www/biomaterials/extracts/extracts.js

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
7604 25 Feb 19 nicklas 1 /* $Id $
7604 25 Feb 19 nicklas 2   ------------------------------------------------------------------
7604 25 Feb 19 nicklas 3   Copyright (C) 2013 Nicklas Nordborg
7604 25 Feb 19 nicklas 4
7604 25 Feb 19 nicklas 5   This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
7604 25 Feb 19 nicklas 6   Available at http://base.thep.lu.se/
7604 25 Feb 19 nicklas 7
7604 25 Feb 19 nicklas 8   BASE is free software; you can redistribute it and/or
7604 25 Feb 19 nicklas 9   modify it under the terms of the GNU General Public License
7604 25 Feb 19 nicklas 10   as published by the Free Software Foundation; either version 3
7604 25 Feb 19 nicklas 11   of the License, or (at your option) any later version.
7604 25 Feb 19 nicklas 12
7604 25 Feb 19 nicklas 13   BASE is distributed in the hope that it will be useful,
7604 25 Feb 19 nicklas 14   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
7604 25 Feb 19 nicklas 15   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
7604 25 Feb 19 nicklas 16   GNU General Public License for more details.
7604 25 Feb 19 nicklas 17
7604 25 Feb 19 nicklas 18   You should have received a copy of the GNU General Public License
7604 25 Feb 19 nicklas 19   along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
7604 25 Feb 19 nicklas 20   ------------------------------------------------------------------
7604 25 Feb 19 nicklas 21
7604 25 Feb 19 nicklas 22   @author Nicklas
7604 25 Feb 19 nicklas 23 */
7604 25 Feb 19 nicklas 24 'use strict';
7604 25 Feb 19 nicklas 25
7604 25 Feb 19 nicklas 26 var Extracts = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 27 {
7604 25 Feb 19 nicklas 28   var extracts = {};
7604 25 Feb 19 nicklas 29   
7604 25 Feb 19 nicklas 30   /**
7604 25 Feb 19 nicklas 31     Initialize the page.
7604 25 Feb 19 nicklas 32   */
7604 25 Feb 19 nicklas 33   extracts.initPage = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 34   {
7604 25 Feb 19 nicklas 35     var pageId = Doc.getPageId();
7604 25 Feb 19 nicklas 36     if (pageId == 'edit-page')
7604 25 Feb 19 nicklas 37     {
7604 25 Feb 19 nicklas 38       // Save + Close buttons
7604 25 Feb 19 nicklas 39       Buttons.addClickHandler('btnSave', extracts.save);
7604 25 Feb 19 nicklas 40       Buttons.addClickHandler('close', App.closeWindow);
7604 25 Feb 19 nicklas 41
7604 25 Feb 19 nicklas 42       // Tab validation
7604 25 Feb 19 nicklas 43       TabControl.addTabActivateListener('settings.annotations', extracts.loadAnnotationsFrame);
7604 25 Feb 19 nicklas 44       TabControl.addTabValidator('settings.info', extracts.validateExtract);
7604 25 Feb 19 nicklas 45
7604 25 Feb 19 nicklas 46       // Quantity
7604 25 Feb 19 nicklas 47       Events.addEventHandler('original_quantity', 'keypress', Events.numberOnly);
7604 25 Feb 19 nicklas 48
7604 25 Feb 19 nicklas 49       // Tag
7604 25 Feb 19 nicklas 50       Buttons.addClickHandler('tag_id.select', extracts.selectTag);
7604 25 Feb 19 nicklas 51       Events.addEventHandler('tag_id', 'base-selected', Items.onItemSelected);
7604 25 Feb 19 nicklas 52
7604 25 Feb 19 nicklas 53       // Protocol
7604 25 Feb 19 nicklas 54       Buttons.addClickHandler('protocol_id.select', extracts.selectProtocol);
7604 25 Feb 19 nicklas 55       Events.addEventHandler('protocol_id', 'base-selected', Items.onItemSelected);
7604 25 Feb 19 nicklas 56       // Kit
7604 25 Feb 19 nicklas 57       Buttons.addClickHandler('kit_id.select', extracts.selectKit);
7604 25 Feb 19 nicklas 58       Events.addEventHandler('kit_id', 'base-selected', Items.onItemSelected);
7604 25 Feb 19 nicklas 59       // Subtype
7604 25 Feb 19 nicklas 60       Events.addEventHandler('subtype_id', 'change', extracts.subtypeOnChange);
7604 25 Feb 19 nicklas 61
7604 25 Feb 19 nicklas 62       // Bioplate and biowell
7604 25 Feb 19 nicklas 63       Buttons.addClickHandler('bioplate_id.select', extracts.selectBioPlate);
