www/biomaterials/bioplates/events/view_event.jsp

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
5525 06 Dec 10 nicklas 1 <%-- $Id$
5525 06 Dec 10 nicklas 2   ------------------------------------------------------------------
5525 06 Dec 10 nicklas 3   Copyright (C) 2010 Nicklas Nordborg
5525 06 Dec 10 nicklas 4
5525 06 Dec 10 nicklas 5   This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
5525 06 Dec 10 nicklas 6   Available at http://base.thep.lu.se/
5525 06 Dec 10 nicklas 7
5525 06 Dec 10 nicklas 8   BASE is free software; you can redistribute it and/or
5525 06 Dec 10 nicklas 9   modify it under the terms of the GNU General Public License
5525 06 Dec 10 nicklas 10   as published by the Free Software Foundation; either version 3
5525 06 Dec 10 nicklas 11   of the License, or (at your option) any later version.
5525 06 Dec 10 nicklas 12
5525 06 Dec 10 nicklas 13   BASE is distributed in the hope that it will be useful,
5525 06 Dec 10 nicklas 14   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
5525 06 Dec 10 nicklas 15   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
5525 06 Dec 10 nicklas 16   GNU General Public License for more details.
5525 06 Dec 10 nicklas 17
5525 06 Dec 10 nicklas 18   You should have received a copy of the GNU General Public License
5525 06 Dec 10 nicklas 19   along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
5525 06 Dec 10 nicklas 20   ------------------------------------------------------------------
5525 06 Dec 10 nicklas 21
5525 06 Dec 10 nicklas 22   @author Nicklas
5525 06 Dec 10 nicklas 23 --%>
5525 06 Dec 10 nicklas 24 <%@ page pageEncoding="UTF-8" session="false"
5525 06 Dec 10 nicklas 25   import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
5525 06 Dec 10 nicklas 26   import="net.sf.basedb.core.DbControl"
5525 06 Dec 10 nicklas 27   import="net.sf.basedb.core.SystemItems"
5525 06 Dec 10 nicklas 28   import="net.sf.basedb.core.Item"
5525 06 Dec 10 nicklas 29   import="net.sf.basedb.core.ItemContext"
5525 06 Dec 10 nicklas 30   import="net.sf.basedb.core.Permission"
5525 06 Dec 10 nicklas 31   import="net.sf.basedb.core.CommonItem"
5525 06 Dec 10 nicklas 32   import="net.sf.basedb.core.BioPlate"
5525 06 Dec 10 nicklas 33   import="net.sf.basedb.core.BioPlateEvent"
5525 06 Dec 10 nicklas 34   import="net.sf.basedb.core.BioPlateEventParticipant"
5525 06 Dec 10 nicklas 35   import="net.sf.basedb.core.BioMaterialEvent"
5525 06 Dec 10 nicklas 36   import="net.sf.basedb.core.MeasuredBioMaterial"
5642 26 May 11 nicklas 37   import="net.sf.basedb.core.PhysicalBioAssay"
5525 06 Dec 10 nicklas 38   import="net.sf.basedb.core.Protocol"
5525 06 Dec 10 nicklas 39   import="net.sf.basedb.core.Hardware"
5525 06 Dec 10 nicklas 40   import="net.sf.basedb.core.PermissionDeniedException"
5525 06 Dec 10 nicklas 41   import="net.sf.basedb.core.ItemQuery"
5525 06 Dec 10 nicklas 42   import="net.sf.basedb.core.ItemResultList"
5525 06 Dec 10 nicklas 43   import="net.sf.basedb.core.Include"
5525 06 Dec 10 nicklas 44   import="net.sf.basedb.core.PluginDefinition"
5525 06 Dec 10 nicklas 45   import="net.sf.basedb.core.query.Orders"
5525 06 Dec 10 nicklas 46   import="net.sf.basedb.core.query.Hql"
5525 06 Dec 10 nicklas 47   import="net.sf.basedb.core.plugin.GuiContext"
5525 06 Dec 10 nicklas 48   import="net.sf.basedb.core.plugin.Plugin"
5525 06 Dec 10 nicklas 49   import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
5525 06 Dec 10 nicklas 50   import="net.sf.basedb.clients.web.PermissionUtil"
5525 06 Dec 10 nicklas 51   import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
5525 06 Dec 10 nicklas 52   import="net.sf.basedb.util.Values"
5525 06 Dec 10 nicklas 53   import="net.sf.basedb.util.formatter.Formatter"
5525 06 Dec 10 nicklas 54   import="net.sf.basedb.clients.web.formatter.FormatterFactory"
5525 06 Dec 10 nicklas 55   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.ExtensionsControl"
5525 06 Dec 10 nicklas 56   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.JspContext"
5525 06 Dec 10 nicklas 57   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.renderer.PrefixSuffixRenderer"
7604 25 Feb 19 nicklas 58   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.toolbar.ButtonAction" 
5525 06 Dec 10 nicklas 59   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.toolbar.ToolbarUtil"
5525 06 Dec 10 nicklas 60   import="net.sf.basedb.util.extensions.ExtensionsInvoker"
5525 06 Dec 10 nicklas 61   import="java.util.Date"
5525 06 Dec 10 nicklas 62   import="java.util.Map"
5525 06 Dec 10 nicklas 63   import="java.util.Set"
5525 06 Dec 10 nicklas 64 %>
5525 06 Dec 10 nicklas 65 <%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
5525 06 Dec 10 nicklas 66 <%@ taglib prefix="t" uri="/WEB-INF/tab.tld" %>
5525 06 Dec 10 nicklas 67 <%@ taglib prefix="tbl" uri="/WEB-INF/table.tld" %>
5525 06 Dec 10 nicklas 68 <%@ taglib prefix="p" uri="/WEB-INF/path.tld" %>
5525 06 Dec 10 nicklas 69 <%@ taglib prefix="ext" uri="/WEB-INF/extensions.tld" %>
5525 06 Dec 10 nicklas 70 <%!
