www/biomaterials/events/index.jsp

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3675 16 Aug 07 jari 3   Copyright (C) 2005 Nicklas Nordborg
5425 23 Sep 10 nicklas 4   Copyright (C) 2006 Jari Häkkinen, Nicklas Nordborg, Martin Svensson
949 18 Jul 05 nicklas 5
2304 22 May 06 jari 6   This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
2304 22 May 06 jari 7   Available at http://base.thep.lu.se/
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949 18 Jul 05 nicklas 21   ------------------------------------------------------------------
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949 18 Jul 05 nicklas 23   @author Nicklas
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949 18 Jul 05 nicklas 61 <%!
7982 14 Jun 21 nicklas 62   private static final ItemContext defaultContext = Base.createDefaultContext("entryDate", "type,bioPlateEvent,entryDate,eventDate,quantity,protocol,comment", null);
1872 31 Jan 06 nicklas 63   private static final Item itemType = Item.BIOMATERIALEVENT;
949 18 Jul 05 nicklas 64 %>
949 18 Jul 05 nicklas 65 <%
1872 31 Jan 06 nicklas 66 final int bioMaterialId = Values.getInt(request.getParameter("biomaterial_id"));
1872 31 Jan 06 nicklas 67 final Item bioMaterialType = Item.valueOf(request.getParameter("biomaterial_type"));
1872 31 Jan 06 nicklas 68
1872 31 Jan 06 nicklas 69 final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(pageContext, true);
949 18 Jul 05 nicklas 70 final String ID = sc.getId();
1872 31 Jan 06 nicklas 71 final String cmd = request.getParameter("cmd");
1872 31 Jan 06 nicklas 72 final String root = request.getContextPath()+"/";
1872 31 Jan 06 nicklas 73 final String mode = request.getParameter("mode");
1872 31 Jan 06 nicklas 74 final String callback = request.getParameter("callback");
1872 31 Jan 06 nicklas 75 final String itemId = request.getParameter("item_id");
1872 31 Jan 06 nicklas 76 final String listPage = "list_events.jsp?ID="+ID
1872 31 Jan 06 nicklas 77   +"&biomaterial_id="+bioMaterialId
1872 31 Jan 06 nicklas 78   +"&biomaterial_type="+bioMaterialType.name()
1872 31 Jan 06 nicklas 79   +(mode == null ? "" : "&mode="+mode)
1872 31 Jan 06 nicklas 80   +(callback == null ? "" : "&callback="+callback)
1872 31 Jan 06 nicklas 81   +(itemId == null ? "" : "&item_id="+itemId);
1872 31 Jan 06 nicklas 82 final String viewPage = "view_event.jsp?ID="+ID+"&biomaterial_id="+bioMaterialId+"&biomaterial_type="+bioMaterialType.name();
1872 31 Jan 06 nicklas 83 final String editPage = "edit_event.jsp?ID="+ID+"&biomaterial_id="+bioMaterialId+"&biomaterial_type="+bioMaterialType.name();
949 18 Jul 05 nicklas 84
1872 31 Jan 06 nicklas 85 String forward = null;
1872 31 Jan 06 nicklas 86 String redirect = null;
1872 31 Jan 06 nicklas 87 String message = null;
1872 31 Jan 06 nicklas 88 DbControl dc = null;
1872 31 Jan 06 nicklas 89
949 18 Jul 05 nicklas 90 try
949 18 Jul 05 nicklas 91 {
1872 31 Jan 06 nicklas 92   if (cmd == null || "List".equals(cmd))
1872 31 Jan 06 nicklas 93   {
1872 31 Jan 06 nicklas 94     // Display the list page without updatinging the current context
2811 26 Oct 06 nicklas 95     Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, null, defaultContext, true);
1872 31 Jan 06 nicklas 96     redirect = listPage;
1872 31 Jan 06 nicklas 97   }
1872 31 Jan 06 nicklas 98   else if ("UpdateContext".equals(cmd))
