ------------------------------------------------------------------
3675 16 Aug 07 jari 3   Copyright (C) 2006, 2007 Nicklas Nordborg
2658 22 Sep 06 nicklas 4
2658 22 Sep 06 nicklas 5   This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
2658 22 Sep 06 nicklas 6   Available at http://base.thep.lu.se/
2658 22 Sep 06 nicklas 7
2658 22 Sep 06 nicklas 8   BASE is free software; you can redistribute it and/or
2658 22 Sep 06 nicklas 9   modify it under the terms of the GNU General Public License
4476 05 Sep 08 jari 10   as published by the Free Software Foundation; either version 3
2658 22 Sep 06 nicklas 11   of the License, or (at your option) any later version.
2658 22 Sep 06 nicklas 12
2658 22 Sep 06 nicklas 13   BASE is distributed in the hope that it will be useful,
2658 22 Sep 06 nicklas 14   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
2658 22 Sep 06 nicklas 15   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
2658 22 Sep 06 nicklas 16   GNU General Public License for more details.
2658 22 Sep 06 nicklas 17
2658 22 Sep 06 nicklas 18   You should have received a copy of the GNU General Public License
4510 11 Sep 08 jari 19   along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
2658 22 Sep 06 nicklas 20   ------------------------------------------------------------------
2658 22 Sep 06 nicklas 21
2658 22 Sep 06 nicklas 22
2658 22 Sep 06 nicklas 23   @author Nicklas
2658 22 Sep 06 nicklas 24   @version 2.0
2658 22 Sep 06 nicklas 25 --%>
5426 24 Sep 10 nicklas 26 <%@ page pageEncoding="UTF-8" session="false"
2658 22 Sep 06 nicklas 27   import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
2658 22 Sep 06 nicklas 28   import="net.sf.basedb.core.DbControl"
2658 22 Sep 06 nicklas 29   import="net.sf.basedb.core.Item"
2658 22 Sep 06 nicklas 30   import="net.sf.basedb.core.Type"
2658 22 Sep 06 nicklas 31   import="net.sf.basedb.core.ItemContext"
2658 22 Sep 06 nicklas 32   import="net.sf.basedb.core.Permission"
2658 22 Sep 06 nicklas 33   import="net.sf.basedb.core.ExtraValueType"
3558 16 Jul 07 nicklas 34   import="net.sf.basedb.core.Formula"
2733 16 Oct 06 nicklas 35   import="net.sf.basedb.core.Coloring"
2658 22 Sep 06 nicklas 36   import="net.sf.basedb.core.PermissionDeniedException"
2658 22 Sep 06 nicklas 37   import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
2658 22 Sep 06 nicklas 38   import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
2753 20 Oct 06 nicklas 39   import="net.sf.basedb.util.Values"
5510 19 Nov 10 nicklas 40   import="net.sf.basedb.core.plugin.GuiContext"
5510 19 Nov 10 nicklas 41   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.ExtensionsControl"
5510 19 Nov 10 nicklas 42   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.JspContext"
5510 19 Nov 10 nicklas 43   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.edit.EditUtil"
7604 25 Feb 19 nicklas 44   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.tabcontrol.TabAction"
5510 19 Nov 10 nicklas 45   import="net.sf.basedb.util.extensions.ExtensionsInvoker"
2658 22 Sep 06 nicklas 46 %>
2658 22 Sep 06 nicklas 47 <%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