5525 06 Dec 10 nicklas 71   private static final Item itemType = Item.BIOPLATEEVENT;
5525 06 Dec 10 nicklas 72   private static final GuiContext guiContext = new GuiContext(itemType, GuiContext.Type.ITEM);
5525 06 Dec 10 nicklas 73 %>
5525 06 Dec 10 nicklas 74 <%
5525 06 Dec 10 nicklas 75 int bioPlateId = Values.getInt(request.getParameter("bioplate_id"));
5525 06 Dec 10 nicklas 76 final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(pageContext, true);
5525 06 Dec 10 nicklas 77 final String ID = sc.getId();
5525 06 Dec 10 nicklas 78 final ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, null, null);
5525 06 Dec 10 nicklas 79 final int itemId = cc.getId();
6261 27 Mar 13 nicklas 80 final String tab = Values.getStringOrNull(request.getParameter("tab"));
5525 06 Dec 10 nicklas 81 final float scale = Base.getScale(sc);
7954 12 May 21 nicklas 82 final DbControl dc = sc.newDbControl(":View "+itemType);
5525 06 Dec 10 nicklas 83 try
5525 06 Dec 10 nicklas 84 {
5525 06 Dec 10 nicklas 85   Formatter<Date> dateFormatter = FormatterFactory.getDateFormatter(sc);
5525 06 Dec 10 nicklas 86   Map<Plugin.MainType, Integer> pluginCount = PluginDefinition.countPlugins(dc, guiContext);
5525 06 Dec 10 nicklas 87
5525 06 Dec 10 nicklas 88   String title = null;
5525 06 Dec 10 nicklas 89   BioPlateEvent event = BioPlateEvent.getById(dc, itemId);
5525 06 Dec 10 nicklas 90   
5525 06 Dec 10 nicklas 91   // Load bioplates participating in this event
5525 06 Dec 10 nicklas 92   ItemQuery<BioPlateEventParticipant> participantQuery = event.getParticipants();
5525 06 Dec 10 nicklas 93   participantQuery.join(Hql.innerJoin(null, "bioPlate", "bpl", true));
5525 06 Dec 10 nicklas 94   participantQuery.include(Include.ALL);
5525 06 Dec 10 nicklas 95   participantQuery.order(Orders.asc(Hql.property("role")));
5525 06 Dec 10 nicklas 96   participantQuery.order(Orders.asc(Hql.property("index")));
5525 06 Dec 10 nicklas 97   participantQuery.order(Orders.asc(Hql.property("bpl", "name")));
5525 06 Dec 10 nicklas 98   ItemResultList<BioPlateEventParticipant> participants = participantQuery.list(dc);
5525 06 Dec 10 nicklas 99   
5525 06 Dec 10 nicklas 100   if (bioPlateId == 0)
5525 06 Dec 10 nicklas 101   {
5525 06 Dec 10 nicklas 102     for (BioPlateEventParticipant participant : participants)
5525 06 Dec 10 nicklas 103     {
5525 06 Dec 10 nicklas 104       try
5525 06 Dec 10 nicklas 105       {
5525 06 Dec 10 nicklas 106         bioPlateId = participant.getBioPlate().getId();
5525 06 Dec 10 nicklas 107         break;
5525 06 Dec 10 nicklas 108       }
5525 06 Dec 10 nicklas 109       catch (RuntimeException ex)
5525 06 Dec 10 nicklas 110       {}
5525 06 Dec 10 nicklas 111     }
5525 06 Dec 10 nicklas 112   }
5525 06 Dec 10 nicklas 113   BioPlate bioPlate = bioPlateId == 0 ? null : BioPlate.getById(dc, bioPlateId);
5525 06 Dec 10 nicklas 114   
5525 06 Dec 10 nicklas 115   final boolean usePermission = event.hasPermission(Permission.USE);
5525 06 Dec 10 nicklas 116   final boolean writePermission = event.hasPermission(Permission.WRITE);
5525 06 Dec 10 nicklas 117   final boolean deletePermission = event.hasPermission(Permission.DELETE);
5525 06 Dec 10 nicklas 118   final boolean sharePermission = event.hasPermission(Permission.SET_PERMISSION);
5525 06 Dec 10 nicklas 119   final boolean setOwnerPermission = event.hasPermission(Permission.SET_OWNER);
