www/biomaterials/wizards/create_child_bioplate_step1.jsp

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
5548 24 Jan 11 nicklas 1 <%-- $Id$
5548 24 Jan 11 nicklas 2   ------------------------------------------------------------------
5548 24 Jan 11 nicklas 3   Copyright (C) 2011 Nicklas Nordborg
5548 24 Jan 11 nicklas 4
5548 24 Jan 11 nicklas 5   This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
5548 24 Jan 11 nicklas 6   Available at http://base.thep.lu.se/
5548 24 Jan 11 nicklas 7
5548 24 Jan 11 nicklas 8   BASE is free software; you can redistribute it and/or
5548 24 Jan 11 nicklas 9   modify it under the terms of the GNU General Public License
5548 24 Jan 11 nicklas 10   as published by the Free Software Foundation; either version 3
5548 24 Jan 11 nicklas 11   of the License, or (at your option) any later version.
5548 24 Jan 11 nicklas 12
5548 24 Jan 11 nicklas 13   BASE is distributed in the hope that it will be useful,
5548 24 Jan 11 nicklas 14   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
5548 24 Jan 11 nicklas 15   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
5548 24 Jan 11 nicklas 16   GNU General Public License for more details.
5548 24 Jan 11 nicklas 17
5548 24 Jan 11 nicklas 18   You should have received a copy of the GNU General Public License
5548 24 Jan 11 nicklas 19   along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
5548 24 Jan 11 nicklas 20   ------------------------------------------------------------------
5548 24 Jan 11 nicklas 21
5548 24 Jan 11 nicklas 22   @author Nicklas
5548 24 Jan 11 nicklas 23 --%>
5548 24 Jan 11 nicklas 24 <%@ page pageEncoding="UTF-8" session="false"
5548 24 Jan 11 nicklas 25   import="net.sf.basedb.core.BioPlate"
5548 24 Jan 11 nicklas 26   import="net.sf.basedb.core.BioPlateEvent"
5548 24 Jan 11 nicklas 27   import="net.sf.basedb.core.BioPlateEventType"
5548 24 Jan 11 nicklas 28   import="net.sf.basedb.core.BioPlateType"
5723 07 Sep 11 nicklas 29   import="net.sf.basedb.core.BioWell"
5548 24 Jan 11 nicklas 30   import="net.sf.basedb.core.PlateGeometry"
5548 24 Jan 11 nicklas 31   import="net.sf.basedb.core.MeasuredBioMaterial"
5548 24 Jan 11 nicklas 32   import="net.sf.basedb.core.Hardware"
6997 03 Nov 15 nicklas 33   import="net.sf.basedb.core.Kit"
5548 24 Jan 11 nicklas 34   import="net.sf.basedb.core.Protocol"
5641 25 May 11 nicklas 35   import="net.sf.basedb.core.Tag"
5723 07 Sep 11 nicklas 36   import="net.sf.basedb.core.ItemSubtype"
5548 24 Jan 11 nicklas 37   import="net.sf.basedb.core.DbControl"
5548 24 Jan 11 nicklas 38   import="net.sf.basedb.core.Item"
5548 24 Jan 11 nicklas 39   import="net.sf.basedb.core.ItemContext"
5548 24 Jan 11 nicklas 40   import="net.sf.basedb.core.ItemQuery"
5553 27 Jan 11 nicklas 41   import="net.sf.basedb.core.Include"
5548 24 Jan 11 nicklas 42   import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
5548 24 Jan 11 nicklas 43   import="net.sf.basedb.core.SystemItems"
5723 07 Sep 11 nicklas 44   import="net.sf.basedb.core.PermissionDeniedException"
5548 24 Jan 11 nicklas 45   import="net.sf.basedb.core.query.Restrictions"
5553 27 Jan 11 nicklas 46   import="net.sf.basedb.core.query.Orders"
5548 24 Jan 11 nicklas 47   import="net.sf.basedb.core.query.Hql"