1872 31 Jan 06 nicklas 99   {
1872 31 Jan 06 nicklas 100     // Display the list page after updating the current context from the request parameters
1872 31 Jan 06 nicklas 101     Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1872 31 Jan 06 nicklas 102     redirect = listPage;
1872 31 Jan 06 nicklas 103   }
1872 31 Jan 06 nicklas 104   else if ("LoadContext".equals(cmd))
1872 31 Jan 06 nicklas 105   {
1872 31 Jan 06 nicklas 106     // Display the list page after loading a saved context
1872 31 Jan 06 nicklas 107     int contextId = Values.getInt(request.getParameter("context"));
1872 31 Jan 06 nicklas 108     Base.loadContext(sc, contextId, defaultContext);
1872 31 Jan 06 nicklas 109     redirect = listPage;
1872 31 Jan 06 nicklas 110   }
1872 31 Jan 06 nicklas 111   else if ("ViewItem".equals(cmd))
1872 31 Jan 06 nicklas 112   {
1872 31 Jan 06 nicklas 113     // Display the view page for a single item 
1872 31 Jan 06 nicklas 114     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1872 31 Jan 06 nicklas 115     forward = viewPage;
1872 31 Jan 06 nicklas 116   }
1872 31 Jan 06 nicklas 117   else if ("EditItem".equals(cmd))
1872 31 Jan 06 nicklas 118   {
1872 31 Jan 06 nicklas 119     // Display the edit page for a single item (should be opened in a popup)
1872 31 Jan 06 nicklas 120     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1872 31 Jan 06 nicklas 121     redirect = editPage;
1872 31 Jan 06 nicklas 122   }
1872 31 Jan 06 nicklas 123   else if ("NewItem".equals(cmd))
1872 31 Jan 06 nicklas 124   {
1872 31 Jan 06 nicklas 125     // Display the edit page for a new item (should be opened in a popup)
1872 31 Jan 06 nicklas 126     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1872 31 Jan 06 nicklas 127     cc.setId(0);
1872 31 Jan 06 nicklas 128     redirect = editPage;
1872 31 Jan 06 nicklas 129   }
1872 31 Jan 06 nicklas 130   else if ("UpdateItem".equals(cmd))
1872 31 Jan 06 nicklas 131   {
1872 31 Jan 06 nicklas 132     // Update the properties on an item (will close the popup)
1872 31 Jan 06 nicklas 133     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, null, defaultContext);
2597 25 Aug 06 nicklas 134     final int maxRecent = Base.getMaxRecent(sc);
7954 12 May 21 nicklas 135     dc = sc.newDbControl(":Edit "+itemType);
7605 26 Feb 19 nicklas 136     BioMaterialEvent event = cc.getObject("item");
1872 31 Jan 06 nicklas 137     if (event == null)
949 18 Jul 05 nicklas 138     {
1872 31 Jan 06 nicklas 139       MeasuredBioMaterial bioMaterial = (MeasuredBioMaterial)bioMaterialType.getById(dc, bioMaterialId);
1872 31 Jan 06 nicklas 140       event = BioMaterialEvent.getNew(dc, bioMaterial);
1872 31 Jan 06 nicklas 141       message = "Event created";
1872 31 Jan 06 nicklas 142       dc.saveItem(event);
949 18 Jul 05 nicklas 143     }
1872 31 Jan 06 nicklas 144     else
949 18 Jul 05 nicklas 145     {
5060 19 Aug 09 nicklas 146       dc.reattachItem(event, false);
1872 31 Jan 06 nicklas 147       message = "Event updated";
949 18 Jul 05 nicklas 148     }
5492 16 Nov 10 nicklas 149     JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, GuiContext.item(Item.BIOMATERIALEVENT), event);
7604 25 Feb 19 nicklas 150     ExtensionsInvoker<OnSaveAction> invoker = EditUtil.useOnSaveExtensions(jspContext);
5492 16 Nov 10 nicklas 151     try