2658 22 Sep 06 nicklas 48 <%@ taglib prefix="t" uri="/WEB-INF/tab.tld" %>
6149 25 Sep 12 nicklas 49 <%@ taglib prefix="ext" uri="/WEB-INF/extensions.tld" %>
2658 22 Sep 06 nicklas 50 <%
2658 22 Sep 06 nicklas 51 final Item itemType = Item.EXTRAVALUETYPE;
2658 22 Sep 06 nicklas 52 final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(pageContext, true);
2658 22 Sep 06 nicklas 53 final ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, null, null);
2658 22 Sep 06 nicklas 54 final int itemId = cc.getId();
2658 22 Sep 06 nicklas 55 final String ID = sc.getId();
2658 22 Sep 06 nicklas 56 final float scale = Base.getScale(sc);
7954 12 May 21 nicklas 57 final DbControl dc = sc.newDbControl(":Edit "+itemType);
2658 22 Sep 06 nicklas 58 try
2658 22 Sep 06 nicklas 59 {
2658 22 Sep 06 nicklas 60   String title = null;
2658 22 Sep 06 nicklas 61   ExtraValueType extraValueType = null;
2733 16 Oct 06 nicklas 62   Coloring coloring = null;
3558 16 Jul 07 nicklas 63   Formula.AverageMethod currentAverageMethod = null;
2658 22 Sep 06 nicklas 64
2658 22 Sep 06 nicklas 65   if (itemId == 0)
2658 22 Sep 06 nicklas 66   {
2658 22 Sep 06 nicklas 67     title = "Create extra value type";
2658 22 Sep 06 nicklas 68     cc.removeObject("item");
3558 16 Jul 07 nicklas 69     currentAverageMethod = Formula.AverageMethod.fromValue(Values.getInt(cc.getPropertyValue("averageMethod"),
3558 16 Jul 07 nicklas 70       Formula.AverageMethod.ARITHMETIC_MEAN.getValue()));
2733 16 Oct 06 nicklas 71     coloring = new Coloring();
2733 16 Oct 06 nicklas 72     coloring.setUsingColors(Values.getBoolean(cc.getPropertyValue("coloring.usingColors")));
2733 16 Oct 06 nicklas 73     coloring.setLogarithmic(Values.getBoolean(cc.getPropertyValue("coloring.logarithmic")));
2733 16 Oct 06 nicklas 74     coloring.setMinValue(Values.getFloat(cc.getPropertyValue("coloring.minValue"), null));
2733 16 Oct 06 nicklas 75     coloring.setMidValue(Values.getFloat(cc.getPropertyValue("coloring.midValue"), null));
2733 16 Oct 06 nicklas 76     coloring.setMaxValue(Values.getFloat(cc.getPropertyValue("coloring.maxValue"), null));
2658 22 Sep 06 nicklas 77   }
2658 22 Sep 06 nicklas 78   else
2658 22 Sep 06 nicklas 79   {
2658 22 Sep 06 nicklas 80     extraValueType = ExtraValueType.getById(dc, itemId);
6296 13 Jun 13 nicklas 81     extraValueType.checkPermission(Permission.WRITE);
3558 16 Jul 07 nicklas 82     currentAverageMethod = extraValueType.getAverageMethod();
2733 16 Oct 06 nicklas 83     coloring = extraValueType.getColoring();
2658 22 Sep 06 nicklas 84     cc.setObject("item", extraValueType);
2658 22 Sep 06 nicklas 85     title = "Edit extra value type -- " + HTML.encodeTags(extraValueType.getName());
2658 22 Sep 06 nicklas 86   }
2658 22 Sep 06 nicklas 87   
5510 19 Nov 10 nicklas 88   JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, GuiContext.item(itemType), extraValueType);
7604 25 Feb 19 nicklas 89   ExtensionsInvoker<TabAction> invoker = EditUtil.useEditExtensions(jspContext);
2658 22 Sep 06 nicklas 90   %>
6296 13 Jun 13 nicklas 91   <base:page type="popup" title="<%=title%>" id="edit-page">
6296 13 Jun 13 nicklas 92   <base:head scripts="tabcontrol-2.js,~extravaluetypes.js" styles="tabcontrol.css">