7604 25 Feb 19 nicklas 64       Events.addEventHandler('bioplate_id', 'base-selected', Items.onItemSelected);
7604 25 Feb 19 nicklas 65       Events.addEventHandler('bioplate_id', 'change', extracts.bioPlateOnChange);
7604 25 Feb 19 nicklas 66       Buttons.addClickHandler('biowell_id.select', extracts.selectBioWell);
7604 25 Feb 19 nicklas 67       Events.addEventHandler('biowell_id', 'base-selected', Items.onItemSelected);
7604 25 Feb 19 nicklas 68       extracts.initBioWell();
7604 25 Feb 19 nicklas 69
7604 25 Feb 19 nicklas 70       // Parent items
7604 25 Feb 19 nicklas 71       Events.addEventHandler('parentType.sample', 'click', extracts.parentTypeOnClick);
7604 25 Feb 19 nicklas 72       Events.addEventHandler('parentType.extract', 'click', extracts.parentTypeOnClick);
7604 25 Feb 19 nicklas 73       Buttons.addClickHandler('sample_id.select', extracts.selectSample);
7604 25 Feb 19 nicklas 74       Events.addEventHandler('sample_id', 'base-selected', Items.onItemSelected);
7604 25 Feb 19 nicklas 75       Events.addEventHandler('sample_id', 'base-selected', extracts.sampleOnChange);
7604 25 Feb 19 nicklas 76       Events.addEventHandler('used_from_sample', 'keypress', Events.numberOnly);
7604 25 Feb 19 nicklas 77       Events.addEventHandler('used_from_sample', 'blur', extracts.usedFromSampleOnBlur);
7604 25 Feb 19 nicklas 78
7604 25 Feb 19 nicklas 79       Events.addEventHandler('extracts', 'change', extracts.extractsOnChange);
7604 25 Feb 19 nicklas 80       Buttons.addClickHandler('btnAddExtracts', extracts.addExtractsOnClick);
7604 25 Feb 19 nicklas 81       Events.addEventHandler('btnAddExtracts', 'base-selected', extracts.addExtractCallback);
7604 25 Feb 19 nicklas 82       
7604 25 Feb 19 nicklas 83       Events.addEventHandler('used_quantity', 'keypress', Events.numberOnly);
7604 25 Feb 19 nicklas 84       Events.addEventHandler('used_quantity', 'keyup', extracts.usedQuantityOnChange);
7604 25 Feb 19 nicklas 85
7604 25 Feb 19 nicklas 86       extracts.parentTypeOnClick();
7604 25 Feb 19 nicklas 87
7604 25 Feb 19 nicklas 88     }
7604 25 Feb 19 nicklas 89     else if (pageId == 'view-page')
7604 25 Feb 19 nicklas 90     {
7604 25 Feb 19 nicklas 91       var itemId = Data.get('page-data', 'item-id');
7604 25 Feb 19 nicklas 92       var attributes = {'item-type': 'EXTRACT', 'item-id': itemId};
7604 25 Feb 19 nicklas 93       Buttons.addClickHandler('btnEdit', Buttons.editItem, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 94       Buttons.addClickHandler('btnDelete', Buttons.deleteItem, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 95       Buttons.addClickHandler('btnRestore', Buttons.restoreItem, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 96       Buttons.addClickHandler('btnUsingItems', Buttons.showUsingItems, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 97       Buttons.addClickHandler('btnDeletePermanently', Buttons.deleteItemPermanently, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 98       Buttons.addClickHandler('btnShare', Buttons.shareItem, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 99       Buttons.addClickHandler('btnSetOwner', Buttons.setOwner, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 100       Buttons.addClickHandler('btnNewExtract', extracts.newExtract, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 101       Buttons.addClickHandler('btnNewPhysicalBioAssay', extracts.newPhysicalBioAssay, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 102       Buttons.addClickHandler('btnNewRawBioAssay', extracts.newRawBioAssay, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 103       Buttons.addClickHandler('btnExport', Buttons.runPlugin, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 104       Buttons.addClickHandler('btnImport', Buttons.runPlugin, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 105       Buttons.addClickHandler('btnRunPlugin', Buttons.runPlugin, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 106       
7604 25 Feb 19 nicklas 107       TabControl.addTabActivateListener('main.events', extracts.viewEvents);
