www/biomaterials/biosources/biosources.js

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
7604 25 Feb 19 nicklas 1 /* $Id $
7604 25 Feb 19 nicklas 2   ------------------------------------------------------------------
7604 25 Feb 19 nicklas 3   Copyright (C) 2013 Nicklas Nordborg
7604 25 Feb 19 nicklas 4
7604 25 Feb 19 nicklas 5   This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
7604 25 Feb 19 nicklas 6   Available at http://base.thep.lu.se/
7604 25 Feb 19 nicklas 7
7604 25 Feb 19 nicklas 8   BASE is free software; you can redistribute it and/or
7604 25 Feb 19 nicklas 9   modify it under the terms of the GNU General Public License
7604 25 Feb 19 nicklas 10   as published by the Free Software Foundation; either version 3
7604 25 Feb 19 nicklas 11   of the License, or (at your option) any later version.
7604 25 Feb 19 nicklas 12
7604 25 Feb 19 nicklas 13   BASE is distributed in the hope that it will be useful,
7604 25 Feb 19 nicklas 14   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
7604 25 Feb 19 nicklas 15   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
7604 25 Feb 19 nicklas 16   GNU General Public License for more details.
7604 25 Feb 19 nicklas 17
7604 25 Feb 19 nicklas 18   You should have received a copy of the GNU General Public License
7604 25 Feb 19 nicklas 19   along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
7604 25 Feb 19 nicklas 20   ------------------------------------------------------------------
7604 25 Feb 19 nicklas 21
7604 25 Feb 19 nicklas 22   @author Nicklas
7604 25 Feb 19 nicklas 23 */
7604 25 Feb 19 nicklas 24 'use strict';
7604 25 Feb 19 nicklas 25
7604 25 Feb 19 nicklas 26 var BioSources = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 27 {
7604 25 Feb 19 nicklas 28   var biosources = {};
7604 25 Feb 19 nicklas 29   
7604 25 Feb 19 nicklas 30   /**
7604 25 Feb 19 nicklas 31     Initialize the page.
7604 25 Feb 19 nicklas 32   */
7604 25 Feb 19 nicklas 33   biosources.initPage = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 34   {
7604 25 Feb 19 nicklas 35     var pageId = Doc.getPageId();
7604 25 Feb 19 nicklas 36     if (pageId == 'edit-page')
7604 25 Feb 19 nicklas 37     {
7604 25 Feb 19 nicklas 38       // Save + Close buttons
7604 25 Feb 19 nicklas 39       Buttons.addClickHandler('btnSave', biosources.save);
7604 25 Feb 19 nicklas 40       Buttons.addClickHandler('close', App.closeWindow);
7604 25 Feb 19 nicklas 41
7604 25 Feb 19 nicklas 42       // Tab validation
7604 25 Feb 19 nicklas 43       TabControl.addTabActivateListener('settings.annotations', biosources.loadAnnotationsFrame);
7604 25 Feb 19 nicklas 44       TabControl.addTabValidator('settings.info', biosources.validateBioSource);
7604 25 Feb 19 nicklas 45     }
7604 25 Feb 19 nicklas 46     else if (pageId == 'view-page')
7604 25 Feb 19 nicklas 47     {
7604 25 Feb 19 nicklas 48       var itemId = Data.get('page-data', 'item-id');
7604 25 Feb 19 nicklas 49       var attributes = {'item-type': 'BIOSOURCE', 'item-id': itemId};
7604 25 Feb 19 nicklas 50       Buttons.addClickHandler('btnEdit', Buttons.editItem, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 51       Buttons.addClickHandler('btnDelete', Buttons.deleteItem, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 52       Buttons.addClickHandler('btnRestore', Buttons.restoreItem, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 53       Buttons.addClickHandler('btnUsingItems', Buttons.showUsingItems, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 54       Buttons.addClickHandler('btnDeletePermanently', Buttons.deleteItemPermanently, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 55       Buttons.addClickHandler('btnShare', Buttons.shareItem, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 56       Buttons.addClickHandler('btnSetOwner', Buttons.setOwner, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 57       Buttons.addClickHandler('btnNewSample', biosources.newSample, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 58       Buttons.addClickHandler('btnExport', Buttons.runPlugin, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 59       Buttons.addClickHandler('btnImport', Buttons.runPlugin, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 60       Buttons.addClickHandler('btnRunPlugin', Buttons.runPlugin, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 61       
7604 25 Feb 19 nicklas 62       TabControl.addTabActivateListener('main.annotations', AnnotationsList.loadOnce);
7604 25 Feb 19 nicklas 63       TabControl.addTabActivateListener('main.overview', Overview.loadOnce);
7604 25 Feb 19 nicklas 64       TabControl.addTabActivateListener('main.history', History.loadOnce);
7604 25 Feb 19 nicklas 65     }
7604 25 Feb 19 nicklas 66     else if (pageId == 'list-page')
7604 25 Feb 19 nicklas 67     {
7604 25 Feb 19 nicklas 68       var attributes = {'item-type': 'BIOSOURCE'};
7604 25 Feb 19 nicklas 69       var tableAttributes = {'table-id': 'biosources'};