5525 06 Dec 10 nicklas 120   final boolean isRemoved = event.isRemoved();
5525 06 Dec 10 nicklas 121   final boolean isUsed = isRemoved && event.isUsed();
5525 06 Dec 10 nicklas 122   final boolean deletePermanentlyPermission = deletePermission && !isUsed;
5525 06 Dec 10 nicklas 123   final boolean isOwner = event.isOwner();
5525 06 Dec 10 nicklas 124   JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, guiContext, event);
7604 25 Feb 19 nicklas 125   ExtensionsInvoker<ButtonAction> invoker = ToolbarUtil.useExtensions(jspContext);
5525 06 Dec 10 nicklas 126   %>
6261 27 Mar 13 nicklas 127   <base:page title="<%=title%>" id="view-page">
6261 27 Mar 13 nicklas 128   <base:head scripts="table.js,tabcontrol-2.js,~events.js" styles="toolbar.css,table.css,headertabcontrol.css,path.css">
5525 06 Dec 10 nicklas 129     <ext:scripts context="<%=jspContext%>" />
5525 06 Dec 10 nicklas 130     <ext:stylesheets context="<%=jspContext%>" />
5525 06 Dec 10 nicklas 131   </base:head>
5525 06 Dec 10 nicklas 132   <base:body>
5525 06 Dec 10 nicklas 133     <%
5525 06 Dec 10 nicklas 134     if (bioPlate != null)
5525 06 Dec 10 nicklas 135     {
5525 06 Dec 10 nicklas 136       %>
5937 27 Jan 12 nicklas 137       <p:path><p:pathelement 
5937 27 Jan 12 nicklas 138         title="Bioplates" href="<%="../index.jsp?ID="+ID%>" /><p:pathelement 
5937 27 Jan 12 nicklas 139         title="<%=HTML.encodeTags(bioPlate.getName())%>" 
6145 21 Sep 12 nicklas 140           href="<%="index.jsp?ID="+ID+"&amp;bioplate_id="+bioPlateId%>" /><p:pathelement 
5937 27 Jan 12 nicklas 141         title="<%=HTML.encodeTags(event.getName())%>" /></p:path>
5525 06 Dec 10 nicklas 142       <%
5525 06 Dec 10 nicklas 143     }
5525 06 Dec 10 nicklas 144     else
5525 06 Dec 10 nicklas 145     {
5525 06 Dec 10 nicklas 146       %>
5937 27 Jan 12 nicklas 147       <p:path><p:pathelement 
5937 27 Jan 12 nicklas 148         title="Bioplate events" /><p:pathelement 
5937 27 Jan 12 nicklas 149         title="<%=HTML.encodeTags(event.getName())%>" /></p:path>
5525 06 Dec 10 nicklas 150       <%
5525 06 Dec 10 nicklas 151     }
5525 06 Dec 10 nicklas 152     %>
6261 27 Mar 13 nicklas 153     <div id="page-data" data-item-id="<%=itemId%>"></div>
6261 27 Mar 13 nicklas 154     
5937 27 Jan 12 nicklas 155     <t:tabcontrol id="main"
5937 27 Jan 12 nicklas 156       subclass="content mastertabcontrol"
6261 27 Mar 13 nicklas 157       active="<%=tab %>">
5525 06 Dec 10 nicklas 158     <t:tab id="properties" title="Properties">
5937 27 Jan 12 nicklas 159       <div>
5937 27 Jan 12 nicklas 160       <table class="fullform bottomborder">
5937 27 Jan 12 nicklas 161       <tr>
5937 27 Jan 12 nicklas 162         <th class="itemstatus">
5525 06 Dec 10 nicklas 163           <base:icon 
5946 03 Feb 12 nicklas 164             image="shared.png" 
5937 27 Jan 12 nicklas 165             visible="<%=event.isShared()%>"
5937 27 Jan 12 nicklas 166             tooltip="This item is shared to other users, groups and/or projects"
5937 27 Jan 12 nicklas 167           />
5937 27 Jan 12 nicklas 168           <base:icon 
6261 27 Mar 13 nicklas 169             id="btnDeletePermanently"
6261 27 Mar 13 nicklas 170             data-extra-url="<%="&bioplate_id=" + bioPlateId%>"
5946 03 Feb 12 nicklas 171             image="deleted.png"
5937 27 Jan 12 nicklas 172             tooltip="This item has been flagged for deletion. Click to delete it now."