7604 25 Feb 19 nicklas 108       TabControl.addTabActivateListener('main.annotations', AnnotationsList.loadOnce);
7604 25 Feb 19 nicklas 109       TabControl.addTabActivateListener('main.overview', Overview.loadOnce);
7604 25 Feb 19 nicklas 110       TabControl.addTabActivateListener('main.history', History.loadOnce);
7604 25 Feb 19 nicklas 111     }
7604 25 Feb 19 nicklas 112     else if (pageId == 'list-page')
7604 25 Feb 19 nicklas 113     {
7604 25 Feb 19 nicklas 114       var attributes = {'item-type': 'EXTRACT'};
7604 25 Feb 19 nicklas 115       var tableAttributes = {'table-id': 'extracts'};
7604 25 Feb 19 nicklas 116       Buttons.addClickHandler('btnNewItem', Buttons.newItem, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 117       Buttons.addClickHandler('btnDeleteItems', Buttons.deleteItems, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 118       Buttons.addClickHandler('btnRestoreItems', Buttons.restoreItems, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 119       Buttons.addClickHandler('btnShareItems', Buttons.shareItems, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 120       Buttons.addClickHandler('btnSetOwner', Buttons.setOwnerOfItems, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 121       Buttons.addClickHandler('btnColumns', Buttons.configureColumns, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 122       Buttons.addClickHandler('btnInheritAnnotations', Buttons.inheritAnnotations, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 123       Buttons.addClickHandler('btnExport', Buttons.runListPlugin, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 124       Buttons.addClickHandler('btnImport', Buttons.runListPlugin, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 125       Buttons.addClickHandler('btnRunPlugin', Buttons.runListPlugin, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 126       Buttons.addClickHandler('btnNewItemList', extracts.newItemListOnClick);
7813 19 May 20 nicklas 127       Buttons.addClickHandler('btnAddToItemList', extracts.addToItemListOnClick);
7604 25 Feb 19 nicklas 128       Buttons.addClickHandler('btnPlaceOnPlate', extracts.placeOnPlateOnClick);
7604 25 Feb 19 nicklas 129       Buttons.addClickHandler('btnNewPooledItem', extracts.newPooledItemOnClick);
7604 25 Feb 19 nicklas 130       Buttons.addClickHandler('btnNewPhysicalBioAssay', extracts.newPhysicalBioAssayFromTable);
7604 25 Feb 19 nicklas 131       
7604 25 Feb 19 nicklas 132       Buttons.addClickHandler('close', App.closeWindow);
7604 25 Feb 19 nicklas 133       Buttons.addClickHandler('btnOk', Buttons.returnSelected, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 134     }
7604 25 Feb 19 nicklas 135   }
7604 25 Feb 19 nicklas 136
7604 25 Feb 19 nicklas 137   // Add event handlers to the 'new sample' icons
7604 25 Feb 19 nicklas 138   extracts.initElements = function(element, autoInit)
7604 25 Feb 19 nicklas 139   {
7604 25 Feb 19 nicklas 140     if (autoInit == 'new-extract')
7604 25 Feb 19 nicklas 141     {
7604 25 Feb 19 nicklas 142       Buttons.addClickHandler(element, extracts.newExtract);
7604 25 Feb 19 nicklas 143     }
7604 25 Feb 19 nicklas 144     else if (autoInit == 'new-derived-bioassay')
7604 25 Feb 19 nicklas 145     {
7604 25 Feb 19 nicklas 146       Buttons.addClickHandler(element, extracts.newDerivedBioAssay);
7604 25 Feb 19 nicklas 147     }
7604 25 Feb 19 nicklas 148     else if (autoInit == 'new-raw-bioassay')
7604 25 Feb 19 nicklas 149     {
7604 25 Feb 19 nicklas 150       Buttons.addClickHandler(element, extracts.newRawBioAssay);
7604 25 Feb 19 nicklas 151     }
7604 25 Feb 19 nicklas 152   }
7604 25 Feb 19 nicklas 153
7604 25 Feb 19 nicklas 154   /*
7604 25 Feb 19 nicklas 155     Create a new extract with the current extract as the parent
7604 25 Feb 19 nicklas 156   */
7604 25 Feb 19 nicklas 157   extracts.newExtract = function(event)
7604 25 Feb 19 nicklas 158   {
7604 25 Feb 19 nicklas 159     var extractId = Data.int(event.currentTarget, 'item-id');