7604 25 Feb 19 nicklas 70       Buttons.addClickHandler('btnNewItem', Buttons.newItem, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 71       Buttons.addClickHandler('btnDeleteItems', Buttons.deleteItems, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 72       Buttons.addClickHandler('btnRestoreItems', Buttons.restoreItems, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 73       Buttons.addClickHandler('btnShareItems', Buttons.shareItems, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 74       Buttons.addClickHandler('btnSetOwner', Buttons.setOwnerOfItems, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 75       Buttons.addClickHandler('btnColumns', Buttons.configureColumns, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 76       Buttons.addClickHandler('btnExport', Buttons.runListPlugin, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 77       Buttons.addClickHandler('btnImport', Buttons.runListPlugin, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 78       Buttons.addClickHandler('btnRunPlugin', Buttons.runListPlugin, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 79       Buttons.addClickHandler('btnNewItemList', biosources.newItemListOnClick);
7813 19 May 20 nicklas 80       Buttons.addClickHandler('btnAddToItemList', biosources.addToItemListOnClick);
7604 25 Feb 19 nicklas 81       
7604 25 Feb 19 nicklas 82       Buttons.addClickHandler('close', App.closeWindow);
7604 25 Feb 19 nicklas 83       Buttons.addClickHandler('btnOk', Buttons.returnSelected, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 84     }
7604 25 Feb 19 nicklas 85   }
7604 25 Feb 19 nicklas 86
7604 25 Feb 19 nicklas 87   // Add event handlers to the 'new sample' icons
7604 25 Feb 19 nicklas 88   biosources.initElements = function(element, autoInit)
7604 25 Feb 19 nicklas 89   {
7604 25 Feb 19 nicklas 90     if (autoInit == 'new-sample')
7604 25 Feb 19 nicklas 91     {
7604 25 Feb 19 nicklas 92       Buttons.addClickHandler(element, biosources.newSample);
7604 25 Feb 19 nicklas 93     }
7604 25 Feb 19 nicklas 94   }
7604 25 Feb 19 nicklas 95
7604 25 Feb 19 nicklas 96   /*
7604 25 Feb 19 nicklas 97     Create a new sample with the current biosource as the parent
7604 25 Feb 19 nicklas 98    */
7604 25 Feb 19 nicklas 99   biosources.newSample = function(event)
7604 25 Feb 19 nicklas 100   {
7604 25 Feb 19 nicklas 101     var biosurceId = Data.int(event.currentTarget, 'item-id');
7604 25 Feb 19 nicklas 102     Items.newItem('SAMPLE', '&biosource_id='+biosurceId);
7604 25 Feb 19 nicklas 103   }
7604 25 Feb 19 nicklas 104   
7604 25 Feb 19 nicklas 105   // Create a new item list with the selected biosources as members
7604 25 Feb 19 nicklas 106   biosources.newItemListOnClick = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 107   {
7604 25 Feb 19 nicklas 108     var controller = Items.getController('ITEMLIST');
7604 25 Feb 19 nicklas 109     Table.submitToPopup('biosources', 'CreateItemList', controller.width, controller.height);
7604 25 Feb 19 nicklas 110   }
7813 19 May 20 nicklas 111
7813 19 May 20 nicklas 112   // Add selected biosources to an existing item list
7813 19 May 20 nicklas 113   biosources.addToItemListOnClick = function()
7813 19 May 20 nicklas 114   {
7813 19 May 20 nicklas 115     Table.submitToPopup('biosources', 'AddItemsToList', 450, 300);
7813 19 May 20 nicklas 116   }
7604 25 Feb 19 nicklas 117   
7604 25 Feb 19 nicklas 118   biosources.validateBioSource = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 119   {
7604 25 Feb 19 nicklas 120     var frm = document.forms['biosource'];
7604 25 Feb 19 nicklas 121     if (Strings.trim(frm.name.value) == '')
7604 25 Feb 19 nicklas 122     {
7604 25 Feb 19 nicklas 123       Forms.showNotification(frm.name, 'You must enter a name');
7604 25 Feb 19 nicklas 124       return false;
7604 25 Feb 19 nicklas 125     }
7604 25 Feb 19 nicklas 126     return true;
7604 25 Feb 19 nicklas 127   }
7604 25 Feb 19 nicklas 128   
7604 25 Feb 19 nicklas 129   biosources.save = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 130   {
7604 25 Feb 19 nicklas 131     var frm = document.forms['biosource'];
7604 25 Feb 19 nicklas 132     if (TabControl.validateActiveTab('settings'))
7604 25 Feb 19 nicklas 133     {
7604 25 Feb 19 nicklas 134       Annotations.saveModifiedAnnotationsToForm(frm);
7604 25 Feb 19 nicklas 135       frm.submit();
7604 25 Feb 19 nicklas 136     }
7604 25 Feb 19 nicklas 137   }
7604 25 Feb 19 nicklas 138   
7604 25 Feb 19 nicklas 139   biosources.loadAnnotationsFrame = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 140   {
7604 25 Feb 19 nicklas 141     Annotations.autoLoadEditFrame(0, ItemSubtype.getSubtypeId('subtype_id'));
7604 25 Feb 19 nicklas 142   }
7604 25 Feb 19 nicklas 143   
7604 25 Feb 19 nicklas 144   return biosources;
7604 25 Feb 19 nicklas 145 }();
7604 25 Feb 19 nicklas 146
7604 25 Feb 19 nicklas 147 Doc.addElementInitializer(BioSources.initElements);
7604 25 Feb 19 nicklas 148 Doc.onLoad(BioSources.initPage);

Generated on Sat Oct  7 02:44:09 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)