5548 24 Jan 11 nicklas 48   import="net.sf.basedb.util.Values"
5548 24 Jan 11 nicklas 49   import="net.sf.basedb.util.formatter.Formatter"
5548 24 Jan 11 nicklas 50   import="net.sf.basedb.clients.web.formatter.FormatterFactory"
5548 24 Jan 11 nicklas 51   import="net.sf.basedb.clients.web.formatter.FormatterSettings"
5548 24 Jan 11 nicklas 52   import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
5548 24 Jan 11 nicklas 53   import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
5548 24 Jan 11 nicklas 54   import="java.util.List"
5548 24 Jan 11 nicklas 55   import="java.util.Date"
5548 24 Jan 11 nicklas 56   import="java.util.Collections"
5548 24 Jan 11 nicklas 57 %>
5548 24 Jan 11 nicklas 58 <%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
5548 24 Jan 11 nicklas 59 <%@ taglib prefix="tbl" uri="/WEB-INF/table.tld" %>
5548 24 Jan 11 nicklas 60 <%
5548 24 Jan 11 nicklas 61 final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(pageContext, true);
5548 24 Jan 11 nicklas 62 final String ID = sc.getId();
5548 24 Jan 11 nicklas 63 final float scale = Base.getScale(sc);
5548 24 Jan 11 nicklas 64 final int sourcePlateId = Values.getInt(request.getParameter("sourceplate_id"));
5548 24 Jan 11 nicklas 65 final ItemContext cc = sc.getCurrentContext(Item.BIOPLATEEVENT, BioPlateEventType.CREATE_BIOMATERIAL);
7954 12 May 21 nicklas 66 final DbControl dc = sc.newDbControl(":Create child plate wizard step 1");
5548 24 Jan 11 nicklas 67 try
5548 24 Jan 11 nicklas 68 {
5548 24 Jan 11 nicklas 69   BioPlate sourcePlate = BioPlate.getById(dc, sourcePlateId);
5548 24 Jan 11 nicklas 70   BioPlateType sourceType = sourcePlate.getBioPlateType();
5548 24 Jan 11 nicklas 71   Item sourceBioMaterialType = sourceType.getBioMaterialType();
5548 24 Jan 11 nicklas 72   PlateGeometry sourceGeometry = sourcePlate.getPlateGeometry();
5548 24 Jan 11 nicklas 73   Hardware sourceFreezer = sourcePlate.getFreezer();
5548 24 Jan 11 nicklas 74   
5548 24 Jan 11 nicklas 75   // Load recently used items
7605 26 Feb 19 nicklas 76   List<Hardware> recentHardware = cc.getRecent(dc, Item.HARDWARE, sourceBioMaterialType.name());
7605 26 Feb 19 nicklas 77   List<Protocol> recentProtocols = cc.getRecent(dc, Item.PROTOCOL, sourceBioMaterialType.name());
7605 26 Feb 19 nicklas 78   List<Kit> recentKits = cc.getRecent(dc, Item.KIT, sourceBioMaterialType.name());
7605 26 Feb 19 nicklas 79   List<PlateGeometry> recentGeometry = cc.getRecent(dc, Item.PLATEGEOMETRY, sourceBioMaterialType.name());
7605 26 Feb 19 nicklas 80   List<BioPlateType> recentPlateTypes = cc.getRecent(dc, Item.BIOPLATETYPE, sourceBioMaterialType.name());
7605 26 Feb 19 nicklas 81   List<Hardware> recentFreezers = cc.getRecent(dc, Item.HARDWARE, "freezer");
5723 07 Sep 11 nicklas 82   
5723 07 Sep 11 nicklas 83   // Load subtypes
5723 07 Sep 11 nicklas 84   final List<ItemSubtype> sampleSubtypes = sourceBioMaterialType == Item.SAMPLE ? 
5723 07 Sep 11 nicklas 85     Base.getSubtypesQuery(Item.SAMPLE).list(dc) : null;
5723 07 Sep 11 nicklas 86   final List<ItemSubtype> extractSubtypes = Base.getSubtypesQuery(Item.EXTRACT).list(dc);
5723 07 Sep 11 nicklas 87   final List<ItemSubtype> bioAssaySubtypes = sourceBioMaterialType == Item.EXTRACT ? 