7604 25 Feb 19 nicklas 160     Items.newItem('EXTRACT', '&extract_id='+extractId);
7604 25 Feb 19 nicklas 161   }
7604 25 Feb 19 nicklas 162   
7604 25 Feb 19 nicklas 163   /*
7604 25 Feb 19 nicklas 164     Create a new derived bioassay with the current extract as the parent
7604 25 Feb 19 nicklas 165   */
7604 25 Feb 19 nicklas 166   extracts.newDerivedBioAssay = function(event)
7604 25 Feb 19 nicklas 167   {
7604 25 Feb 19 nicklas 168     var extractId = Data.int(event.currentTarget, 'item-id');
7604 25 Feb 19 nicklas 169     Items.newItem('DERIVEDBIOASSAY', '&extract_id='+extractId);
7604 25 Feb 19 nicklas 170   }
7604 25 Feb 19 nicklas 171
7604 25 Feb 19 nicklas 172   
7604 25 Feb 19 nicklas 173   /*
7604 25 Feb 19 nicklas 174     Create a new raw bioassay with the current extract as the parent
7604 25 Feb 19 nicklas 175   */
7604 25 Feb 19 nicklas 176   extracts.newRawBioAssay = function(event)
7604 25 Feb 19 nicklas 177   {
7604 25 Feb 19 nicklas 178     var extractId = Data.int(event.currentTarget, 'item-id');
7604 25 Feb 19 nicklas 179     Items.newItem('RAWBIOASSAY', '&extract_id='+extractId);
7604 25 Feb 19 nicklas 180   }
7604 25 Feb 19 nicklas 181   
7604 25 Feb 19 nicklas 182   /*
7604 25 Feb 19 nicklas 183     Create a new physical bioassay with the current extract as the parent
7604 25 Feb 19 nicklas 184   */
7604 25 Feb 19 nicklas 185   extracts.newPhysicalBioAssay = function(event)
7604 25 Feb 19 nicklas 186   {
7604 25 Feb 19 nicklas 187     var extractId = Data.int(event.currentTarget, 'item-id');
7604 25 Feb 19 nicklas 188     Items.newItem('PHYSICALBIOASSAY', '&extract_id='+extractId);
7604 25 Feb 19 nicklas 189   }
7604 25 Feb 19 nicklas 190
7604 25 Feb 19 nicklas 191   // Create a new item list with the selected items as members
7604 25 Feb 19 nicklas 192   extracts.newItemListOnClick = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 193   {
7604 25 Feb 19 nicklas 194     var controller = Items.getController('ITEMLIST');
7604 25 Feb 19 nicklas 195     Table.submitToPopup('extracts', 'CreateItemList', controller.width, controller.height);
7604 25 Feb 19 nicklas 196   }
7604 25 Feb 19 nicklas 197   
7813 19 May 20 nicklas 198   // Add selected extracts to an existing item list
7813 19 May 20 nicklas 199   extracts.addToItemListOnClick = function()
7813 19 May 20 nicklas 200   {
7813 19 May 20 nicklas 201     Table.submitToPopup('extracts', 'AddItemsToList', 450, 300);
7813 19 May 20 nicklas 202   }
7813 19 May 20 nicklas 203   
7604 25 Feb 19 nicklas 204   extracts.placeOnPlateOnClick = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 205   {
7604 25 Feb 19 nicklas 206     Table.submitToPopup('extracts', 'PlaceOnPlate', 900, 600);
7604 25 Feb 19 nicklas 207   }
7604 25 Feb 19 nicklas 208   
7604 25 Feb 19 nicklas 209   extracts.newPooledItemOnClick = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 210   {
7604 25 Feb 19 nicklas 211     if (!Table.checkIfSelected('extracts'))
7604 25 Feb 19 nicklas 212     {
7604 25 Feb 19 nicklas 213       return;
7604 25 Feb 19 nicklas 214     }
7604 25 Feb 19 nicklas 215     Table.submitToPopup('extracts', 'NewPooledItem', 750, 500);
7604 25 Feb 19 nicklas 216   }
7604 25 Feb 19 nicklas 217
7604 25 Feb 19 nicklas 218   extracts.newPhysicalBioAssayFromTable = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 219   {
7604 25 Feb 19 nicklas 220     if (!Table.checkIfSelected('extracts'))
7604 25 Feb 19 nicklas 221     {
7604 25 Feb 19 nicklas 222       return;
7604 25 Feb 19 nicklas 223     }
7604 25 Feb 19 nicklas 224     Table.submitToPopup('extracts', 'NewPhysicalBioAssay', 750, 500);
7604 25 Feb 19 nicklas 225   }
7604 25 Feb 19 nicklas 226   
7604 25 Feb 19 nicklas 227   extracts.viewEvents = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 228   {
7604 25 Feb 19 nicklas 229     var extractId = Data.get('page-data', 'item-id');
7604 25 Feb 19 nicklas 230     var url = '../events/index.jsp?ID='+App.getSessionId();
7604 25 Feb 19 nicklas 231     url += '&cmd=List&biomaterial_id='+extractId;