5937 27 Jan 12 nicklas 173             enabled="<%=deletePermanentlyPermission %>"
5937 27 Jan 12 nicklas 174             visible="<%=isRemoved%>" 
5937 27 Jan 12 nicklas 175           />
6261 27 Mar 13 nicklas 176           <base:icon 
6261 27 Mar 13 nicklas 177             id="btnUsingItems"
6261 27 Mar 13 nicklas 178             image="used.png" 
5937 27 Jan 12 nicklas 179             tooltip="This item is used by other items and can't be permanently deleted. Show the items that are using this one"
5937 27 Jan 12 nicklas 180             visible="<%=isRemoved && isUsed%>" />
5937 27 Jan 12 nicklas 181         </th>
6145 21 Sep 12 nicklas 182         <td style="padding: 0px;">
6605 18 Nov 14 nicklas 183           <tbl:toolbar subclass="bottomborder bg-filled-50">
5937 27 Jan 12 nicklas 184             <tbl:button 
6261 27 Mar 13 nicklas 185               id="btnEdit"
5942 01 Feb 12 nicklas 186               disabled="<%=!writePermission%>" 
5945 02 Feb 12 nicklas 187               image="edit.png" 
5937 27 Jan 12 nicklas 188               title="Edit&hellip;" 
5937 27 Jan 12 nicklas 189               tooltip="<%=writePermission ? "Edit this event" : "You do not have permission to edit this event"%>" 
5937 27 Jan 12 nicklas 190             />
5937 27 Jan 12 nicklas 191             <tbl:button 
6261 27 Mar 13 nicklas 192               id="btnDelete"
6261 27 Mar 13 nicklas 193               data-extra-url="<%="&bioplate_id=" + bioPlateId%>"
5942 01 Feb 12 nicklas 194               disabled="<%=!deletePermission%>" 
5946 03 Feb 12 nicklas 195               image="delete.png" 
5937 27 Jan 12 nicklas 196               title="Delete"
5937 27 Jan 12 nicklas 197               visible="<%=!event.isRemoved()%>"
5937 27 Jan 12 nicklas 198               tooltip="<%=deletePermission ? "Delete this event" : "You do not have permission to delete this event"%>" 
5937 27 Jan 12 nicklas 199             />
5937 27 Jan 12 nicklas 200             <tbl:button 
6261 27 Mar 13 nicklas 201               id="btnRestore"
6261 27 Mar 13 nicklas 202               data-extra-url="<%="&bioplate_id=" + bioPlateId%>"
5942 01 Feb 12 nicklas 203               disabled="<%=!writePermission%>" 
5946 03 Feb 12 nicklas 204               image="restore.png" 
5937 27 Jan 12 nicklas 205               title="Restore"
5937 27 Jan 12 nicklas 206               visible="<%=event.isRemoved()%>"
5937 27 Jan 12 nicklas 207               tooltip="<%=writePermission ? "Restore this event" : "You do not have permission to restore this event"%>" 
5937 27 Jan 12 nicklas 208             />
5937 27 Jan 12 nicklas 209             <tbl:button 
6261 27 Mar 13 nicklas 210               id="btnShare"
5942 01 Feb 12 nicklas 211               disabled="<%=!sharePermission%>"
5945 02 Feb 12 nicklas 212               image="share.png"
5937 27 Jan 12 nicklas 213               title="Share&hellip;" 
5937 27 Jan 12 nicklas 214               tooltip="<%=sharePermission ? "Share this event to other user, groups and projects" : "You do not have permission to share this event"%>"
5937 27 Jan 12 nicklas 215             />
5937 27 Jan 12 nicklas 216             <tbl:button 
6261 27 Mar 13 nicklas 217               id="btnSetOwner"
5942 01 Feb 12 nicklas 218               disabled="<%=!setOwnerPermission%>"
5937 27 Jan 12 nicklas 219               image="take_ownership.png"
5937 27 Jan 12 nicklas 220               title="Set owner&hellip;"
5937 27 Jan 12 nicklas 221               tooltip="<%=setOwnerPermission ? "Change owner of this item" : "You do not have permission to change ownership of this item"%>"
5937 27 Jan 12 nicklas 222             />
5937 27 Jan 12 nicklas 223             <tbl:button 
6261 27 Mar 13 nicklas 224               id="btnImport"