5723 07 Sep 11 nicklas 88     Base.getSubtypesQuery(Item.PHYSICALBIOASSAY).list(dc) : null;
5723 07 Sep 11 nicklas 89   // Find a common itemsubtype (if any)
5723 07 Sep 11 nicklas 90   ItemSubtype commonSubtype = null;
5723 07 Sep 11 nicklas 91   boolean first = true;
5723 07 Sep 11 nicklas 92   for (BioWell well : sourcePlate.getBioWells().list(dc))
5723 07 Sep 11 nicklas 93   {
5723 07 Sep 11 nicklas 94     try
5723 07 Sep 11 nicklas 95     {
5723 07 Sep 11 nicklas 96       if (!well.isEmpty())
5723 07 Sep 11 nicklas 97       {
5723 07 Sep 11 nicklas 98         ItemSubtype subtype = well.getBioMaterial().getItemSubtype();
5723 07 Sep 11 nicklas 99         if (first)
5723 07 Sep 11 nicklas 100         {
5723 07 Sep 11 nicklas 101           commonSubtype = subtype;
5723 07 Sep 11 nicklas 102           first = false;
5723 07 Sep 11 nicklas 103         }
5723 07 Sep 11 nicklas 104         else
5723 07 Sep 11 nicklas 105         {
5723 07 Sep 11 nicklas 106           if (subtype == null || !subtype.equals(commonSubtype))
5723 07 Sep 11 nicklas 107           {
5723 07 Sep 11 nicklas 108             commonSubtype = null;
5723 07 Sep 11 nicklas 109             break;
5723 07 Sep 11 nicklas 110           }
5723 07 Sep 11 nicklas 111         }
5723 07 Sep 11 nicklas 112       }
5723 07 Sep 11 nicklas 113     }
5723 07 Sep 11 nicklas 114     catch (PermissionDeniedException ex)
5723 07 Sep 11 nicklas 115     {}
5723 07 Sep 11 nicklas 116   }
5548 24 Jan 11 nicklas 117   final Formatter<Date> dateFormatter = FormatterFactory.getDateFormatter(sc);
5548 24 Jan 11 nicklas 118   final String dateFormat = FormatterSettings.getDateFormat(sc);
5548 24 Jan 11 nicklas 119   final String jsDateFormat = HTML.javaScriptEncode(dateFormat);
5548 24 Jan 11 nicklas 120   final String htmlDateFormat = HTML.encodeTags(dateFormat);
5548 24 Jan 11 nicklas 121   %>
6397 24 Jan 14 nicklas 122   <base:page type="popup" title="Create child bioplate - step 1/2" id="step-1">
6397 24 Jan 14 nicklas 123   <base:head scripts="subtypes.js,~wizards.js,~create_child_bioplate.js" />
6397 24 Jan 14 nicklas 124   <base:body>
6397 24 Jan 14 nicklas 125     <h1>Create child bioplate - step 1/2 <base:help helpid="bioplateevent.create-child-1" /></h1>
5548 24 Jan 11 nicklas 126     
6397 24 Jan 14 nicklas 127     <div id="page-data" class="datacontainer"
6397 24 Jan 14 nicklas 128       data-freezer-id="<%=SystemItems.getId(Hardware.FREEZER)%>"
6397 24 Jan 14 nicklas 129       data-SAMPLE="<%=Item.SAMPLE.getValue()%>"
6397 24 Jan 14 nicklas 130       data-EXTRACT="<%=Item.EXTRACT.getValue()%>"
6397 24 Jan 14 nicklas 131     ></div>
5723 07 Sep 11 nicklas 132     
5928 17 Jan 12 nicklas 133     <form name="main" action="create_child_bioplate_step2.jsp" method="post">
5928 17 Jan 12 nicklas 134     <input type="hidden" name="ID" value="<%=ID%>">
5928 17 Jan 12 nicklas 135     <input type="hidden" name="sourceplate_id" value="<%=sourcePlateId%>">
5928 17 Jan 12 nicklas 136
5928 17 Jan 12 nicklas 137     <div class="content bottomborder">
5928 17 Jan 12 nicklas 138       <table class="fullform input100">
5928 17 Jan 12 nicklas 139       <tbody class="sectionheader">
5548 24 Jan 11 nicklas 140         <tr>
5928 17 Jan 12 nicklas 141           <th colspan="3">Event</th>
5928 17 Jan 12 nicklas 142         </tr>
5928 17 Jan 12 nicklas 143       </tbody>
5928 17 Jan 12 nicklas 144       <tbody>
5928 17 Jan 12 nicklas 145         <tr>
5928 17 Jan 12 nicklas 146           <th>Event name</th>
6217 14 Dec 12 nicklas 147           <td><input class="text required" type="text" name="event_name" 
5548 24 Jan 11 nicklas 148             value="Create child plate" 
5928 17 Jan 12 nicklas 149             maxlength="<%=BioPlateEvent.MAX_NAME_LENGTH%>">
5928 17 Jan 12 nicklas 150           </td>
5928 17 Jan 12 nicklas 151           <td rowspan="4">