949 18 Jul 05 nicklas 152     {
5492 16 Nov 10 nicklas 153       Formatter<Date> dateFormatter = FormatterFactory.getDateFormatter(sc);
5492 16 Nov 10 nicklas 154       event.setComment(Values.getStringOrNull(request.getParameter("comment")));
5492 16 Nov 10 nicklas 155       event.setEventDate(dateFormatter.parseString(Values.getStringOrNull(request.getParameter("event_date"))));
5492 16 Nov 10 nicklas 156       event.setUsedQuantity(Values.getFloat(request.getParameter("used_quantity"), null));
5492 16 Nov 10 nicklas 157       int protocolId = Values.getInt(request.getParameter("protocol_id"), -1);
5492 16 Nov 10 nicklas 158       if (protocolId >= 0) // < 0 = denied or unchanged
5492 16 Nov 10 nicklas 159       {
5492 16 Nov 10 nicklas 160         Protocol pt = protocolId == 0 ? null : Protocol.getById(dc, protocolId);
5492 16 Nov 10 nicklas 161         event.setProtocol(pt);
7703 11 Apr 19 nicklas 162         cc.setRecent(Item.PROTOCOL, pt, maxRecent);
5492 16 Nov 10 nicklas 163       }
6993 03 Nov 15 nicklas 164       int kitId = Values.getInt(request.getParameter("kit_id"), -1);
6993 03 Nov 15 nicklas 165       if (kitId >= 0) // < 0 = denied or unchanged
6993 03 Nov 15 nicklas 166       {
6993 03 Nov 15 nicklas 167         Kit kit = kitId == 0 ? null : Kit.getById(dc, kitId);
6993 03 Nov 15 nicklas 168         event.setKit(kit);
7703 11 Apr 19 nicklas 169         cc.setRecent(Item.KIT, kit, maxRecent);
6993 03 Nov 15 nicklas 170       }
5492 16 Nov 10 nicklas 171
5492 16 Nov 10 nicklas 172       // OnSave extensions
5492 16 Nov 10 nicklas 173       invoker.render(OnSaveRenderer.ON_SAVE);
5492 16 Nov 10 nicklas 174       dc.commit();
5492 16 Nov 10 nicklas 175       invoker.render(OnSaveRenderer.ON_COMMIT);
949 18 Jul 05 nicklas 176     }
5492 16 Nov 10 nicklas 177     catch (Exception ex)
5492 16 Nov 10 nicklas 178     {
5492 16 Nov 10 nicklas 179       invoker.render(OnSaveRenderer.onRollback(ex));
5492 16 Nov 10 nicklas 180       throw ex;
5492 16 Nov 10 nicklas 181     }
5492 16 Nov 10 nicklas 182     finally
5492 16 Nov 10 nicklas 183     {
5492 16 Nov 10 nicklas 184       cc.removeObject("item");
5492 16 Nov 10 nicklas 185     }
1872 31 Jan 06 nicklas 186   }
1872 31 Jan 06 nicklas 187   else if ("DeleteItem".equals(cmd))
1872 31 Jan 06 nicklas 188   {
1872 31 Jan 06 nicklas 189     // Delete a single item and then return to the view page
7954 12 May 21 nicklas 190     dc = sc.newDbControl(":Delete "+itemType);
1872 31 Jan 06 nicklas 191     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1872 31 Jan 06 nicklas 192     RemovableUtil.delete(dc, itemType, Collections.singleton(cc.getId()));
1872 31 Jan 06 nicklas 193     dc.commit();
1872 31 Jan 06 nicklas 194     redirect = listPage;
1872 31 Jan 06 nicklas 195   }
1872 31 Jan 06 nicklas 196   else if ("DeleteItems".equals(cmd))
1872 31 Jan 06 nicklas 197   {
1872 31 Jan 06 nicklas 198     // Delete all selected items on the list page
7954 12 May 21 nicklas 199     dc = sc.newDbControl(":Delete "+itemType);
1872 31 Jan 06 nicklas 200     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1872 31 Jan 06 nicklas 201     int numTotal = cc.getSelected().size();
1872 31 Jan 06 nicklas 202     int numDeleted = RemovableUtil.delete(dc, itemType, cc.getSelected());
1872 31 Jan 06 nicklas 203     dc.commit();