7604 25 Feb 19 nicklas 232     url += '&biomaterial_type=EXTRACT';
7604 25 Feb 19 nicklas 233     location.replace(url);
7604 25 Feb 19 nicklas 234   }
7604 25 Feb 19 nicklas 235   
7604 25 Feb 19 nicklas 236   extracts.validateExtract = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 237   {
7604 25 Feb 19 nicklas 238     var frm = document.forms['extract'];
7604 25 Feb 19 nicklas 239     if (Strings.trim(frm.name.value) == '')
7604 25 Feb 19 nicklas 240     {
7604 25 Feb 19 nicklas 241       Forms.showNotification(frm.name, 'You must enter a name');
7604 25 Feb 19 nicklas 242       return false;
7604 25 Feb 19 nicklas 243     }
7604 25 Feb 19 nicklas 244     if (Strings.trim(frm.bioplate_id.value) != 0 && Strings.trim(frm.biowell_id.value) == 0)
7604 25 Feb 19 nicklas 245     {
7604 25 Feb 19 nicklas 246       Forms.showNotification('biowell_id.select', 'You must choose a biowell from the bioplate');
7604 25 Feb 19 nicklas 247       return false;
7604 25 Feb 19 nicklas 248     }
7604 25 Feb 19 nicklas 249     return true;
7604 25 Feb 19 nicklas 250   }
7604 25 Feb 19 nicklas 251
7604 25 Feb 19 nicklas 252   extracts.save = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 253   {
7604 25 Feb 19 nicklas 254     var frm = document.forms['extract'];
7604 25 Feb 19 nicklas 255     if (TabControl.validateActiveTab('settings'))
7604 25 Feb 19 nicklas 256     {
7604 25 Feb 19 nicklas 257       Annotations.saveModifiedAnnotationsToForm(frm);
7604 25 Feb 19 nicklas 258       Link.exportActions('extracts');
7604 25 Feb 19 nicklas 259       frm.submit();
7604 25 Feb 19 nicklas 260     }
7604 25 Feb 19 nicklas 261   }
7604 25 Feb 19 nicklas 262
7604 25 Feb 19 nicklas 263
7604 25 Feb 19 nicklas 264   extracts.loadAnnotationsFrame = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 265   {
7604 25 Feb 19 nicklas 266     var frm = document.forms['extract'];
7604 25 Feb 19 nicklas 267     var protocolId = 0;
7604 25 Feb 19 nicklas 268     if (frm.protocol_id.length > 0 && !frm.protocol_id.disabled) 
7604 25 Feb 19 nicklas 269     {
7604 25 Feb 19 nicklas 270       protocolId = Math.abs(parseInt(frm.protocol_id.value));        
7604 25 Feb 19 nicklas 271     }
7604 25 Feb 19 nicklas 272     Annotations.autoLoadEditFrame(protocolId, ItemSubtype.getSubtypeId('subtype_id'), extracts.getParents());
7604 25 Feb 19 nicklas 273   }
7604 25 Feb 19 nicklas 274   
7604 25 Feb 19 nicklas 275   extracts.getParents = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 276   {
7604 25 Feb 19 nicklas 277     var frm = document.forms['extract'];
7604 25 Feb 19 nicklas 278     var parents = [];
7604 25 Feb 19 nicklas 279     if (frm.parentType[0].checked)
7604 25 Feb 19 nicklas 280     {
7604 25 Feb 19 nicklas 281       var sampleId = Math.abs(parseInt(frm.sample_id.value));
7604 25 Feb 19 nicklas 282       if (sampleId > 0) parents[parents.length] = 'SAMPLE:'+sampleId;
7604 25 Feb 19 nicklas 283     }
7604 25 Feb 19 nicklas 284     else
7604 25 Feb 19 nicklas 285     {
7604 25 Feb 19 nicklas 286       var ids = Link.getIdsInList(frm.extracts, 'EXTRACT');
7604 25 Feb 19 nicklas 287       if (ids.length > 0)
7604 25 Feb 19 nicklas 288       {
7604 25 Feb 19 nicklas 289         parents[parents.length] = 'EXTRACT:'+ids.join(':');
7604 25 Feb 19 nicklas 290       }
7604 25 Feb 19 nicklas 291     }
7604 25 Feb 19 nicklas 292     var tagId = Math.abs(parseInt(frm.tag_id.value));
7604 25 Feb 19 nicklas 293     if (tagId > 0) parents[parents.length] = 'TAG:'+tagId;
7604 25 Feb 19 nicklas 294     var kitId = Math.abs(parseInt(frm.kit_id.value));
7604 25 Feb 19 nicklas 295     if (kitId > 0) parents[parents.length] = 'KIT:'+kitId;
7604 25 Feb 19 nicklas 296     var protocolId = Math.abs(parseInt(frm.protocol_id.value));
7604 25 Feb 19 nicklas 297     if (protocolId > 0) parents[parents.length] = 'PROTOCOL:'+protocolId;
7604 25 Feb 19 nicklas 298     return parents;
7604 25 Feb 19 nicklas 299   }
7604 25 Feb 19 nicklas 300
7604 25 Feb 19 nicklas 301   extracts.subtypeOnChange = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 302   {
