www/filemanager/files/ajax.jsp

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
4522 15 Sep 08 nicklas 1 <%-- $Id$
4522 15 Sep 08 nicklas 2   ------------------------------------------------------------------
4522 15 Sep 08 nicklas 3   Copyright (C) 2008 Nicklas Nordborg
4522 15 Sep 08 nicklas 4
4522 15 Sep 08 nicklas 5   This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
4522 15 Sep 08 nicklas 6   Available at http://base.thep.lu.se/
4522 15 Sep 08 nicklas 7
4522 15 Sep 08 nicklas 8   BASE is free software; you can redistribute it and/or
4522 15 Sep 08 nicklas 9   modify it under the terms of the GNU General Public License
4522 15 Sep 08 nicklas 10   as published by the Free Software Foundation; either version 3
4522 15 Sep 08 nicklas 11   of the License, or (at your option) any later version.
4522 15 Sep 08 nicklas 12
4522 15 Sep 08 nicklas 13   BASE is distributed in the hope that it will be useful,
4522 15 Sep 08 nicklas 14   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
4522 15 Sep 08 nicklas 15   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
4522 15 Sep 08 nicklas 16   GNU General Public License for more details.
4522 15 Sep 08 nicklas 17
4522 15 Sep 08 nicklas 18   You should have received a copy of the GNU General Public License
4522 15 Sep 08 nicklas 19   along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
4522 15 Sep 08 nicklas 20   ------------------------------------------------------------------
4522 15 Sep 08 nicklas 21
4522 15 Sep 08 nicklas 22   @author Nicklas
4522 15 Sep 08 nicklas 23 --%>
5558 28 Jan 11 nicklas 24 <%@ page pageEncoding="UTF-8" session="false" contentType="application/json"
4522 15 Sep 08 nicklas 25   import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
4522 15 Sep 08 nicklas 26   import="net.sf.basedb.core.DbControl"
4522 15 Sep 08 nicklas 27   import="net.sf.basedb.core.Config"
4522 15 Sep 08 nicklas 28   import="net.sf.basedb.core.File"
5136 15 Oct 09 nicklas 29   import="net.sf.basedb.core.InvalidDataException"
7654 15 Mar 19 nicklas 30   import="net.sf.basedb.core.Path"
4522 15 Sep 08 nicklas 31   import="net.sf.basedb.util.Values"
4867 31 Mar 09 nicklas 32   import="net.sf.basedb.util.FileUtil"
7654 15 Mar 19 nicklas 33   import="net.sf.basedb.util.excel.XlsxToCsvUtil"
5558 28 Jan 11 nicklas 34   import="net.sf.basedb.util.error.ThrowableUtil"
4522 15 Sep 08 nicklas 35   import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
4522 15 Sep 08 nicklas 36   import="net.sf.basedb.clients.web.WebException"
5558 28 Jan 11 nicklas 37   import="org.json.simple.JSONObject"
4867 31 Mar 09 nicklas 38   import="java.io.OutputStreamWriter"
4867 31 Mar 09 nicklas 39   import="java.io.Writer"
4867 31 Mar 09 nicklas 40   import="java.io.Reader"
7626 07 Mar 19 nicklas 41    import="java.nio.charset.Charset"
7626 07 Mar 19 nicklas 42   import="java.nio.charset.CodingErrorAction"
7626 07 Mar 19 nicklas 43   import="java.nio.charset.CharsetEncoder"
7626 07 Mar 19 nicklas 44   import="java.nio.charset.CharacterCodingException"
4522 15 Sep 08 nicklas 45 %>
4522 15 Sep 08 nicklas 46 <%
6124 13 Sep 12 nicklas 47 response.setHeader("Cache-Control", "no-cache, max-age=0");
4522 15 Sep 08 nicklas 48 final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(pageContext, true);