5928 17 Jan 12 nicklas 152             <table style="width: 100%;">
5928 17 Jan 12 nicklas 153             <tr>
5928 17 Jan 12 nicklas 154             <td>
5928 17 Jan 12 nicklas 155               <b>Description</b><br>
6217 14 Dec 12 nicklas 156               <textarea class="text" rows="4" name="event_description" id="event_description"
5928 17 Jan 12 nicklas 157                 ></textarea>
5928 17 Jan 12 nicklas 158             </td>
5928 17 Jan 12 nicklas 159             <td style="width: 20px;">
6215 13 Dec 12 nicklas 160               <base:zoom textarea="event_description" title="Event description" />
5928 17 Jan 12 nicklas 161             </td>
5928 17 Jan 12 nicklas 162             </tr>
5928 17 Jan 12 nicklas 163             </table>
5928 17 Jan 12 nicklas 164           </td>
5548 24 Jan 11 nicklas 165         </tr>
5548 24 Jan 11 nicklas 166         <tr>
5928 17 Jan 12 nicklas 167           <th>Event date</th>
5548 24 Jan 11 nicklas 168           <td>
5928 17 Jan 12 nicklas 169             <table>
5548 24 Jan 11 nicklas 170             <tr>
5548 24 Jan 11 nicklas 171             <td>
6217 14 Dec 12 nicklas 172               <input class="text" type="text" name="event_date" id="event_date" style="width: 15em;"
5548 24 Jan 11 nicklas 173                 value="<%=HTML.encodeTags(dateFormatter.format(new Date()))%>" 
5928 17 Jan 12 nicklas 174                 maxlength="20" title="Enter date in format: <%=htmlDateFormat%>">
5548 24 Jan 11 nicklas 175             </td>
5548 24 Jan 11 nicklas 176             <td>
6216 14 Dec 12 nicklas 177               <base:calendar textarea="event_date" title="Event date" />
5548 24 Jan 11 nicklas 178             </td>
5548 24 Jan 11 nicklas 179             </tr>
5548 24 Jan 11 nicklas 180             </table>
5548 24 Jan 11 nicklas 181           </td>
5548 24 Jan 11 nicklas 182         </tr>
5548 24 Jan 11 nicklas 183         <tr>
5928 17 Jan 12 nicklas 184           <th>Protocol</th>
5548 24 Jan 11 nicklas 185           <td>
5548 24 Jan 11 nicklas 186             <base:select 
5548 24 Jan 11 nicklas 187               id="protocol_id"
5548 24 Jan 11 nicklas 188               clazz="selectionlist"
5548 24 Jan 11 nicklas 189               required="false"
5548 24 Jan 11 nicklas 190               current="<%=null%>"
5548 24 Jan 11 nicklas 191               recent="<%=recentProtocols%>"
5548 24 Jan 11 nicklas 192             />
5548 24 Jan 11 nicklas 193           </td>
5548 24 Jan 11 nicklas 194         </tr>
5548 24 Jan 11 nicklas 195         <tr>
6997 03 Nov 15 nicklas 196           <th>Kit</th>
6997 03 Nov 15 nicklas 197           <td>
6997 03 Nov 15 nicklas 198             <base:select 
6997 03 Nov 15 nicklas 199               id="kit_id"
6997 03 Nov 15 nicklas 200               clazz="selectionlist"
6997 03 Nov 15 nicklas 201               required="false"
6997 03 Nov 15 nicklas 202               current="<%=null%>"
6997 03 Nov 15 nicklas 203               recent="<%=recentKits%>"
6997 03 Nov 15 nicklas 204             />
6997 03 Nov 15 nicklas 205           </td>
6997 03 Nov 15 nicklas 206         </tr>
6997 03 Nov 15 nicklas 207         <tr>
5928 17 Jan 12 nicklas 208           <th>Hardware</th>
5548 24 Jan 11 nicklas 209           <td>
5548 24 Jan 11 nicklas 210             <base:select 
5548 24 Jan 11 nicklas 211               id="hardware_id"
5548 24 Jan 11 nicklas 212               clazz="selectionlist"
5548 24 Jan 11 nicklas 213               required="false"
5548 24 Jan 11 nicklas 214               current="<%=null%>"
5548 24 Jan 11 nicklas 215               recent="<%=recentHardware%>"
5548 24 Jan 11 nicklas 216             />
5548 24 Jan 11 nicklas 217           </td>
5548 24 Jan 11 nicklas 218         </tr>
5928 17 Jan 12 nicklas 219       </tbody>
5928 17 Jan 12 nicklas 220
5928 17 Jan 12 nicklas 221       <tbody class="sectionheader">