5510 19 Nov 10 nicklas 93     <ext:scripts context="<%=jspContext%>" />
5510 19 Nov 10 nicklas 94     <ext:stylesheets context="<%=jspContext%>" />
2658 22 Sep 06 nicklas 95   </base:head>
6296 13 Jun 13 nicklas 96   <base:body>
5922 11 Jan 12 nicklas 97     <h1><%=title%> <base:help tabcontrol="settings" /></h1>
6162 10 Oct 12 nicklas 98     <form action="index.jsp?ID=<%=ID%>" method="post" name="extraValueType">
2658 22 Sep 06 nicklas 99     <input type="hidden" name="cmd" value="UpdateItem">
2658 22 Sep 06 nicklas 100
5922 11 Jan 12 nicklas 101     <t:tabcontrol id="settings" 
5922 11 Jan 12 nicklas 102       subclass="content dialogtabcontrol"
5510 19 Nov 10 nicklas 103       position="bottom" remember="<%=extraValueType != null%>"
5510 19 Nov 10 nicklas 104       extensions="<%=invoker%>">
6296 13 Jun 13 nicklas 105     <t:tab id="info" title="Extra value type" 
2658 22 Sep 06 nicklas 106       helpid="extravaluetype.edit">
5922 11 Jan 12 nicklas 107       <table class="fullform input100 smaller">
2658 22 Sep 06 nicklas 108       <tr>
5922 11 Jan 12 nicklas 109         <th>Name</th>
6296 13 Jun 13 nicklas 110         <td><input class="text required auto-init" type="text" name="name" data-auto-init="<%=extraValueType == null ? "focus-select" : "focus" %>"
2658 22 Sep 06 nicklas 111           value="<%=HTML.encodeTags(extraValueType == null ? Values.getString(cc.getPropertyValue("name"), "New extra value type") : extraValueType.getName())%>" 
5922 11 Jan 12 nicklas 112           maxlength="<%=ExtraValueType.MAX_NAME_LENGTH%>"></td>
5922 11 Jan 12 nicklas 113         <td></td>
2658 22 Sep 06 nicklas 114       </tr>
2658 22 Sep 06 nicklas 115       <tr>
5922 11 Jan 12 nicklas 116         <th>External ID</th>
6217 14 Dec 12 nicklas 117         <td><input class="text required" type="text" name="external_id" 
2658 22 Sep 06 nicklas 118           value="<%=HTML.encodeTags(extraValueType == null ? Values.getString(cc.getPropertyValue("externalId")) : extraValueType.getExternalId())%>" 
5922 11 Jan 12 nicklas 119           maxlength="<%=ExtraValueType.MAX_EXTERNAL_ID_LENGTH%>"></td>
5922 11 Jan 12 nicklas 120         <td></td>
2658 22 Sep 06 nicklas 121       </tr>
2658 22 Sep 06 nicklas 122       <tr>
5922 11 Jan 12 nicklas 123         <th>Value type</th>
2658 22 Sep 06 nicklas 124         <td>
2658 22 Sep 06 nicklas 125           <%
2658 22 Sep 06 nicklas 126           if (extraValueType != null)
2658 22 Sep 06 nicklas 127           {
2658 22 Sep 06 nicklas 128             %>
2658 22 Sep 06 nicklas 129             <%=extraValueType.getValueType()%>
2658 22 Sep 06 nicklas 130             <%
2658 22 Sep 06 nicklas 131           }
2658 22 Sep 06 nicklas 132           else
2658 22 Sep 06 nicklas 133           {
2658 22 Sep 06 nicklas 134             int currentValueType = Values.getInt(cc.getPropertyValue("valueType"));
2658 22 Sep 06 nicklas 135             %>
6296 13 Jun 13 nicklas 136             <select name="value_type" class="required unchangeable selectionlist" id="value_type">
2658 22 Sep 06 nicklas 137             <option value="<%=Type.INT.name()%>" 