4522 15 Sep 08 nicklas 49 final String ID = sc.getId();
4522 15 Sep 08 nicklas 50 final String cmd = request.getParameter("cmd");
4522 15 Sep 08 nicklas 51 final String root = request.getContextPath()+"/";
4522 15 Sep 08 nicklas 52 final int itemId = Values.getInt(request.getParameter("item_id"));
7654 15 Mar 19 nicklas 53 final String path = Values.getStringOrNull(request.getParameter("path"));
4522 15 Sep 08 nicklas 54 DbControl dc = null;
4522 15 Sep 08 nicklas 55 out.clear();
5558 28 Jan 11 nicklas 56 JSONObject json = new JSONObject();
5558 28 Jan 11 nicklas 57 json.put("status", "ok");
4522 15 Sep 08 nicklas 58 try
4522 15 Sep 08 nicklas 59 {
5558 28 Jan 11 nicklas 60   if ("GetFileInfo".equals(cmd))
4522 15 Sep 08 nicklas 61   {
7954 12 May 21 nicklas 62     dc = sc.newDbControl(":Get file information");
7654 15 Mar 19 nicklas 63     File f = null;
7654 15 Mar 19 nicklas 64     if (itemId != 0)
7654 15 Mar 19 nicklas 65     {
7654 15 Mar 19 nicklas 66       f = File.getById(dc, itemId);
7654 15 Mar 19 nicklas 67     }
7654 15 Mar 19 nicklas 68     else
7654 15 Mar 19 nicklas 69     {
7654 15 Mar 19 nicklas 70       f = File.getByPath(dc, new Path(path, Path.Type.FILE), false);
7654 15 Mar 19 nicklas 71     }
5558 28 Jan 11 nicklas 72     json.put("id", f.getId());
5558 28 Jan 11 nicklas 73     json.put("name", f.getName());
5558 28 Jan 11 nicklas 74     json.put("characterSet", f.getCharacterSet());
7654 15 Mar 19 nicklas 75     json.put("mimeType", f.getMimeType());
7654 15 Mar 19 nicklas 76     if (Values.getBoolean(request.getParameter("checktype")))
7654 15 Mar 19 nicklas 77     {
7654 15 Mar 19 nicklas 78       if (XlsxToCsvUtil.seemsLikeAnExcelFile(f))
7654 15 Mar 19 nicklas 79       {
7654 15 Mar 19 nicklas 80         XlsxToCsvUtil util = new XlsxToCsvUtil();
7654 15 Mar 19 nicklas 81         try
7654 15 Mar 19 nicklas 82         {
7654 15 Mar 19 nicklas 83           util.readWorkbook(f.getDownloadStream(0));
7654 15 Mar 19 nicklas 84           json.put("excelMode", true);
7654 15 Mar 19 nicklas 85           json.put("sheets", util.getSheetNames());
7654 15 Mar 19 nicklas 86         }
7654 15 Mar 19 nicklas 87         catch (Exception ex)
7654 15 Mar 19 nicklas 88         {} // It was maybe not an Excel file after all
7654 15 Mar 19 nicklas 89       }
7654 15 Mar 19 nicklas 90     }
4522 15 Sep 08 nicklas 91     dc.close();
4522 15 Sep 08 nicklas 92   }
4867 31 Mar 09 nicklas 93   else if ("StoreFile".equals(cmd))
4867 31 Mar 09 nicklas 94   {
7626 07 Mar 19 nicklas 95     String charset = null;
4867 31 Mar 09 nicklas 96     try
4867 31 Mar 09 nicklas 97     {
5136 15 Oct 09 nicklas 98       int size = Values.getInt(request.getParameter("size"), -1);
7626 07 Mar 19 nicklas 99       charset = Values.getStringOrNull(request.getParameter("charset"));
7626 07 Mar 19 nicklas 100       
7954 12 May 21 nicklas 101       dc = sc.newDbControl(":Store file");
4867 31 Mar 09 nicklas 102       File f = File.getById(dc, itemId);
4867 31 Mar 09 nicklas 103       Reader in = request.getReader();
4867 31 Mar 09 nicklas 104       if (charset == null)
4867 31 Mar 09 nicklas 105       {
7626 07 Mar 19 nicklas 106         charset = Values.getString(f.getCharacterSet(), "UTF-8");
