www/views/experiments/explorer/search/index.jsp

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2487 04 Aug 06 nicklas 1 <%-- $Id$
2487 04 Aug 06 nicklas 2   ------------------------------------------------------------------
2487 04 Aug 06 nicklas 3   Copyright (C) 2006 Nicklas Nordborg
2487 04 Aug 06 nicklas 4
2487 04 Aug 06 nicklas 5   This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
2487 04 Aug 06 nicklas 6   Available at http://base.thep.lu.se/
2487 04 Aug 06 nicklas 7
2487 04 Aug 06 nicklas 8   This file is part of BASE.
2487 04 Aug 06 nicklas 9
2487 04 Aug 06 nicklas 10   BASE is free software; you can redistribute it and/or
2487 04 Aug 06 nicklas 11   modify it under the terms of the GNU General Public License
4476 05 Sep 08 jari 12   as published by the Free Software Foundation; either version 3
2487 04 Aug 06 nicklas 13   of the License, or (at your option) any later version.
2487 04 Aug 06 nicklas 14
2487 04 Aug 06 nicklas 15   BASE is distributed in the hope that it will be useful,
2487 04 Aug 06 nicklas 16   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
2487 04 Aug 06 nicklas 17   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
2487 04 Aug 06 nicklas 18   GNU General Public License for more details.
2487 04 Aug 06 nicklas 19
2487 04 Aug 06 nicklas 20   You should have received a copy of the GNU General Public License
4511 11 Sep 08 jari 21   along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
2487 04 Aug 06 nicklas 22   ------------------------------------------------------------------
2487 04 Aug 06 nicklas 23
2487 04 Aug 06 nicklas 24   @author Nicklas
2487 04 Aug 06 nicklas 25   @version 2.0
2487 04 Aug 06 nicklas 26 --%>
5426 24 Sep 10 nicklas 27 <%@ page pageEncoding="UTF-8" session="false"
2487 04 Aug 06 nicklas 28   import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
2487 04 Aug 06 nicklas 29   import="net.sf.basedb.core.DbControl"
2487 04 Aug 06 nicklas 30   import="net.sf.basedb.core.Item"
2487 04 Aug 06 nicklas 31   import="net.sf.basedb.core.ItemContext"
2487 04 Aug 06 nicklas 32   import="net.sf.basedb.core.BioAssaySet"
5711 30 Aug 11 nicklas 33   import="net.sf.basedb.core.DynamicReporterQuery"
2487 04 Aug 06 nicklas 34   import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
2487 04 Aug 06 nicklas 35   import="net.sf.basedb.clients.web.ExperimentExplorer"
2487 04 Aug 06 nicklas 36   import="net.sf.basedb.clients.web.WebException"
2753 20 Oct 06 nicklas 37   import="net.sf.basedb.util.Values"
2487 04 Aug 06 nicklas 38   import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
4306 21 May 08 nicklas 39   import="java.util.Collections"
2487 04 Aug 06 nicklas 40 %>
2487 04 Aug 06 nicklas 41 <%
2487 04 Aug 06 nicklas 42 final int bioAssaySetId = Values.getInt(request.getParameter("bioassayset_id"));
2487 04 Aug 06 nicklas 43 final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(pageContext, true);
2487 04 Aug 06 nicklas 44 final String ID = sc.getId();
2487 04 Aug 06 nicklas 45 final String cmd = request.getParameter("cmd");
2487 04 Aug 06 nicklas 46 final String root = request.getContextPath()+"/";
2487 04 Aug 06 nicklas 47
2487 04 Aug 06 nicklas 48 final String listPage = "list.jsp?ID="+ID+"&bioassayset_id="+bioAssaySetId;
2487 04 Aug 06 nicklas 49
2487 04 Aug 06 nicklas 50 String forward = null;