7604 25 Feb 19 nicklas 303     var frm = document.forms['extract'];
7604 25 Feb 19 nicklas 304     var subtypeId = ItemSubtype.getSubtypeId('subtype_id');
7604 25 Feb 19 nicklas 305     var recentInfo = ItemSubtype.getRelatedProjectDefaultAndRecentItems('EXTRACT', subtypeId, ['PROTOCOL', 'KIT', 'BIOPLATE', 'TAG', 'SAMPLE', 'EXTRACT']);
7604 25 Feb 19 nicklas 306     ItemSubtype.updateSelectionList(frm.protocol_id, recentInfo.PROTOCOL['recent'], recentInfo.PROTOCOL['default']);
7604 25 Feb 19 nicklas 307     ItemSubtype.updateSelectionList(frm.kit_id, recentInfo.KIT['recent']);
7604 25 Feb 19 nicklas 308     ItemSubtype.updateSelectionList(frm.tag_id, recentInfo.TAG['recent']);
7604 25 Feb 19 nicklas 309     ItemSubtype.updateSelectionList(frm.bioplate_id, recentInfo.BIOPLATE['recent']);
7604 25 Feb 19 nicklas 310   }
7604 25 Feb 19 nicklas 311   
7604 25 Feb 19 nicklas 312   extracts.selectTag = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 313   {
7604 25 Feb 19 nicklas 314     var frm = document.forms['extract'];
7604 25 Feb 19 nicklas 315     var url = '&resetTemporary=1';
7604 25 Feb 19 nicklas 316     url += ItemSubtype.createRelatedFilter('subtype_id', 'TAG');
7604 25 Feb 19 nicklas 317     if (frm.tag_id.length > 1) 
7604 25 Feb 19 nicklas 318     {
7604 25 Feb 19 nicklas 319       var id = Math.abs(parseInt(frm.tag_id[1].value));        
7604 25 Feb 19 nicklas 320       url += '&item_id='+id;
7604 25 Feb 19 nicklas 321     }
7604 25 Feb 19 nicklas 322     Dialogs.selectItem('TAG', 'tag_id', 0, url);
7604 25 Feb 19 nicklas 323   }
7604 25 Feb 19 nicklas 324   
7604 25 Feb 19 nicklas 325   extracts.selectProtocol = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 326   {
7604 25 Feb 19 nicklas 327     var frm = document.forms['extract'];
7604 25 Feb 19 nicklas 328     var url = '&resetTemporary=1';
7604 25 Feb 19 nicklas 329     url += ItemSubtype.createRelatedFilter('subtype_id', 'PROTOCOL', Data.int('page-data', 'extraction-protocoltype-id'));
7604 25 Feb 19 nicklas 330     if (frm.protocol_id.length > 1) 
7604 25 Feb 19 nicklas 331     {
7604 25 Feb 19 nicklas 332       var id = Math.abs(parseInt(frm.protocol_id[1].value));        
7604 25 Feb 19 nicklas 333       url += '&item_id='+id;
7604 25 Feb 19 nicklas 334     }
7604 25 Feb 19 nicklas 335     Dialogs.selectItem('PROTOCOL', 'protocol_id', 0, url);
7604 25 Feb 19 nicklas 336   }
7604 25 Feb 19 nicklas 337   
7604 25 Feb 19 nicklas 338   extracts.selectKit = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 339   {
7604 25 Feb 19 nicklas 340     var frm = document.forms['extract'];
7604 25 Feb 19 nicklas 341     var url = '&resetTemporary=1';
7604 25 Feb 19 nicklas 342     url += '&tmpfilter:BOOLEAN:inactive=0';
7604 25 Feb 19 nicklas 343     url += ItemSubtype.createRelatedFilter('subtype_id', 'KIT', Data.int('page-data', 'extraction-kittype-id'));
7604 25 Feb 19 nicklas 344     if (frm.kit_id.length > 1) 
7604 25 Feb 19 nicklas 345     {
7604 25 Feb 19 nicklas 346       var id = Math.abs(parseInt(frm.kit_id[1].value));        
7604 25 Feb 19 nicklas 347       url += '&item_id='+id;
7604 25 Feb 19 nicklas 348     }
7604 25 Feb 19 nicklas 349     Dialogs.selectItem('KIT', 'kit_id', 0, url);
7604 25 Feb 19 nicklas 350   }
7604 25 Feb 19 nicklas 351   
7604 25 Feb 19 nicklas 352   extracts.selectBioPlate = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 353   {
7604 25 Feb 19 nicklas 354     var frm = document.forms['extract'];
7604 25 Feb 19 nicklas 355     var url = '&resetTemporary=1';
7604 25 Feb 19 nicklas 356     url += '&tmpfilter:INT:bioPlateType.bioMaterialType='+encodeURIComponent('|'+Data.get('page-data', 'extract-type'));
7604 25 Feb 19 nicklas 357     var subtypeId = ItemSubtype.getSubtypeId('subtype_id');
7604 25 Feb 19 nicklas 358     // Restrict to plates with the given subtype
7604 25 Feb 19 nicklas 359     url += '&tmpfilter:INT:bioPlateType.itemSubtype='+encodeURIComponent(subtypeId ? '|' + subtypeId : '=');