4867 31 Mar 09 nicklas 107       }
7626 07 Mar 19 nicklas 108       boolean charsetModified = !charset.equals(f.getCharacterSet());
7626 07 Mar 19 nicklas 109       if (charsetModified) f.setCharacterSet(charset);
7626 07 Mar 19 nicklas 110       Charset cs = Charset.forName(charset);
7626 07 Mar 19 nicklas 111       if (!cs.canEncode())
7626 07 Mar 19 nicklas 112       {
7626 07 Mar 19 nicklas 113         throw new UnsupportedOperationException("Encoding is not supported by '" + charset + "'.");
7626 07 Mar 19 nicklas 114       }
7626 07 Mar 19 nicklas 115       CharsetEncoder encoder = Charset.forName(charset).newEncoder();
7626 07 Mar 19 nicklas 116       encoder.onMalformedInput(CodingErrorAction.REPORT);
7626 07 Mar 19 nicklas 117       encoder.onUnmappableCharacter(CodingErrorAction.REPORT);
4867 31 Mar 09 nicklas 118       Writer toFile = new OutputStreamWriter(
7626 07 Mar 19 nicklas 119           f.getUploadStream(false, f.isCompressed()), encoder);
5136 15 Oct 09 nicklas 120       int copied = (int)FileUtil.copy(in, toFile);
5136 15 Oct 09 nicklas 121       if (size >= 0 && copied != size)
5136 15 Oct 09 nicklas 122       {
5136 15 Oct 09 nicklas 123         throw new InvalidDataException("Incomplete file; expected " + size + 
5136 15 Oct 09 nicklas 124           " bytes; got " + copied + ".");
5136 15 Oct 09 nicklas 125       }
4867 31 Mar 09 nicklas 126       toFile.flush();
4867 31 Mar 09 nicklas 127       toFile.close();
4867 31 Mar 09 nicklas 128       dc.commit();
7626 07 Mar 19 nicklas 129       json.put("message", "File saved " + (charsetModified ? " with character set " + charset : " successfully"));
4867 31 Mar 09 nicklas 130     }
7626 07 Mar 19 nicklas 131     catch (CharacterCodingException ex)
7626 07 Mar 19 nicklas 132     {
7626 07 Mar 19 nicklas 133       throw new Exception("Save failed: The text contains characters that can't be encoded in '" + charset + "'.");
7626 07 Mar 19 nicklas 134     }
4867 31 Mar 09 nicklas 135     catch (Exception ex)
4867 31 Mar 09 nicklas 136     {
5558 28 Jan 11 nicklas 137       throw new Exception("Save failed: " + ex.getMessage(), ex);
4867 31 Mar 09 nicklas 138     }
4867 31 Mar 09 nicklas 139   }
4522 15 Sep 08 nicklas 140   else
4522 15 Sep 08 nicklas 141   {
4522 15 Sep 08 nicklas 142     throw new WebException("popup", "Invalid command", "The command {1} is not recognised as a valid command.", cmd);
4522 15 Sep 08 nicklas 143   }
4522 15 Sep 08 nicklas 144 }
5558 28 Jan 11 nicklas 145 catch (Throwable t)
5558 28 Jan 11 nicklas 146 {
5558 28 Jan 11 nicklas 147   t.printStackTrace();
5558 28 Jan 11 nicklas 148   json.clear();
5558 28 Jan 11 nicklas 149   json.put("status", "error");
5558 28 Jan 11 nicklas 150   json.put("message", t.getMessage());
5558 28 Jan 11 nicklas 151   json.put("stacktrace", ThrowableUtil.stackTraceToString(t));
5558 28 Jan 11 nicklas 152 }
4522 15 Sep 08 nicklas 153 finally
4522 15 Sep 08 nicklas 154 {
5558 28 Jan 11 nicklas 155   json.writeJSONString(out);
5558 28 Jan 11 nicklas 156   out.flush();
4522 15 Sep 08 nicklas 157   if (dc != null) dc.close();
4522 15 Sep 08 nicklas 158 }
4522 15 Sep 08 nicklas 159 %>

Generated on Sat Oct  7 02:45:34 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)