5946 03 Feb 12 nicklas 225               image="import.png" 
6261 27 Mar 13 nicklas 226               data-plugin-type="IMPORT"  
5937 27 Jan 12 nicklas 227               title="Import&hellip;" 
5937 27 Jan 12 nicklas 228               tooltip="Import data" 
5937 27 Jan 12 nicklas 229               visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.IMPORT)%>"
5937 27 Jan 12 nicklas 230             />
5937 27 Jan 12 nicklas 231             <tbl:button 
6261 27 Mar 13 nicklas 232               id="btnExport"
6261 27 Mar 13 nicklas 233               image="export.png"
6261 27 Mar 13 nicklas 234               data-plugin-type="EXPORT" 
5937 27 Jan 12 nicklas 235               title="Export&hellip;" 
5937 27 Jan 12 nicklas 236               tooltip="Export data" 
5937 27 Jan 12 nicklas 237               visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.EXPORT)%>"
5937 27 Jan 12 nicklas 238             />
5937 27 Jan 12 nicklas 239             <tbl:button 
6261 27 Mar 13 nicklas 240               id="btnRunPlugin"
6261 27 Mar 13 nicklas 241               image="runplugin.png"  
6261 27 Mar 13 nicklas 242               data-plugin-type="OTHER" 
5937 27 Jan 12 nicklas 243               title="Run plugin&hellip;" 
5937 27 Jan 12 nicklas 244               tooltip="Run a plugin" 
5937 27 Jan 12 nicklas 245               visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.OTHER)%>"
5937 27 Jan 12 nicklas 246             />
5937 27 Jan 12 nicklas 247             <ext:render extensions="<%=invoker%>" context="<%=jspContext%>" 
7604 25 Feb 19 nicklas 248               wrapper="<%=new PrefixSuffixRenderer<ButtonAction>(jspContext, "<td>", "</td>") %>"/>
5937 27 Jan 12 nicklas 249           </tbl:toolbar>
5937 27 Jan 12 nicklas 250         </td>
5937 27 Jan 12 nicklas 251       </tr>
5525 06 Dec 10 nicklas 252       <tr>
5937 27 Jan 12 nicklas 253         <th>Name</th>
5525 06 Dec 10 nicklas 254         <td><%=HTML.encodeTags(event.getName())%></td>
5525 06 Dec 10 nicklas 255       </tr>
5525 06 Dec 10 nicklas 256       <tr>
5937 27 Jan 12 nicklas 257         <th>Event date</th>
5525 06 Dec 10 nicklas 258         <td><%=dateFormatter.format(event.getEventDate())%></td>
5525 06 Dec 10 nicklas 259       </tr>
5525 06 Dec 10 nicklas 260       <tr>
5937 27 Jan 12 nicklas 261         <th>Registration date</th>
5525 06 Dec 10 nicklas 262         <td><%=dateFormatter.format(event.getEntryDate())%></td>
5525 06 Dec 10 nicklas 263       </tr>
5525 06 Dec 10 nicklas 264       <tr>
5937 27 Jan 12 nicklas 265         <th>Event type</th>
5525 06 Dec 10 nicklas 266         <td><base:propertyvalue item="<%=event%>" property="eventType" /></td>
5525 06 Dec 10 nicklas 267       </tr>
5525 06 Dec 10 nicklas 268       <tr>
5937 27 Jan 12 nicklas 269         <th>Protocol</th>
5525 06 Dec 10 nicklas 270         <td><base:propertyvalue item="<%=event%>" property="protocol"/></td>
5525 06 Dec 10 nicklas 271       </tr>
5525 06 Dec 10 nicklas 272       <tr>
6997 03 Nov 15 nicklas 273         <th>Kit</th>
6997 03 Nov 15 nicklas 274         <td><base:propertyvalue item="<%=event%>" property="kit"/></td>
6997 03 Nov 15 nicklas 275       </tr>
6997 03 Nov 15 nicklas 276       <tr>
5937 27 Jan 12 nicklas 277         <th>Hardware</th>
5525 06 Dec 10 nicklas 278         <td><base:propertyvalue item="<%=event%>" property="hardware"/></td>
5525 06 Dec 10 nicklas 279       </tr>
5525 06 Dec 10 nicklas 280       <tr>
5937 27 Jan 12 nicklas 281         <th>Owner</th>
5525 06 Dec 10 nicklas 282         <td><base:propertyvalue item="<%=event%>" property="owner" /></td>
5525 06 Dec 10 nicklas 283       </tr>
5525 06 Dec 10 nicklas 284       <tr>
5937 27 Jan 12 nicklas 285         <th>Description</th>
