www/common/annotations/batch_inherit.jsp

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
6694 26 Jan 15 nicklas 1 <%-- $Id$
6694 26 Jan 15 nicklas 2   ------------------------------------------------------------------
6694 26 Jan 15 nicklas 3   Copyright (C) 2015 Nicklas Nordborg
6694 26 Jan 15 nicklas 4
6694 26 Jan 15 nicklas 5   This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
6694 26 Jan 15 nicklas 6   Available at http://base.thep.lu.se/
6694 26 Jan 15 nicklas 7
6694 26 Jan 15 nicklas 8   BASE is free software; you can redistribute it and/or
6694 26 Jan 15 nicklas 9   modify it under the terms of the GNU General Public License
6694 26 Jan 15 nicklas 10   as published by the Free Software Foundation; either version 3
6694 26 Jan 15 nicklas 11   of the License, or (at your option) any later version.
6694 26 Jan 15 nicklas 12
6694 26 Jan 15 nicklas 13   BASE is distributed in the hope that it will be useful,
6694 26 Jan 15 nicklas 14   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
6694 26 Jan 15 nicklas 15   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
6694 26 Jan 15 nicklas 16   GNU General Public License for more details.
6694 26 Jan 15 nicklas 17
6694 26 Jan 15 nicklas 18   You should have received a copy of the GNU General Public License
6694 26 Jan 15 nicklas 19   along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
6694 26 Jan 15 nicklas 20   ------------------------------------------------------------------
6694 26 Jan 15 nicklas 21 --%>
6694 26 Jan 15 nicklas 22 <%@ page pageEncoding="UTF-8" session="false"
6694 26 Jan 15 nicklas 23   import="net.sf.basedb.core.DbControl"
6694 26 Jan 15 nicklas 24   import="net.sf.basedb.core.Item"
6694 26 Jan 15 nicklas 25   import="net.sf.basedb.core.ItemContext"
6694 26 Jan 15 nicklas 26   import="net.sf.basedb.core.Nameable"
6696 28 Jan 15 nicklas 27   import="net.sf.basedb.core.AnnotationType"
6694 26 Jan 15 nicklas 28   import="net.sf.basedb.core.AnnotatedItem"
6694 26 Jan 15 nicklas 29   import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
6694 26 Jan 15 nicklas 30   import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
6694 26 Jan 15 nicklas 31   import="net.sf.basedb.clients.web.WebException"
6694 26 Jan 15 nicklas 32   import="net.sf.basedb.util.Values"
6696 28 Jan 15 nicklas 33   import="net.sf.basedb.clients.web.AnnotationUtil"
6694 26 Jan 15 nicklas 34   import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
6696 28 Jan 15 nicklas 35   import="org.json.simple.JSONObject"
6696 28 Jan 15 nicklas 36   import="org.json.simple.JSONArray"
6694 26 Jan 15 nicklas 37   import="java.util.Collections"
6694 26 Jan 15 nicklas 38   import="java.util.List"
6694 26 Jan 15 nicklas 39   import="java.util.Set"
6694 26 Jan 15 nicklas 40 %>
6694 26 Jan 15 nicklas 41 <%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
6694 26 Jan 15 nicklas 42 <%@ taglib prefix="tbl" uri="/WEB-INF/table.tld" %>
6694 26 Jan 15 nicklas 43 <%
6694 26 Jan 15 nicklas 44 final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(pageContext, true);
6694 26 Jan 15 nicklas 45 final String ID = sc.getId();
6694 26 Jan 15 nicklas 46 final Item itemType = Item.valueOf(request.getParameter("item_type"));
6694 26 Jan 15 nicklas 47 final String subContext = Values.getString(request.getParameter("subcontext"), "");
6694 26 Jan 15 nicklas 48 final ItemContext cc = sc.getCurrentContext(itemType, subContext);
6694 26 Jan 15 nicklas 49
7954 12 May 21 nicklas 50 final DbControl dc = sc.newDbControl(":Batch inherit annotations");
6694 26 Jan 15 nicklas 51 try
6694 26 Jan 15 nicklas 52 {
7605 26 Feb 19 nicklas 53   Set<AnnotatedItem> items = cc.getObject("AnnotatedItems");
7605 26 Feb 19 nicklas 54   Set<AnnotationType> annotationTypes = cc.getObject("AnnotationTypes");
6696 28 Jan 15 nicklas 55   cc.removeObject("AnnotationTypes");
6696 28 Jan 15 nicklas 56   JSONArray jsonAnnotationTypes = new JSONArray();
6696 28 Jan 15 nicklas 57   if (annotationTypes != null)
6696 28 Jan 15 nicklas 58   {
6696 28 Jan 15 nicklas 59     for (AnnotationType at : annotationTypes)
6696 28 Jan 15 nicklas 60     {
6696 28 Jan 15 nicklas 61       JSONObject jsonAnnotationType = AnnotationUtil.loadJsonForBatchInherit(dc, AnnotationType.getById(dc, at.getId()));