2658 22 Sep 06 nicklas 138               <%=Type.INT.getValue() == currentValueType ? "selected" : "" %>><%=Type.INT%>
2658 22 Sep 06 nicklas 139             <option value="<%=Type.FLOAT.name()%>"
2658 22 Sep 06 nicklas 140               <%=Type.FLOAT.getValue() == currentValueType ? "selected" : "" %>><%=Type.FLOAT%>
2658 22 Sep 06 nicklas 141             <option value="<%=Type.STRING.name()%>"
2658 22 Sep 06 nicklas 142               <%=Type.STRING.getValue() == currentValueType ? "selected" : "" %>><%=Type.STRING%>
2658 22 Sep 06 nicklas 143             </select>
2658 22 Sep 06 nicklas 144             <%
2658 22 Sep 06 nicklas 145           }
2658 22 Sep 06 nicklas 146           %>
2658 22 Sep 06 nicklas 147         </td>
5922 11 Jan 12 nicklas 148         <td></td>
2658 22 Sep 06 nicklas 149       </tr>
3558 16 Jul 07 nicklas 150       <tr>
5922 11 Jan 12 nicklas 151         <th>Avg. method</th>
3558 16 Jul 07 nicklas 152         <td>
5922 11 Jan 12 nicklas 153           <select name="averageMethod" class="required selectionlist">
3558 16 Jul 07 nicklas 154           <%
3558 16 Jul 07 nicklas 155           for (Formula.AverageMethod method : Formula.AverageMethod.values())
3558 16 Jul 07 nicklas 156           {
3558 16 Jul 07 nicklas 157             String selected = method == currentAverageMethod ? "selected" : "";
3558 16 Jul 07 nicklas 158             %>
3558 16 Jul 07 nicklas 159             <option value="<%=method.name()%>" <%=selected%>><%=HTML.encodeTags(method.toString())%>
3558 16 Jul 07 nicklas 160             <%
3558 16 Jul 07 nicklas 161           }
3558 16 Jul 07 nicklas 162           %>
3558 16 Jul 07 nicklas 163           </select>
3558 16 Jul 07 nicklas 164         </td>
5922 11 Jan 12 nicklas 165         <td></td>
3558 16 Jul 07 nicklas 166       </tr>
2733 16 Oct 06 nicklas 167       <%
2733 16 Oct 06 nicklas 168       if (extraValueType == null || extraValueType.getValueType().isNumerical())
2733 16 Oct 06 nicklas 169       {
2733 16 Oct 06 nicklas 170         %>
2733 16 Oct 06 nicklas 171         <tr>
5922 11 Jan 12 nicklas 172           <th><label for="use_colors">Use colors</label></th>
2733 16 Oct 06 nicklas 173           <td>
5922 11 Jan 12 nicklas 174             <input type="checkbox" name="use_colors" value="1" id="use_colors"
6296 13 Jun 13 nicklas 175               <%=coloring.isUsingColors() ? "checked" : "" %>>
5922 11 Jan 12 nicklas 176           </td>
5922 11 Jan 12 nicklas 177           <td></td>
5922 11 Jan 12 nicklas 178         </tr>
5922 11 Jan 12 nicklas 179         <tr>
5922 11 Jan 12 nicklas 180           <th class="subprompt">Min value</th>
5922 11 Jan 12 nicklas 181           <td>
6296 13 Jun 13 nicklas 182             <input type="text" class="text" name="min_value" id="min_value"
2733 16 Oct 06 nicklas 183                value="<%=Values.formatNumber(coloring.getMinValue(), -1)%>"
6296 13 Jun 13 nicklas 184                maxlength="6"  style="width: 6em;">
5922 11 Jan 12 nicklas 185             Mid value
6296 13 Jun 13 nicklas 186             <input type="text" class="text" name="mid_value" id="mid_value"
2733 16 Oct 06 nicklas 187                value="<%=Values.formatNumber(coloring.getMidValue(), -1)%>"