1872 31 Jan 06 nicklas 204     if (numTotal != numDeleted)
949 18 Jul 05 nicklas 205     {
1872 31 Jan 06 nicklas 206       message = (numDeleted == 0 ? "No" : "Only "+numDeleted+" of "+numTotal) + " items could be deleted, because you have no DELETE permission";
949 18 Jul 05 nicklas 207     }
6192 31 Oct 12 nicklas 208     redirect = listPage;
1872 31 Jan 06 nicklas 209   }
1872 31 Jan 06 nicklas 210   else if ("ExportItems".equals(cmd))
1872 31 Jan 06 nicklas 211   {
1872 31 Jan 06 nicklas 212     // Run an export plugin in a list context
1872 31 Jan 06 nicklas 213     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
7954 12 May 21 nicklas 214     dc = sc.newDbControl(":Export "+itemType);
1872 31 Jan 06 nicklas 215     MeasuredBioMaterial bioMaterial = (MeasuredBioMaterial)bioMaterialType.getById(dc, bioMaterialId);
1872 31 Jan 06 nicklas 216     final ItemQuery<BioMaterialEvent> query = BioMaterialEvent.getQuery(bioMaterial);
7914 23 Feb 21 nicklas 217     JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, GuiContext.list(itemType), null);
7914 23 Feb 21 nicklas 218     cc.configureQuery(dc, query, jspContext, true);
6038 29 Mar 12 nicklas 219     cc.setQuery(query);
7604 25 Feb 19 nicklas 220     ExtensionsInvoker<ListColumnAction<BioMaterialEvent,?>> listInvoker = ListColumnUtil.useExtensions(jspContext);
7604 25 Feb 19 nicklas 221     listInvoker.render(new ListColumnExportRenderer<BioMaterialEvent>(cc));
5590 16 Mar 11 nicklas 222     dc.close();
1872 31 Jan 06 nicklas 223     redirect = "../../common/export/index.jsp?ID="+ID+"&cmd=SelectPlugin&item_type="+itemType.name()+"&context_type=LIST&title=Export+events";
1872 31 Jan 06 nicklas 224   }
1872 31 Jan 06 nicklas 225   else if ("ExportItem".equals(cmd))
1872 31 Jan 06 nicklas 226   {
1872 31 Jan 06 nicklas 227     // Run an export plugin in single-item context
1872 31 Jan 06 nicklas 228     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1872 31 Jan 06 nicklas 229     redirect = "../../common/export/index.jsp?ID="+ID+"&cmd=SelectPlugin&item_type="+itemType.name()+"&context_type=ITEM&title=Export+event";
1872 31 Jan 06 nicklas 230   }
1872 31 Jan 06 nicklas 231   else if ("ImportItems".equals(cmd))
1872 31 Jan 06 nicklas 232   {
1872 31 Jan 06 nicklas 233     // Run an import plugin in a list context
1872 31 Jan 06 nicklas 234     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
7954 12 May 21 nicklas 235     dc = sc.newDbControl(":Import "+itemType);
1872 31 Jan 06 nicklas 236     MeasuredBioMaterial bioMaterial = (MeasuredBioMaterial)bioMaterialType.getById(dc, bioMaterialId);
1872 31 Jan 06 nicklas 237     final ItemQuery<BioMaterialEvent> query = BioMaterialEvent.getQuery(bioMaterial);
7914 23 Feb 21 nicklas 238     JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, GuiContext.list(itemType), null);
7914 23 Feb 21 nicklas 239     cc.configureQuery(dc, query, jspContext, true);
5590 16 Mar 11 nicklas 240     dc.close();
1872 31 Jan 06 nicklas 241     cc.setQuery(query);
1872 31 Jan 06 nicklas 242     redirect = "../../common/import/index.jsp?ID="+ID+"&cmd=SelectPlugin&item_type="+itemType.name()+"&context_type=LIST&title=Import+events";
1872 31 Jan 06 nicklas 243   }
1872 31 Jan 06 nicklas 244   else if ("ImportItem".equals(cmd))
1872 31 Jan 06 nicklas 245   {
1872 31 Jan 06 nicklas 246     // Run an import plugin in single-item context