5553 27 Jan 11 nicklas 222         <tr>
5928 17 Jan 12 nicklas 223           <th colspan="3">Child biomaterial</th>
5928 17 Jan 12 nicklas 224         </tr>
5928 17 Jan 12 nicklas 225       </tbody>
5928 17 Jan 12 nicklas 226       <tbody>
5928 17 Jan 12 nicklas 227         <tr>
5928 17 Jan 12 nicklas 228           <th>Type</th>
5553 27 Jan 11 nicklas 229           <td>
6397 24 Jan 14 nicklas 230             <select name="child_biomaterial_type" class="required selectionlist" id="child_biomaterial_type">
5553 27 Jan 11 nicklas 231               <%
5553 27 Jan 11 nicklas 232               if (sourceBioMaterialType == Item.SAMPLE)
5553 27 Jan 11 nicklas 233               {
5553 27 Jan 11 nicklas 234                 %>
5553 27 Jan 11 nicklas 235                 <option value="SAMPLE">Sample → Sample
5553 27 Jan 11 nicklas 236                 <option value="EXTRACT" selected>Sample → Extract
5553 27 Jan 11 nicklas 237                 <%
5553 27 Jan 11 nicklas 238               }
5553 27 Jan 11 nicklas 239               else if (sourceBioMaterialType == Item.EXTRACT)
5553 27 Jan 11 nicklas 240               {
5553 27 Jan 11 nicklas 241                 %>
5553 27 Jan 11 nicklas 242                 <option value="EXTRACT">Extract → Extract
5642 26 May 11 nicklas 243                 <option value="PHYSICALBIOASSAY" selected>Extract → Physical bioassay
5553 27 Jan 11 nicklas 244                 <%
5553 27 Jan 11 nicklas 245               }
5553 27 Jan 11 nicklas 246               %>
5553 27 Jan 11 nicklas 247             </select>
5553 27 Jan 11 nicklas 248           </td>
6145 21 Sep 12 nicklas 249           <td rowspan="7">
5928 17 Jan 12 nicklas 250             <table style="width: 100%;">
5928 17 Jan 12 nicklas 251             <tr>
5928 17 Jan 12 nicklas 252             <td>
5928 17 Jan 12 nicklas 253               <b>Description</b><br>
6217 14 Dec 12 nicklas 254               <textarea class="text" rows="4" name="child_description" id="child_description"></textarea>
5928 17 Jan 12 nicklas 255             </td>
5928 17 Jan 12 nicklas 256             <td style="width: 20px;">
6215 13 Dec 12 nicklas 257               <base:zoom textarea="child_description" title="Biomaterial description" />
5928 17 Jan 12 nicklas 258             </td>
5928 17 Jan 12 nicklas 259             </tr>
5928 17 Jan 12 nicklas 260             </table>
5928 17 Jan 12 nicklas 261           </td>
5553 27 Jan 11 nicklas 262         </tr>
6145 21 Sep 12 nicklas 263         <tr id="sampleSubtypesDiv" style="display: none;">
6145 21 Sep 12 nicklas 264           <th>Subtype</th>
6145 21 Sep 12 nicklas 265           <td>
6297 14 Jun 13 nicklas 266             <select name="SAMPLE_subtype_id" id="SAMPLE_subtype_id" class="selectionlist">
6145 21 Sep 12 nicklas 267               <option value="0">- none -
6145 21 Sep 12 nicklas 268               <%
6145 21 Sep 12 nicklas 269               if (sampleSubtypes != null)
6145 21 Sep 12 nicklas 270               {
5723 07 Sep 11 nicklas 271                 int currentSubtypeId = 0;
5723 07 Sep 11 nicklas 272                 if (commonSubtype != null) 
5553 27 Jan 11 nicklas 273                 {
5723 07 Sep 11 nicklas 274                   List<ItemSubtype> relatedToParent = ItemSubtype.getParentSubtypes(dc, commonSubtype, Item.SAMPLE);
5723 07 Sep 11 nicklas 275                   if (relatedToParent.size() > 0) currentSubtypeId = relatedToParent.get(0).getId();
5723 07 Sep 11 nicklas 276                 }
5723 07 Sep 11 nicklas 277                 for (ItemSubtype subtype : sampleSubtypes)
5723 07 Sep 11 nicklas 278                 {
5723 07 Sep 11 nicklas 279                   int id = subtype.getId();
5553 27 Jan 11 nicklas 280                   %>
5723 07 Sep 11 nicklas 281                   <option value="<%=id%>" 
5723 07 Sep 11 nicklas 282                     <%=id == currentSubtypeId ? "selected" : ""%>