6296 13 Jun 13 nicklas 188                maxlength="6"  style="width: 6em;">
5922 11 Jan 12 nicklas 189             Max value
6296 13 Jun 13 nicklas 190             <input type="text" class="text" name="max_value" id="max_value"
2733 16 Oct 06 nicklas 191                value="<%=Values.formatNumber(coloring.getMaxValue(), -1)%>"
6296 13 Jun 13 nicklas 192                maxlength="6" style="width: 6em;">
5922 11 Jan 12 nicklas 193           </td>
5922 11 Jan 12 nicklas 194           <td></td>
5922 11 Jan 12 nicklas 195         </tr>
5922 11 Jan 12 nicklas 196         <tr>
5922 11 Jan 12 nicklas 197           <th class="subprompt"><label for="logarithmic">Logarithmic</label></th>
5922 11 Jan 12 nicklas 198           <td>
5922 11 Jan 12 nicklas 199             <input type="checkbox" name="logarithmic" value="1" id="logarithmic"
2733 16 Oct 06 nicklas 200               <%=coloring.isLogarithmic() ? "checked" : "" %>>
2733 16 Oct 06 nicklas 201           </td>
5922 11 Jan 12 nicklas 202           <td></td>
2733 16 Oct 06 nicklas 203         </tr>
2733 16 Oct 06 nicklas 204         <%
2733 16 Oct 06 nicklas 205       }
2733 16 Oct 06 nicklas 206       %>
5922 11 Jan 12 nicklas 207       <tr class="dynamic">
5922 11 Jan 12 nicklas 208         <th>Description</th>
5922 11 Jan 12 nicklas 209         <td>
6217 14 Dec 12 nicklas 210           <textarea class="text" rows="6" name="description" id="description"
2658 22 Sep 06 nicklas 211             ><%=HTML.encodeTags(extraValueType == null ? cc.getPropertyValue("description") : extraValueType.getDescription())%></textarea>
2658 22 Sep 06 nicklas 212         </td>
5922 11 Jan 12 nicklas 213         <td style="width: 20px;">
6215 13 Dec 12 nicklas 214           <base:zoom textarea="description" title="Description" />
5922 11 Jan 12 nicklas 215         </td>
2658 22 Sep 06 nicklas 216       </tr>
2658 22 Sep 06 nicklas 217       </table>
2658 22 Sep 06 nicklas 218     </t:tab>
2658 22 Sep 06 nicklas 219     </t:tabcontrol>
5922 11 Jan 12 nicklas 220     </form>
5922 11 Jan 12 nicklas 221     
5922 11 Jan 12 nicklas 222     <div class="legend">
5946 03 Feb 12 nicklas 223       <base:icon image="required.png" />= required information
5922 11 Jan 12 nicklas 224       <%if (extraValueType == null) {%><br>
5967 16 Feb 12 nicklas 225         <base:icon image="unchangeable.png" />= can't be changed later
5922 11 Jan 12 nicklas 226       <%}%>
5922 11 Jan 12 nicklas 227     </div>
2658 22 Sep 06 nicklas 228
5922 11 Jan 12 nicklas 229     <base:buttongroup subclass="dialogbuttons">
6296 13 Jun 13 nicklas 230       <base:button id="btnSave" title="Save" />
6296 13 Jun 13 nicklas 231       <base:button id="close" title="Cancel" />
5922 11 Jan 12 nicklas 232     </base:buttongroup>
2658 22 Sep 06 nicklas 233   </base:body>
2658 22 Sep 06 nicklas 234   </base:page>
2658 22 Sep 06 nicklas 235   <%
2658 22 Sep 06 nicklas 236 }
2658 22 Sep 06 nicklas 237 finally
2658 22 Sep 06 nicklas 238 {
2658 22 Sep 06 nicklas 239   if (dc != null) dc.close();
2658 22 Sep 06 nicklas 240 }
2658 22 Sep 06 nicklas 241 %>

Generated on Sat Oct  7 02:42:48 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)