1872 31 Jan 06 nicklas 247     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1872 31 Jan 06 nicklas 248     redirect = "../../common/import/index.jsp?ID="+ID+"&cmd=SelectPlugin&item_type="+itemType.name()+"&context_type=ITEM&title=Import+event";
1872 31 Jan 06 nicklas 249   }
1872 31 Jan 06 nicklas 250   else if ("RunListPlugin".equals(cmd))
1872 31 Jan 06 nicklas 251   {
1872 31 Jan 06 nicklas 252     // Run another plugin in a list context
1872 31 Jan 06 nicklas 253     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
7954 12 May 21 nicklas 254     dc = sc.newDbControl(":Run plugin "+itemType);
1872 31 Jan 06 nicklas 255     MeasuredBioMaterial bioMaterial = (MeasuredBioMaterial)bioMaterialType.getById(dc, bioMaterialId);
1872 31 Jan 06 nicklas 256     final ItemQuery<BioMaterialEvent> query = BioMaterialEvent.getQuery(bioMaterial);
7914 23 Feb 21 nicklas 257     JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, GuiContext.list(itemType), null);
7914 23 Feb 21 nicklas 258     cc.configureQuery(dc, query, jspContext, true);
5590 16 Mar 11 nicklas 259     dc.close();
1872 31 Jan 06 nicklas 260     cc.setQuery(query);
1872 31 Jan 06 nicklas 261     redirect = "../../common/plugin/index.jsp?ID="+ID+"&cmd=SelectPlugin&item_type="+itemType.name()+"&context_type=LIST&main_type=OTHER&title=Run+plugin";
1872 31 Jan 06 nicklas 262   }
1872 31 Jan 06 nicklas 263   else if ("RunPlugin".equals(cmd))
1872 31 Jan 06 nicklas 264   {
1872 31 Jan 06 nicklas 265     // Run another plugin in single-item context
1872 31 Jan 06 nicklas 266     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
1872 31 Jan 06 nicklas 267     redirect = "../../common/plugin/index.jsp?ID="+ID+"&cmd=SelectPlugin&item_type="+itemType.name()+"&context_type=ITEM&main_type=OTHER&title=Run+plugin";
1872 31 Jan 06 nicklas 268   }
1872 31 Jan 06 nicklas 269   else
1872 31 Jan 06 nicklas 270   {
1872 31 Jan 06 nicklas 271     throw new WebException("popup", "Invalid command", "The command {1} is not recognised as a valid command.", cmd);
1872 31 Jan 06 nicklas 272   }
1872 31 Jan 06 nicklas 273
949 18 Jul 05 nicklas 274 }
949 18 Jul 05 nicklas 275 finally
949 18 Jul 05 nicklas 276 {
949 18 Jul 05 nicklas 277   if (dc != null) dc.close();
949 18 Jul 05 nicklas 278 }
1872 31 Jan 06 nicklas 279 if (forward != null)
1872 31 Jan 06 nicklas 280 {
6192 31 Oct 12 nicklas 281   sc.setSessionSetting("alert-message", message);
1872 31 Jan 06 nicklas 282   pageContext.forward(forward);
1872 31 Jan 06 nicklas 283 }
1872 31 Jan 06 nicklas 284 else if (redirect != null)
1872 31 Jan 06 nicklas 285 {
6192 31 Oct 12 nicklas 286   sc.setSessionSetting("alert-message", message);
1872 31 Jan 06 nicklas 287   response.sendRedirect(redirect);
1872 31 Jan 06 nicklas 288 }
1872 31 Jan 06 nicklas 289 else if (message == null)
1872 31 Jan 06 nicklas 290 {
1872 31 Jan 06 nicklas 291   response.sendRedirect(root + "common/close_popup.jsp?refresh_opener=1&wait=0");
1872 31 Jan 06 nicklas 292 }
1872 31 Jan 06 nicklas 293 else
1872 31 Jan 06 nicklas 294 {
1872 31 Jan 06 nicklas 295   response.sendRedirect(root + "common/close_popup.jsp?refresh_opener=1&message="+HTML.urlEncode(message));
1872 31 Jan 06 nicklas 296 }
1872 31 Jan 06 nicklas 297
3675 16 Aug 07 jari 298 %>

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