6696 28 Jan 15 nicklas 62       jsonAnnotationTypes.add(jsonAnnotationType);
6696 28 Jan 15 nicklas 63     }
6696 28 Jan 15 nicklas 64   }
6694 26 Jan 15 nicklas 65   %>
6694 26 Jan 15 nicklas 66   <base:page type="popup" title="Batch inherit annotations">
6694 26 Jan 15 nicklas 67   <base:head scripts="table.js,~batch_inherit.js" styles="table.css,toolbar.css">
6694 26 Jan 15 nicklas 68   <style>
6694 26 Jan 15 nicklas 69   #selectedAnnotationTypes select
6694 26 Jan 15 nicklas 70   {
6694 26 Jan 15 nicklas 71     width: calc(100% - 10px);
6694 26 Jan 15 nicklas 72   }
6694 26 Jan 15 nicklas 73   </style>
6694 26 Jan 15 nicklas 74   </base:head>
6694 26 Jan 15 nicklas 75   <base:body>
6694 26 Jan 15 nicklas 76     <h1>Batch inherit annotations to <%=items.size()%> items <base:help helpid="annotations.batch_inherit" /></h1>
6694 26 Jan 15 nicklas 77       
6696 28 Jan 15 nicklas 78     <div id="page-data" class="datacontainer"
6696 28 Jan 15 nicklas 79       data-annotation-types="<%=HTML.encodeTags(jsonAnnotationTypes.toJSONString())%>"
6696 28 Jan 15 nicklas 80     ></div>
6696 28 Jan 15 nicklas 81       
6694 26 Jan 15 nicklas 82     <div class="content">
7943 04 May 21 nicklas 83       <tbl:table id="annotations" subclass="fulltable" stickyheaders="<%=null%>" action="index.jsp">
6694 26 Jan 15 nicklas 84         <tbl:hidden name="item_type" value="<%=itemType.name() %>"/>
6694 26 Jan 15 nicklas 85         <tbl:hidden name="subcontext" value="<%=subContext %>"/>
6694 26 Jan 15 nicklas 86         
6694 26 Jan 15 nicklas 87         <tbl:columndef id="annotationType" title="Annotation type" />
6926 03 Jun 15 nicklas 88         <tbl:columndef id="action" title="Action" style="min-width: 10em;"/>
6926 03 Jun 15 nicklas 89         <tbl:columndef id="from" title="Parent item type" style="min-width: 10em;" />
6694 26 Jan 15 nicklas 90         <tbl:columndef id="options" title="Options" />
6694 26 Jan 15 nicklas 91         <div class="panelgroup bg-filled-50 bottomborder" style="height: 1.9em;">
6694 26 Jan 15 nicklas 92           <tbl:toolbar style="height: 100%;">
6694 26 Jan 15 nicklas 93             <tbl:button 
6694 26 Jan 15 nicklas 94               id="btnSelectAnnotationTypes" 
6694 26 Jan 15 nicklas 95               title="Select annotation types&hellip;" 
6694 26 Jan 15 nicklas 96               image="add.png" 
6694 26 Jan 15 nicklas 97               tooltip="Select annotations types that should be inherited"  
6694 26 Jan 15 nicklas 98             />
6694 26 Jan 15 nicklas 99           </tbl:toolbar>
6694 26 Jan 15 nicklas 100         </div>
6694 26 Jan 15 nicklas 101         <tbl:data style="top: 1.9em;">
6694 26 Jan 15 nicklas 102           <tbl:headers>
6694 26 Jan 15 nicklas 103             <tbl:headerrow>
6694 26 Jan 15 nicklas 104               <tbl:columnheaders />
6694 26 Jan 15 nicklas 105             </tbl:headerrow>
6694 26 Jan 15 nicklas 106           </tbl:headers>
6694 26 Jan 15 nicklas 107           <tbl:rows id="selectedAnnotationTypes">
6694 26 Jan 15 nicklas 108             
6694 26 Jan 15 nicklas 109             <tbl:panel subclass="bg-filled-50" id="none-selected">
6694 26 Jan 15 nicklas 110               <div class="messagecontainer note">
6694 26 Jan 15 nicklas 111               No annotation types has been selected yet.
6694 26 Jan 15 nicklas 112               </div>
6694 26 Jan 15 nicklas 113             </tbl:panel>
6694 26 Jan 15 nicklas 114           </tbl:rows>
6694 26 Jan 15 nicklas 115         </tbl:data>
6694 26 Jan 15 nicklas 116       </tbl:table>
6694 26 Jan 15 nicklas 117     </div>      
6694 26 Jan 15 nicklas 118     
6694 26 Jan 15 nicklas 119     <base:buttongroup subclass="dialogbuttons">
6694 26 Jan 15 nicklas 120       <base:button id="btnSave" title="Ok" />
6694 26 Jan 15 nicklas 121       <base:button id="close" title="Cancel" />
6694 26 Jan 15 nicklas 122     </base:buttongroup>
6694 26 Jan 15 nicklas 123   </base:body>
6694 26 Jan 15 nicklas 124   </base:page>
6694 26 Jan 15 nicklas 125   <%
6694 26 Jan 15 nicklas 126 }
6694 26 Jan 15 nicklas 127 finally
6694 26 Jan 15 nicklas 128 {
6694 26 Jan 15 nicklas 129   if (dc != null) dc.close();
6694 26 Jan 15 nicklas 130 }
6694 26 Jan 15 nicklas 131 %>

Generated on Sat Oct  7 02:44:35 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)