5723 07 Sep 11 nicklas 283                     title="<%=HTML.encodeTags(subtype.getDescription()) %>"
5723 07 Sep 11 nicklas 284                     ><%=HTML.encodeTags(subtype.getName())%>
5553 27 Jan 11 nicklas 285                   <%
5553 27 Jan 11 nicklas 286                 }
6145 21 Sep 12 nicklas 287               }
6145 21 Sep 12 nicklas 288               %>
6145 21 Sep 12 nicklas 289             </select>
6145 21 Sep 12 nicklas 290           </td>
6145 21 Sep 12 nicklas 291         </tr>
6145 21 Sep 12 nicklas 292         <tr id="extractSubtypesDiv" style="display: none;">
6145 21 Sep 12 nicklas 293           <th>Subtype</th>
6145 21 Sep 12 nicklas 294           <td>
6297 14 Jun 13 nicklas 295             <select name="EXTRACT_subtype_id" id="EXTRACT_subtype_id" class="selectionlist">
6145 21 Sep 12 nicklas 296               <option value="0">- none -
6145 21 Sep 12 nicklas 297               <%
6145 21 Sep 12 nicklas 298               if (extractSubtypes != null)
6145 21 Sep 12 nicklas 299               {
5723 07 Sep 11 nicklas 300                 int currentSubtypeId = 0;
5723 07 Sep 11 nicklas 301                 if (commonSubtype != null) 
5723 07 Sep 11 nicklas 302                 {
5723 07 Sep 11 nicklas 303                   List<ItemSubtype> relatedToParent = ItemSubtype.getParentSubtypes(dc, commonSubtype, Item.EXTRACT);
5723 07 Sep 11 nicklas 304                   if (relatedToParent.size() > 0) currentSubtypeId = relatedToParent.get(0).getId();
5723 07 Sep 11 nicklas 305                 }
5723 07 Sep 11 nicklas 306                 for (ItemSubtype subtype : extractSubtypes)
5723 07 Sep 11 nicklas 307                 {
5723 07 Sep 11 nicklas 308                   int id = subtype.getId();
5723 07 Sep 11 nicklas 309                   %>
5723 07 Sep 11 nicklas 310                   <option value="<%=id%>" 
5723 07 Sep 11 nicklas 311                     <%=id == currentSubtypeId ? "selected" : ""%>
5723 07 Sep 11 nicklas 312                     title="<%=HTML.encodeTags(subtype.getDescription()) %>"
5723 07 Sep 11 nicklas 313                     ><%=HTML.encodeTags(subtype.getName())%>
5723 07 Sep 11 nicklas 314                   <%
5723 07 Sep 11 nicklas 315                 }
6145 21 Sep 12 nicklas 316               }
6145 21 Sep 12 nicklas 317               %>
6145 21 Sep 12 nicklas 318             </select>
6145 21 Sep 12 nicklas 319           </td>
6145 21 Sep 12 nicklas 320         </tr>
6145 21 Sep 12 nicklas 321         <tr id="bioAssaySubtypesDiv" style="display: none;">
6145 21 Sep 12 nicklas 322           <th>Subtype</th>
6145 21 Sep 12 nicklas 323           <td>
6297 14 Jun 13 nicklas 324             <select name="PHYSICALBIOASSAY_subtype_id" id="PHYSICALBIOASSAY_subtype_id" class="selectionlist">
6145 21 Sep 12 nicklas 325               <option value="0">- none -
6145 21 Sep 12 nicklas 326               <%
6145 21 Sep 12 nicklas 327               if (bioAssaySubtypes != null)
6145 21 Sep 12 nicklas 328               {
5723 07 Sep 11 nicklas 329                 int currentSubtypeId = 0;
5723 07 Sep 11 nicklas 330                 if (commonSubtype != null) 
5723 07 Sep 11 nicklas 331                 {
5723 07 Sep 11 nicklas 332                   List<ItemSubtype> relatedToParent = ItemSubtype.getParentSubtypes(dc, commonSubtype, Item.PHYSICALBIOASSAY);
5723 07 Sep 11 nicklas 333                   if (relatedToParent.size() > 0) currentSubtypeId = relatedToParent.get(0).getId();
5723 07 Sep 11 nicklas 334                 }
5723 07 Sep 11 nicklas 335                 for (ItemSubtype subtype : bioAssaySubtypes)
5723 07 Sep 11 nicklas 336                 {
5723 07 Sep 11 nicklas 337                   int id = subtype.getId();
5723 07 Sep 11 nicklas 338                   %>
5723 07 Sep 11 nicklas 339                   <option value="<%=id%>" 