5525 06 Dec 10 nicklas 286         <td><%=HTML.niceFormat(event.getDescription())%></td>
5525 06 Dec 10 nicklas 287       </tr>
5525 06 Dec 10 nicklas 288       </table>
5937 27 Jan 12 nicklas 289       </div>
5525 06 Dec 10 nicklas 290       
5937 27 Jan 12 nicklas 291       <base:section 
5937 27 Jan 12 nicklas 292         id="participantSection" 
5937 27 Jan 12 nicklas 293         title="<%="Participating plates (" + participants.size() + ")"%>"
5937 27 Jan 12 nicklas 294         context="<%=cc%>"
5937 27 Jan 12 nicklas 295         >
5525 06 Dec 10 nicklas 296         <%
5937 27 Jan 12 nicklas 297         if (participants.size() == 0)
5937 27 Jan 12 nicklas 298         {
5937 27 Jan 12 nicklas 299           %>
5937 27 Jan 12 nicklas 300           <div class="messagecontainer note">
5937 27 Jan 12 nicklas 301           No plates are participating in this event
5937 27 Jan 12 nicklas 302           (or, you don't have permission to view them).
5937 27 Jan 12 nicklas 303           </div>
5937 27 Jan 12 nicklas 304           <%
5937 27 Jan 12 nicklas 305         }
5937 27 Jan 12 nicklas 306         else
5937 27 Jan 12 nicklas 307         {
5937 27 Jan 12 nicklas 308           %>
5525 06 Dec 10 nicklas 309           <tbl:table
5525 06 Dec 10 nicklas 310             id="participants"
5525 06 Dec 10 nicklas 311             columns="all"
5525 06 Dec 10 nicklas 312             >
5525 06 Dec 10 nicklas 313             <tbl:columndef
5525 06 Dec 10 nicklas 314               id="bioplate"
5525 06 Dec 10 nicklas 315               title="Bioplate"
5525 06 Dec 10 nicklas 316             />
5525 06 Dec 10 nicklas 317             <tbl:columndef 
5525 06 Dec 10 nicklas 318               id="role"
5525 06 Dec 10 nicklas 319               title="Role"
5525 06 Dec 10 nicklas 320             />
5525 06 Dec 10 nicklas 321             <tbl:columndef
5525 06 Dec 10 nicklas 322               id="description"
5525 06 Dec 10 nicklas 323               title="Description"
5525 06 Dec 10 nicklas 324             />
5525 06 Dec 10 nicklas 325             <tbl:data>
5937 27 Jan 12 nicklas 326               <tbl:headers>
5937 27 Jan 12 nicklas 327                 <tbl:headerrow>
5937 27 Jan 12 nicklas 328                   <tbl:columnheaders />
5937 27 Jan 12 nicklas 329                 </tbl:headerrow>
5937 27 Jan 12 nicklas 330               </tbl:headers>
5525 06 Dec 10 nicklas 331               <tbl:rows>
5525 06 Dec 10 nicklas 332                 <%
5525 06 Dec 10 nicklas 333                 for (BioPlateEventParticipant participant : participants)
5525 06 Dec 10 nicklas 334                 {
5525 06 Dec 10 nicklas 335                   BioPlate plate = null;
5525 06 Dec 10 nicklas 336                   try
5525 06 Dec 10 nicklas 337                   {
5525 06 Dec 10 nicklas 338                     plate = participant.getBioPlate();
5525 06 Dec 10 nicklas 339                   }
5525 06 Dec 10 nicklas 340                   catch (PermissionDeniedException ex)
5525 06 Dec 10 nicklas 341                   {}
5525 06 Dec 10 nicklas 342                   %>
5525 06 Dec 10 nicklas 343                   <tbl:row>
5525 06 Dec 10 nicklas 344                     <tbl:cell column="bioplate"><base:icon 
5946 03 Feb 12 nicklas 345                       image="deleted.png" 
5525 06 Dec 10 nicklas 346                       tooltip="This item has been scheduled for deletion" 
5525 06 Dec 10 nicklas 347                       visible="<%=plate != null && plate.isRemoved()%>"
5525 06 Dec 10 nicklas 348                     /><%=Base.getLinkedName(ID, plate, true, true)%></tbl:cell>
5525 06 Dec 10 nicklas 349                     <tbl:cell column="role"><%=HTML.encodeTags(participant.getRole())%> [<%=participant.getIndex()%>]</tbl:cell>
