www/views/experiments/rootrawbioassays/bioassays.js

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
7604 25 Feb 19 nicklas 1 /* $Id $
7604 25 Feb 19 nicklas 2   ------------------------------------------------------------------
7604 25 Feb 19 nicklas 3   Copyright (C) 2013 Nicklas Nordborg
7604 25 Feb 19 nicklas 4
7604 25 Feb 19 nicklas 5   This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
7604 25 Feb 19 nicklas 6   Available at http://base.thep.lu.se/
7604 25 Feb 19 nicklas 7
7604 25 Feb 19 nicklas 8   BASE is free software; you can redistribute it and/or
7604 25 Feb 19 nicklas 9   modify it under the terms of the GNU General Public License
7604 25 Feb 19 nicklas 10   as published by the Free Software Foundation; either version 3
7604 25 Feb 19 nicklas 11   of the License, or (at your option) any later version.
7604 25 Feb 19 nicklas 12
7604 25 Feb 19 nicklas 13   BASE is distributed in the hope that it will be useful,
7604 25 Feb 19 nicklas 14   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
7604 25 Feb 19 nicklas 15   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
7604 25 Feb 19 nicklas 16   GNU General Public License for more details.
7604 25 Feb 19 nicklas 17
7604 25 Feb 19 nicklas 18   You should have received a copy of the GNU General Public License
7604 25 Feb 19 nicklas 19   along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
7604 25 Feb 19 nicklas 20   ------------------------------------------------------------------
7604 25 Feb 19 nicklas 21
7604 25 Feb 19 nicklas 22   @author Nicklas
7604 25 Feb 19 nicklas 23 */
7604 25 Feb 19 nicklas 24 'use strict';
7604 25 Feb 19 nicklas 25
7604 25 Feb 19 nicklas 26 var BioAssays = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 27 {
7604 25 Feb 19 nicklas 28   var bioassays = {};
7604 25 Feb 19 nicklas 29   
7604 25 Feb 19 nicklas 30   /**
7604 25 Feb 19 nicklas 31     Initialize the page.
7604 25 Feb 19 nicklas 32   */
7604 25 Feb 19 nicklas 33   bioassays.initPage = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 34   {
7604 25 Feb 19 nicklas 35     var pageId = Doc.getPageId();
7604 25 Feb 19 nicklas 36     if (pageId == 'edit-page')
7604 25 Feb 19 nicklas 37     {
7604 25 Feb 19 nicklas 38       // Save + Close buttons
7604 25 Feb 19 nicklas 39       Buttons.addClickHandler('btnSave', bioassays.save);
7604 25 Feb 19 nicklas 40       Buttons.addClickHandler('close', App.closeWindow);
7604 25 Feb 19 nicklas 41
7604 25 Feb 19 nicklas 42       // Tab validation
7604 25 Feb 19 nicklas 43       TabControl.addTabActivateListener('settings.annotations', Annotations.onSwitchToAnnotationsTab);
7604 25 Feb 19 nicklas 44       TabControl.addTabValidator('settings.info', bioassays.validateBioAssay);
7604 25 Feb 19 nicklas 45     }
7604 25 Feb 19 nicklas 46     else if (pageId == 'view-page')
7604 25 Feb 19 nicklas 47     {
7604 25 Feb 19 nicklas 48       var itemId = Data.get('page-data', 'item-id');
7604 25 Feb 19 nicklas 49       var attributes = {'item-type': 'ROOTRAWBIOASSAY', 'item-id': itemId};
7604 25 Feb 19 nicklas 50       
7604 25 Feb 19 nicklas 51       Buttons.addClickHandler('btnEdit', Buttons.editItem, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 52       Buttons.addClickHandler('btnExport', Buttons.runPlugin, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 53       Buttons.addClickHandler('btnImport', Buttons.runPlugin, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 54       Buttons.addClickHandler('btnRunPlugin', Buttons.runPlugin, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 55       
7604 25 Feb 19 nicklas 56       TabControl.addTabActivateListener('main.annotations', AnnotationsList.loadOnce);
7604 25 Feb 19 nicklas 57     }
7604 25 Feb 19 nicklas 58   }
7604 25 Feb 19 nicklas 59   
7604 25 Feb 19 nicklas 60   bioassays.initElements = function(element, autoInit)
7604 25 Feb 19 nicklas 61   {
7604 25 Feb 19 nicklas 62      if (autoInit == 'edit-experimental-factor')
7604 25 Feb 19 nicklas 63     {
7604 25 Feb 19 nicklas 64       Buttons.addClickHandler(element, bioassays.editExperimentalFactor);
7604 25 Feb 19 nicklas 65     }
7604 25 Feb 19 nicklas 66   }
7604 25 Feb 19 nicklas 67
7604 25 Feb 19 nicklas 68
7604 25 Feb 19 nicklas 69   bioassays.editExperimentalFactor = function(event)
7604 25 Feb 19 nicklas 70   {
7604 25 Feb 19 nicklas 71     var url = App.getRoot() + 'common/annotations/annotate.jsp?ID='+App.getSessionId();
7604 25 Feb 19 nicklas 72     url += '&item_type='+Data.get(event.currentTarget, 'item-type');
7604 25 Feb 19 nicklas 73     url += '&item_id='+Data.get(event.currentTarget, 'item-id');
7604 25 Feb 19 nicklas 74     url += '&annotationtype_id='+Data.get(event.currentTarget, 'annotation-type-id');
7604 25 Feb 19 nicklas 75     url += '&annotation_id='+Data.get(event.currentTarget, 'annotation-id');
7604 25 Feb 19 nicklas 76     url += '&standalone=1';
7604 25 Feb 19 nicklas 77     Dialogs.openPopup(url, 'EditAnnotation', 750, 500);
7604 25 Feb 19 nicklas 78   }
7604 25 Feb 19 nicklas 79   
7604 25 Feb 19 nicklas 80   bioassays.validateBioAssay = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 81   {
7604 25 Feb 19 nicklas 82     var frm = document.forms['bioAssay'];
7604 25 Feb 19 nicklas 83     if (Strings.trim(frm.name.value) == '')
7604 25 Feb 19 nicklas 84     {
7604 25 Feb 19 nicklas 85       Forms.showNotification(frm.name, 'You must enter a name');
7604 25 Feb 19 nicklas 86       return false;
7604 25 Feb 19 nicklas 87     }
7604 25 Feb 19 nicklas 88     return true;
7604 25 Feb 19 nicklas 89   }
7604 25 Feb 19 nicklas 90   
7604 25 Feb 19 nicklas 91   bioassays.save = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 92   {
7604 25 Feb 19 nicklas 93     var frm = document.forms['bioAssay'];
7604 25 Feb 19 nicklas 94     if (TabControl.validateActiveTab('settings'))
7604 25 Feb 19 nicklas 95     {
7604 25 Feb 19 nicklas 96       Annotations.saveModifiedAnnotationsToForm(frm);
7604 25 Feb 19 nicklas 97       frm.submit();
7604 25 Feb 19 nicklas 98     }
7604 25 Feb 19 nicklas 99   }
7604 25 Feb 19 nicklas 100
7604 25 Feb 19 nicklas 101
7604 25 Feb 19 nicklas 102   return bioassays;
7604 25 Feb 19 nicklas 103 }();
7604 25 Feb 19 nicklas 104
7604 25 Feb 19 nicklas 105 Doc.onLoad(BioAssays.initPage);
7604 25 Feb 19 nicklas 106 Doc.addElementInitializer(BioAssays.initElements);
7604 25 Feb 19 nicklas 107