5723 07 Sep 11 nicklas 340                     <%=id == currentSubtypeId ? "selected" : ""%>
5723 07 Sep 11 nicklas 341                     title="<%=HTML.encodeTags(subtype.getDescription()) %>"
5723 07 Sep 11 nicklas 342                     ><%=HTML.encodeTags(subtype.getName())%>
5723 07 Sep 11 nicklas 343                   <%
5723 07 Sep 11 nicklas 344                 }
6145 21 Sep 12 nicklas 345               }
6145 21 Sep 12 nicklas 346               %>
6145 21 Sep 12 nicklas 347             </select>
6145 21 Sep 12 nicklas 348           </td>
6145 21 Sep 12 nicklas 349         </tr>
5723 07 Sep 11 nicklas 350         <tr id="tagDiv" style="display: none;">
5928 17 Jan 12 nicklas 351           <th>Tag</th>
5723 07 Sep 11 nicklas 352           <td>
5723 07 Sep 11 nicklas 353             <base:select 
5723 07 Sep 11 nicklas 354               id="tag_id"
5723 07 Sep 11 nicklas 355               clazz="selectionlist"
5723 07 Sep 11 nicklas 356               required="false"
5723 07 Sep 11 nicklas 357               unselectedtext="<%=sourceBioMaterialType == Item.SAMPLE ? "- none -" : "- same as parent -" %>"
5723 07 Sep 11 nicklas 358               current="<%=null%>"
5723 07 Sep 11 nicklas 359             />
5723 07 Sep 11 nicklas 360           </td>
5723 07 Sep 11 nicklas 361         </tr>
5559 31 Jan 11 nicklas 362         <tr id="originalQuantityDiv">
5928 17 Jan 12 nicklas 363           <th>Original quantity</th>
6397 24 Jan 14 nicklas 364           <td><input class="text" type="text" name="original_quantity" id="original_quantity" style="width: 15em;"
6397 24 Jan 14 nicklas 365             maxlength="10"> (µg)</td>
5553 27 Jan 11 nicklas 366         </tr>
5553 27 Jan 11 nicklas 367         <tr>
5928 17 Jan 12 nicklas 368           <th>Used from parent</th>
6397 24 Jan 14 nicklas 369           <td><input class="text" type="text" name="used_quantity" id="used_quantity" style="width: 15em;"
6397 24 Jan 14 nicklas 370             maxlength="10"> (µg)</td>
5553 27 Jan 11 nicklas 371         </tr>
5928 17 Jan 12 nicklas 372       </tbody>
5928 17 Jan 12 nicklas 373       <tbody class="sectionheader">
5548 24 Jan 11 nicklas 374         <tr>
5928 17 Jan 12 nicklas 375           <th colspan="3">Child plates</th>
5928 17 Jan 12 nicklas 376         </tr>
5928 17 Jan 12 nicklas 377       </tbody>
5928 17 Jan 12 nicklas 378       <tbody>
5928 17 Jan 12 nicklas 379         <tr>
5928 17 Jan 12 nicklas 380           <th>No. of plates</th>
6397 24 Jan 14 nicklas 381           <td><input class="text required" type="text" name="number_of_plates" id="number_of_plates"
6397 24 Jan 14 nicklas 382             value="1" 
6397 24 Jan 14 nicklas 383             maxlength="2" style="width: 15em;"></td>
6145 21 Sep 12 nicklas 384           <td rowspan="6">
5928 17 Jan 12 nicklas 385             <table style="width: 100%;">
5928 17 Jan 12 nicklas 386             <tr>
5928 17 Jan 12 nicklas 387             <td>
5928 17 Jan 12 nicklas 388               <b>Description</b><br>
6217 14 Dec 12 nicklas 389               <textarea class="text" rows="4" name="plate_description" id="plate_description"></textarea>
5928 17 Jan 12 nicklas 390             </td>
5928 17 Jan 12 nicklas 391             <td style="width: 20px;">
6215 13 Dec 12 nicklas 392               <base:zoom textarea="plate_description" title="Plate description" />
5928 17 Jan 12 nicklas 393             </td>
5928 17 Jan 12 nicklas 394             </tr>
5928 17 Jan 12 nicklas 395             </table>
5928 17 Jan 12 nicklas 396           </td>
5548 24 Jan 11 nicklas 397         </tr>
5548 24 Jan 11 nicklas 398         <tr>
5928 17 Jan 12 nicklas 399           <th>Name prefix</th>
6217 14 Dec 12 nicklas 400           <td><input class="text required" type="text" name="plate_name_prefix" 
5548 24 Jan 11 nicklas 401             value="New plate." 