5525 06 Dec 10 nicklas 350                     <tbl:cell column="description"><%=plate == null ? "" : HTML.encodeTags(plate.getDescription())%></tbl:cell>
5525 06 Dec 10 nicklas 351                   </tbl:row>
5525 06 Dec 10 nicklas 352                   <%
5525 06 Dec 10 nicklas 353                 }
5525 06 Dec 10 nicklas 354                 %>
5525 06 Dec 10 nicklas 355               </tbl:rows>
5525 06 Dec 10 nicklas 356             </tbl:data>
5525 06 Dec 10 nicklas 357           </tbl:table>
5937 27 Jan 12 nicklas 358           <%
5937 27 Jan 12 nicklas 359         }
5937 27 Jan 12 nicklas 360         %>
5937 27 Jan 12 nicklas 361       </base:section>
5937 27 Jan 12 nicklas 362       <%
5525 06 Dec 10 nicklas 363       // Biomaterial events linked with this event
5525 06 Dec 10 nicklas 364       ItemQuery<BioMaterialEvent> eventQuery = event.getBioMaterialEvents();
5525 06 Dec 10 nicklas 365       eventQuery.join(Hql.leftJoin("bioMaterial", "bm"));
5642 26 May 11 nicklas 366       eventQuery.join(Hql.leftJoin("physicalBioAssay", "pba"));
5525 06 Dec 10 nicklas 367       eventQuery.include(Include.ALL);
5525 06 Dec 10 nicklas 368       eventQuery.order(Orders.asc(Hql.property("bm", "name")));
5642 26 May 11 nicklas 369       eventQuery.order(Orders.asc(Hql.property("pba", "name")));
5525 06 Dec 10 nicklas 370       ItemResultList<BioMaterialEvent> events = eventQuery.list(dc);
5937 27 Jan 12 nicklas 371       %>
5937 27 Jan 12 nicklas 372       <base:section 
5937 27 Jan 12 nicklas 373         id="eventsSection" 
5937 27 Jan 12 nicklas 374         title="<%="Related biomaterial events (" + events.size() + ")"%>"
5937 27 Jan 12 nicklas 375         context="<%=cc%>"
5937 27 Jan 12 nicklas 376         >
5525 06 Dec 10 nicklas 377         <%
5937 27 Jan 12 nicklas 378         if (events.size() == 0)
5937 27 Jan 12 nicklas 379         {
5937 27 Jan 12 nicklas 380           %>
5937 27 Jan 12 nicklas 381           <div class="messagecontainer note">
5937 27 Jan 12 nicklas 382           No biomaterial events are linked to this event
5937 27 Jan 12 nicklas 383           (or, you don't have permission to view them).
5937 27 Jan 12 nicklas 384           </div>
5937 27 Jan 12 nicklas 385           <%
5937 27 Jan 12 nicklas 386         }
5937 27 Jan 12 nicklas 387         else
5937 27 Jan 12 nicklas 388         {
5937 27 Jan 12 nicklas 389           %>
5525 06 Dec 10 nicklas 390           <tbl:table
5525 06 Dec 10 nicklas 391             id="events"
5525 06 Dec 10 nicklas 392             columns="all"
5525 06 Dec 10 nicklas 393             >
5525 06 Dec 10 nicklas 394             <tbl:columndef
5525 06 Dec 10 nicklas 395               id="item"
5642 26 May 11 nicklas 396               title="Biomaterial/Bioassay"
5525 06 Dec 10 nicklas 397             />
5525 06 Dec 10 nicklas 398             <tbl:columndef
5525 06 Dec 10 nicklas 399               id="bioplate"
5525 06 Dec 10 nicklas 400               title="Bioplate"
5525 06 Dec 10 nicklas 401             />
5525 06 Dec 10 nicklas 402             <tbl:columndef
5525 06 Dec 10 nicklas 403               id="eventType"
5525 06 Dec 10 nicklas 404               title="Event type"
5525 06 Dec 10 nicklas 405             />
5525 06 Dec 10 nicklas 406             <tbl:columndef
5525 06 Dec 10 nicklas 407               id="comment"
5525 06 Dec 10 nicklas 408               title="Comment"
5525 06 Dec 10 nicklas 409             />
5525 06 Dec 10 nicklas 410             <tbl:data>
5949 08 Feb 12 nicklas 411               <tbl:headers>
5949 08 Feb 12 nicklas 412                 <tbl:headerrow>
5949 08 Feb 12 nicklas 413                   <tbl:columnheaders />
5949 08 Feb 12 nicklas 414                 </tbl:headerrow>
5949 08 Feb 12 nicklas 415               </tbl:headers>
5525 06 Dec 10 nicklas 416               <tbl:rows>