2487 04 Aug 06 nicklas 51 String redirect = null;
2487 04 Aug 06 nicklas 52 String message = null;
2487 04 Aug 06 nicklas 53
2487 04 Aug 06 nicklas 54 DbControl dc = null;
2487 04 Aug 06 nicklas 55 try
2487 04 Aug 06 nicklas 56 {
7954 12 May 21 nicklas 57   dc = sc.newDbControl(":Experiment explorer search");
2487 04 Aug 06 nicklas 58   BioAssaySet bioAssaySet = BioAssaySet.getById(dc, bioAssaySetId);
2487 04 Aug 06 nicklas 59   ExperimentExplorer explorer = ExperimentExplorer.getExplorer(bioAssaySet);
2487 04 Aug 06 nicklas 60   if (cmd == null || "List".equals(cmd))
2487 04 Aug 06 nicklas 61   {
2490 08 Aug 06 nicklas 62     ItemContext cc = explorer.getAndSetReporterContext(sc, null);
2487 04 Aug 06 nicklas 63     redirect = listPage;
2487 04 Aug 06 nicklas 64   }
2487 04 Aug 06 nicklas 65   else if ("UpdateContext".equals(cmd))
2487 04 Aug 06 nicklas 66   {
2490 08 Aug 06 nicklas 67     ItemContext cc = explorer.getAndSetReporterContext(sc, pageContext);
2487 04 Aug 06 nicklas 68     redirect = listPage;
2487 04 Aug 06 nicklas 69   }
4306 21 May 08 nicklas 70   else if ("CreateReporterList".equals(cmd))
4306 21 May 08 nicklas 71   {
4306 21 May 08 nicklas 72     ItemContext cc = explorer.getAndSetReporterContext(sc, pageContext);
5711 30 Aug 11 nicklas 73     cc.setObject("reporter-list-creator", explorer);
4306 21 May 08 nicklas 74     redirect = "../../../reporterlists/index.jsp?ID="+ID+
4456 05 Sep 08 martin 75         "&cmd=NewItem&addReporters=1&formId=reporters&fromContext=" + cc.getItemType().name() + 
4306 21 May 08 nicklas 76         "&subContext="+cc.getSubContext() + "&name=" + HTML.urlEncode(bioAssaySet.getName());
4306 21 May 08 nicklas 77   }
4306 21 May 08 nicklas 78
2487 04 Aug 06 nicklas 79   else
2487 04 Aug 06 nicklas 80   {
2487 04 Aug 06 nicklas 81     throw new WebException("popup", "Invalid command", "The command {1} is not recognised as a valid command.", cmd);
2487 04 Aug 06 nicklas 82   }
2487 04 Aug 06 nicklas 83 }
2487 04 Aug 06 nicklas 84 finally
2487 04 Aug 06 nicklas 85 {
2487 04 Aug 06 nicklas 86   if (dc != null) dc.close();
2487 04 Aug 06 nicklas 87 }
2487 04 Aug 06 nicklas 88 if (forward != null)
2487 04 Aug 06 nicklas 89 {
6192 31 Oct 12 nicklas 90   sc.setSessionSetting("alert-message", message);
2487 04 Aug 06 nicklas 91   pageContext.forward(forward);
2487 04 Aug 06 nicklas 92 }
2487 04 Aug 06 nicklas 93 else if (redirect != null)
2487 04 Aug 06 nicklas 94 {
6192 31 Oct 12 nicklas 95   sc.setSessionSetting("alert-message", message);
2487 04 Aug 06 nicklas 96   response.sendRedirect(redirect);
2487 04 Aug 06 nicklas 97 }
2487 04 Aug 06 nicklas 98 else if (message == null)
2487 04 Aug 06 nicklas 99 {
2487 04 Aug 06 nicklas 100   response.sendRedirect(root + "common/close_popup.jsp?refresh_opener=1&wait=0");
2487 04 Aug 06 nicklas 101 }
2487 04 Aug 06 nicklas 102 else
2487 04 Aug 06 nicklas 103 {
2487 04 Aug 06 nicklas 104   response.sendRedirect(root + "common/close_popup.jsp?refresh_opener=1&message="+HTML.urlEncode(message));
2487 04 Aug 06 nicklas 105 }
2487 04 Aug 06 nicklas 106
2487 04 Aug 06 nicklas 107 %>
2487 04 Aug 06 nicklas 108
2487 04 Aug 06 nicklas 109
2487 04 Aug 06 nicklas 110
2487 04 Aug 06 nicklas 111

Generated on Sat Oct  7 02:47:28 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)