5928 17 Jan 12 nicklas 402             maxlength="<%=BioPlate.MAX_NAME_LENGTH%>"></td>
5548 24 Jan 11 nicklas 403         </tr>
5561 02 Feb 11 nicklas 404         <tr id="geometryDiv">
5928 17 Jan 12 nicklas 405           <th>Geometry</th>
5548 24 Jan 11 nicklas 406           <td>
5548 24 Jan 11 nicklas 407             <base:select 
5548 24 Jan 11 nicklas 408               id="plategeometry_id"
5548 24 Jan 11 nicklas 409               clazz="selectionlist"
5548 24 Jan 11 nicklas 410               required="true"
5548 24 Jan 11 nicklas 411               current="<%=sourceGeometry%>"
5548 24 Jan 11 nicklas 412               recent="<%=recentGeometry%>"
5548 24 Jan 11 nicklas 413               newitem="true"
5548 24 Jan 11 nicklas 414             />
5548 24 Jan 11 nicklas 415           </td>
5548 24 Jan 11 nicklas 416         </tr>
5642 26 May 11 nicklas 417         <tr id="sizeDiv" style="display: none;">
5928 17 Jan 12 nicklas 418           <th>Size of bioassay</th>
6397 24 Jan 14 nicklas 419           <td><input class="text required" type="text" name="size" id="size" style="width: 15em;"
5561 02 Feb 11 nicklas 420             value="<%=sourceGeometry.getRows() %>"
6397 24 Jan 14 nicklas 421             maxlength="10"></td>
5561 02 Feb 11 nicklas 422         </tr>
5559 31 Jan 11 nicklas 423         <tr id="plateTypeDiv">
5928 17 Jan 12 nicklas 424           <th>Plate type</th>
5548 24 Jan 11 nicklas 425           <td>
5548 24 Jan 11 nicklas 426             <base:select 
5548 24 Jan 11 nicklas 427               id="bioplatetype_id"
5548 24 Jan 11 nicklas 428               clazz="selectionlist"
5548 24 Jan 11 nicklas 429               required="true"
5548 24 Jan 11 nicklas 430               current="<%=null%>"
5548 24 Jan 11 nicklas 431               recent="<%=recentPlateTypes%>"
5548 24 Jan 11 nicklas 432               newitem="true"
5548 24 Jan 11 nicklas 433             />
5548 24 Jan 11 nicklas 434           </td>
5548 24 Jan 11 nicklas 435         </tr>
5559 31 Jan 11 nicklas 436         <tr id="freezerDiv">
6056 12 Jun 12 nicklas 437           <th>Storage location</th>
5548 24 Jan 11 nicklas 438           <td>
5548 24 Jan 11 nicklas 439             <base:select 
5548 24 Jan 11 nicklas 440               id="freezer_id"
5548 24 Jan 11 nicklas 441               clazz="selectionlist"
5548 24 Jan 11 nicklas 442               required="false"
5548 24 Jan 11 nicklas 443               current="<%=sourceFreezer%>"
5548 24 Jan 11 nicklas 444               recent="<%=recentFreezers%>"
5548 24 Jan 11 nicklas 445               newitem="true"
5548 24 Jan 11 nicklas 446             />
5548 24 Jan 11 nicklas 447           </td>
5548 24 Jan 11 nicklas 448         </tr>
5928 17 Jan 12 nicklas 449       </tbody>
5928 17 Jan 12 nicklas 450       <tr class="dynamic">
5928 17 Jan 12 nicklas 451         <th></th>
5928 17 Jan 12 nicklas 452         <td colspan="2"></td>
5928 17 Jan 12 nicklas 453       </tr>
5928 17 Jan 12 nicklas 454       </table>
5548 24 Jan 11 nicklas 455     </div>
5548 24 Jan 11 nicklas 456     </form>
5548 24 Jan 11 nicklas 457
5928 17 Jan 12 nicklas 458     <base:buttongroup subclass="dialogbuttons">
6397 24 Jan 14 nicklas 459       <base:button id="btnNext" title="Next" />
6397 24 Jan 14 nicklas 460       <base:button id="close" title="Cancel" />
5928 17 Jan 12 nicklas 461     </base:buttongroup>
5548 24 Jan 11 nicklas 462     
5548 24 Jan 11 nicklas 463   </base:body>
5548 24 Jan 11 nicklas 464   </base:page>
5548 24 Jan 11 nicklas 465   <%
5548 24 Jan 11 nicklas 466 }
5548 24 Jan 11 nicklas 467 finally
5548 24 Jan 11 nicklas 468 {
5548 24 Jan 11 nicklas 469   if (dc != null) dc.close();
5548 24 Jan 11 nicklas 470 }
5548 24 Jan 11 nicklas 471 %>

Generated on Sat Oct  7 02:44:29 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)