5525 06 Dec 10 nicklas 417                 <%
5525 06 Dec 10 nicklas 418                 for (BioMaterialEvent bmEvent : events)
5525 06 Dec 10 nicklas 419                 {
5525 06 Dec 10 nicklas 420                   BioMaterialEvent.Type eventType = bmEvent.getEventType();
5525 06 Dec 10 nicklas 421                   CommonItem item = null;
5525 06 Dec 10 nicklas 422                   try
5525 06 Dec 10 nicklas 423                   {
5642 26 May 11 nicklas 424                     if (eventType == BioMaterialEvent.Type.BIOASSAY)
5525 06 Dec 10 nicklas 425                     {
5642 26 May 11 nicklas 426                       item = bmEvent.getPhysicalBioAssay();
5525 06 Dec 10 nicklas 427                     }
5525 06 Dec 10 nicklas 428                     else
5525 06 Dec 10 nicklas 429                     {
5525 06 Dec 10 nicklas 430                       item = bmEvent.getBioMaterial();
5525 06 Dec 10 nicklas 431                     }
5525 06 Dec 10 nicklas 432                   }
5525 06 Dec 10 nicklas 433                   catch (PermissionDeniedException ex)
5525 06 Dec 10 nicklas 434                   {}      
5525 06 Dec 10 nicklas 435                   %>
5525 06 Dec 10 nicklas 436                   <tbl:row>
5525 06 Dec 10 nicklas 437                     <tbl:cell column="item"><base:icon 
5946 03 Feb 12 nicklas 438                       image="deleted.png" 
5525 06 Dec 10 nicklas 439                       tooltip="This item has been scheduled for deletion" 
5525 06 Dec 10 nicklas 440                       visible="<%=item != null && item.isRemoved()%>"
5525 06 Dec 10 nicklas 441                     /><%=Base.getLinkedName(ID, item, true, true)%><%=item != null ? " (" +item.getType().toString() + ")" : "" %></tbl:cell>
5525 06 Dec 10 nicklas 442                     <tbl:cell column="bioplate"><base:propertyvalue item="<%=bmEvent%>" property="bioPlateEventParticipant.bioPlate" /></tbl:cell>
5525 06 Dec 10 nicklas 443                     <tbl:cell column="eventType"><%=eventType%></tbl:cell>
5525 06 Dec 10 nicklas 444                     <tbl:cell column="comment"><%=HTML.encodeTags(bmEvent.getComment())%></tbl:cell>
5525 06 Dec 10 nicklas 445                   </tbl:row>
5525 06 Dec 10 nicklas 446                   <%
5525 06 Dec 10 nicklas 447                 }
5525 06 Dec 10 nicklas 448                 %>
5525 06 Dec 10 nicklas 449               </tbl:rows>
5525 06 Dec 10 nicklas 450             </tbl:data>
5525 06 Dec 10 nicklas 451           </tbl:table>
5937 27 Jan 12 nicklas 452           <%
5937 27 Jan 12 nicklas 453         }
5937 27 Jan 12 nicklas 454         %>
5937 27 Jan 12 nicklas 455       </base:section>
5525 06 Dec 10 nicklas 456       <jsp:include page="../../../common/anytoany/list_anytoany.jsp">
5525 06 Dec 10 nicklas 457         <jsp:param name="ID" value="<%=ID%>" />
5525 06 Dec 10 nicklas 458         <jsp:param name="item_type" value="<%=itemType.name()%>" />
5525 06 Dec 10 nicklas 459         <jsp:param name="item_id" value="<%=itemId%>" />
5525 06 Dec 10 nicklas 460         <jsp:param name="title" value="Other items related to this event" />
5525 06 Dec 10 nicklas 461       </jsp:include>
5525 06 Dec 10 nicklas 462       </t:tab>
5525 06 Dec 10 nicklas 463       </t:tabcontrol>
5525 06 Dec 10 nicklas 464
5525 06 Dec 10 nicklas 465   </base:body>
5525 06 Dec 10 nicklas 466   </base:page>
5525 06 Dec 10 nicklas 467   <%
5525 06 Dec 10 nicklas 468 }
5525 06 Dec 10 nicklas 469 finally
5525 06 Dec 10 nicklas 470 {
5525 06 Dec 10 nicklas 471   if (dc != null) dc.close();
5525 06 Dec 10 nicklas 472 }
5525 06 Dec 10 nicklas 473
5525 06 Dec 10 nicklas 474 %>

Generated on Sat Oct  7 02:43:59 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)