7604 25 Feb 19 nicklas 360     url += '&tmpfilter:BOOLEAN:destroyed=false';
7604 25 Feb 19 nicklas 361     Dialogs.selectItem('BIOPLATE', 'bioplate_id', 0, url);
7604 25 Feb 19 nicklas 362   }
7604 25 Feb 19 nicklas 363   
7604 25 Feb 19 nicklas 364   extracts.bioPlateOnChange = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 365   {
7604 25 Feb 19 nicklas 366     var frm = document.forms['extract'];
7604 25 Feb 19 nicklas 367     var list = frm.bioplate_id;
7604 25 Feb 19 nicklas 368     frm.biowell_id.selectedIndex=0;
7604 25 Feb 19 nicklas 369     frm.biowell_id.remove(1);      
7604 25 Feb 19 nicklas 370   }
7604 25 Feb 19 nicklas 371   
7604 25 Feb 19 nicklas 372   extracts.initBioWell = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 373   {
7604 25 Feb 19 nicklas 374     var biowell = JSON.parse(Data.get('page-data', 'biowell'));
7604 25 Feb 19 nicklas 375     if (biowell)
7604 25 Feb 19 nicklas 376     {
7604 25 Feb 19 nicklas 377       var frm = document.forms['extract'];
7604 25 Feb 19 nicklas 378       var option = new Option(biowell.location, -biowell.id, true, true);
7604 25 Feb 19 nicklas 379       frm.biowell_id[1] = option;
7604 25 Feb 19 nicklas 380     }
7604 25 Feb 19 nicklas 381   }
7604 25 Feb 19 nicklas 382   
7604 25 Feb 19 nicklas 383   extracts.selectBioWell = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 384   {
7604 25 Feb 19 nicklas 385     var frm = document.forms['extract'];
7604 25 Feb 19 nicklas 386     var bioplateId = Math.abs(parseInt(frm.bioplate_id.value))
7604 25 Feb 19 nicklas 387     if (bioplateId == 0)
7604 25 Feb 19 nicklas 388     {
7604 25 Feb 19 nicklas 389       Forms.showNotification('bioplate_id.select', 'You must first select a bioplate', null, 'pointer-below');
7604 25 Feb 19 nicklas 390       return;
7604 25 Feb 19 nicklas 391     }
7604 25 Feb 19 nicklas 392     
7604 25 Feb 19 nicklas 393     var url = '&bioplate_id='+bioplateId;
7604 25 Feb 19 nicklas 394     url += '&resetTemporary=1&tmpfilter:STRING:$mbm.name='+escape('=');
7604 25 Feb 19 nicklas 395     url += '&tmpfilter:STRING:originalBioMaterial.name='+escape('=');
7604 25 Feb 19 nicklas 396     url += '&columns=row,column';
7604 25 Feb 19 nicklas 397
7604 25 Feb 19 nicklas 398     Dialogs.selectItem('BIOWELL', 'biowell_id', 0, url);
7604 25 Feb 19 nicklas 399   }
7604 25 Feb 19 nicklas 400   
7604 25 Feb 19 nicklas 401   extracts.parentTypeOnClick = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 402   {
7604 25 Feb 19 nicklas 403     var frm = document.forms['extract'];
7604 25 Feb 19 nicklas 404     var useExtracts = frm.parentType[1].checked;
7604 25 Feb 19 nicklas 405     frm.sample_id.disabled = useExtracts;
7604 25 Feb 19 nicklas 406     frm.used_from_sample.disabled = useExtracts;
7604 25 Feb 19 nicklas 407     frm.extracts.disabled = !useExtracts;
7604 25 Feb 19 nicklas 408     frm.used_quantity.disabled = !useExtracts;
7604 25 Feb 19 nicklas 409   }
7604 25 Feb 19 nicklas 410
7604 25 Feb 19 nicklas 411   extracts.selectSample = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 412   {
7604 25 Feb 19 nicklas 413     var frm = document.forms['extract'];
7604 25 Feb 19 nicklas 414     var url = '&resetTemporary=1';
7604 25 Feb 19 nicklas 415     url += ItemSubtype.createRelatedFilter('subtype_id', 'SAMPLE');
7604 25 Feb 19 nicklas 416     if (frm.sample_id.length > 1) 
7604 25 Feb 19 nicklas 417     {
7604 25 Feb 19 nicklas 418       var id = Math.abs(parseInt(frm.sample_id[1].value));        
7604 25 Feb 19 nicklas 419       url += '&item_id='+id;
7604 25 Feb 19 nicklas 420     }
7604 25 Feb 19 nicklas 421     Dialogs.selectItem('SAMPLE', 'sample_id', 0, url);
7604 25 Feb 19 nicklas 422   }
7604 25 Feb 19 nicklas 423   
7604 25 Feb 19 nicklas 424   extracts.sampleOnChange = function(event)
7604 25 Feb 19 nicklas 425   {
7604 25 Feb 19 nicklas 426     var frm = document.forms['extract'];
7604 25 Feb 19 nicklas 427     frm.parentType[0].checked = true;
7604 25 Feb 19 nicklas 428     frm.parentType[1].checked = false;
7604 25 Feb 19 nicklas 429     extracts.parentTypeOnClick();
7604 25 Feb 19 nicklas 430   }
7604 25 Feb 19 nicklas 431
7604 25 Feb 19 nicklas 432   extracts.usedFromSampleOnBlur = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 433   {
7604 25 Feb 19 nicklas 434     var frm = document.forms['extract'];
7604 25 Feb 19 nicklas 435     var sampleId = parseInt(frm.sample_id.value);
7604 25 Feb 19 nicklas 436     if (sampleId < 0)
7604 25 Feb 19 nicklas 437     {
7604 25 Feb 19 nicklas 438       frm.sample_id[frm.sample_id.selectedIndex].value = -sampleId;
7604 25 Feb 19 nicklas 439     }
7604 25 Feb 19 nicklas 440   }
7604 25 Feb 19 nicklas 441   
7604 25 Feb 19 nicklas 442   extracts.addExtractsOnClick = function(event)
7604 25 Feb 19 nicklas 443   {
7604 25 Feb 19 nicklas 444     var frm = document.forms['extract'];
7604 25 Feb 19 nicklas 445     var currentExtracts = Link.getIdsInList(frm.extracts, 'EXTRACT');
7604 25 Feb 19 nicklas 446     var url = '&resetTemporary=1&exclude='+currentExtracts.join(',');
7604 25 Feb 19 nicklas 447     url += ItemSubtype.createRelatedFilter('subtype_id', 'EXTRACT');
7604 25 Feb 19 nicklas 448     Dialogs.selectItem('EXTRACT', event.currentTarget.id, 1, url);
7604 25 Feb 19 nicklas 449   }
7604 25 Feb 19 nicklas 450
7604 25 Feb 19 nicklas 451   extracts.addExtractCallback = function(event)
7604 25 Feb 19 nicklas 452   {
7604 25 Feb 19 nicklas 453     var frm = document.forms['extract'];
7604 25 Feb 19 nicklas 454     event.detail.name += ' [-]';
7604 25 Feb 19 nicklas 455     Link.addItem('extracts', 'EXTRACT', event.detail);
7604 25 Feb 19 nicklas 456     if (event.detail.remaining == 0)
7604 25 Feb 19 nicklas 457     {
7604 25 Feb 19 nicklas 458       frm.parentType[0].checked = false;
7604 25 Feb 19 nicklas 459       frm.parentType[1].checked = true;
7604 25 Feb 19 nicklas 460       extracts.parentTypeOnClick();
7604 25 Feb 19 nicklas 461     }
7604 25 Feb 19 nicklas 462   }
7604 25 Feb 19 nicklas 463
7604 25 Feb 19 nicklas 464   extracts.usedQuantityOnChange = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 465   {
7604 25 Feb 19 nicklas 466     var frm = document.forms['extract'];
7604 25 Feb 19 nicklas 467     var usedQuantity = frm.used_quantity.value;
7604 25 Feb 19 nicklas 468     var displayQuantity = usedQuantity == '' ? '-' : usedQuantity+' µg';
7604 25 Feb 19 nicklas 469     for (var i = 0; i < frm.extracts.length; i++)
7604 25 Feb 19 nicklas 470     {
7604 25 Feb 19 nicklas 471       var option = frm.extracts[i];
7604 25 Feb 19 nicklas 472       if (option.selected && option.item.id)
7604 25 Feb 19 nicklas 473       {
7604 25 Feb 19 nicklas 474         option.item.value = usedQuantity;
7604 25 Feb 19 nicklas 475         var text = option.text.replace(/\[.*\]/, '['+displayQuantity+']');
7604 25 Feb 19 nicklas 476         option.text = text; 
7604 25 Feb 19 nicklas 477       }
7604 25 Feb 19 nicklas 478     }
7604 25 Feb 19 nicklas 479   }
7604 25 Feb 19 nicklas 480   
7604 25 Feb 19 nicklas 481   extracts.extractsOnChange = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 482   {
7604 25 Feb 19 nicklas 483     var frm = document.forms['extract'];
7604 25 Feb 19 nicklas 484     var item = frm.extracts[frm.extracts.selectedIndex].item;
7604 25 Feb 19 nicklas 485     if (item && item.id && item.value != undefined)
7604 25 Feb 19 nicklas 486     {
7604 25 Feb 19 nicklas 487       frm.used_quantity.value = item.value;
7604 25 Feb 19 nicklas 488     }
7604 25 Feb 19 nicklas 489     else
7604 25 Feb 19 nicklas 490     {
7604 25 Feb 19 nicklas 491       frm.used_quantity.value = '';
7604 25 Feb 19 nicklas 492     }
7604 25 Feb 19 nicklas 493     frm.used_quantity.focus();
7604 25 Feb 19 nicklas 494   }
7604 25 Feb 19 nicklas 495
7604 25 Feb 19 nicklas 496   return extracts;
7604 25 Feb 19 nicklas 497 }();
7604 25 Feb 19 nicklas 498
7604 25 Feb 19 nicklas 499 Doc.addElementInitializer(Extracts.initElements);
7604 25 Feb 19 nicklas 500 Doc.onLoad(Extracts.initPage);

Generated on Sat Oct  7 02:44:17 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)