www/views/physicalbioassays/bioassays.js

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
7604 25 Feb 19 nicklas 1 /* $Id $
7604 25 Feb 19 nicklas 2   ------------------------------------------------------------------
7604 25 Feb 19 nicklas 3   Copyright (C) 2013 Nicklas Nordborg
7604 25 Feb 19 nicklas 4
7604 25 Feb 19 nicklas 5   This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
7604 25 Feb 19 nicklas 6   Available at http://base.thep.lu.se/
7604 25 Feb 19 nicklas 7
7604 25 Feb 19 nicklas 8   BASE is free software; you can redistribute it and/or
7604 25 Feb 19 nicklas 9   modify it under the terms of the GNU General Public License
7604 25 Feb 19 nicklas 10   as published by the Free Software Foundation; either version 3
7604 25 Feb 19 nicklas 11   of the License, or (at your option) any later version.
7604 25 Feb 19 nicklas 12
7604 25 Feb 19 nicklas 13   BASE is distributed in the hope that it will be useful,
7604 25 Feb 19 nicklas 14   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
7604 25 Feb 19 nicklas 15   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
7604 25 Feb 19 nicklas 16   GNU General Public License for more details.
7604 25 Feb 19 nicklas 17
7604 25 Feb 19 nicklas 18   You should have received a copy of the GNU General Public License
7604 25 Feb 19 nicklas 19   along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
7604 25 Feb 19 nicklas 20   ------------------------------------------------------------------
7604 25 Feb 19 nicklas 21
7604 25 Feb 19 nicklas 22   @author Nicklas
7604 25 Feb 19 nicklas 23 */
7604 25 Feb 19 nicklas 24 'use strict';
7604 25 Feb 19 nicklas 25
7604 25 Feb 19 nicklas 26 var BioAssays = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 27 {
7604 25 Feb 19 nicklas 28   var bioassays = {};
7604 25 Feb 19 nicklas 29   
7604 25 Feb 19 nicklas 30   /**
7604 25 Feb 19 nicklas 31     Initialize the page.
7604 25 Feb 19 nicklas 32   */
7604 25 Feb 19 nicklas 33   bioassays.initPage = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 34   {
7604 25 Feb 19 nicklas 35     var pageId = Doc.getPageId();
7604 25 Feb 19 nicklas 36     if (pageId == 'edit-page')
7604 25 Feb 19 nicklas 37     {
7604 25 Feb 19 nicklas 38       // Save + Close buttons
7604 25 Feb 19 nicklas 39       Buttons.addClickHandler('btnSave', bioassays.save);
7604 25 Feb 19 nicklas 40       Buttons.addClickHandler('close', App.closeWindow);
7604 25 Feb 19 nicklas 41
7604 25 Feb 19 nicklas 42       // Tab validation
7604 25 Feb 19 nicklas 43       TabControl.addTabActivateListener('settings.annotations', bioassays.loadAnnotationsFrame);
7604 25 Feb 19 nicklas 44       TabControl.addTabValidator('settings.info', bioassays.validatePhysicalBioAssay);
7604 25 Feb 19 nicklas 45       
7604 25 Feb 19 nicklas 46       // Size
7604 25 Feb 19 nicklas 47       Events.addEventHandler('size', 'keypress', Events.integerOnly);
7604 25 Feb 19 nicklas 48       
7604 25 Feb 19 nicklas 49       // Protocol
7604 25 Feb 19 nicklas 50       Buttons.addClickHandler('protocol_id.select', bioassays.selectProtocol);
7604 25 Feb 19 nicklas 51       Events.addEventHandler('protocol_id', 'base-selected', Items.onItemSelected);
7604 25 Feb 19 nicklas 52
7604 25 Feb 19 nicklas 53       // Subtype
7604 25 Feb 19 nicklas 54       Events.addEventHandler('subtype_id', 'change', bioassays.subtypeOnChange);
7604 25 Feb 19 nicklas 55
7604 25 Feb 19 nicklas 56       // Hardware
7604 25 Feb 19 nicklas 57       Buttons.addClickHandler('hardware_id.select', bioassays.selectHardware);
7604 25 Feb 19 nicklas 58       Events.addEventHandler('hardware_id', 'base-selected', Items.onItemSelected);
7604 25 Feb 19 nicklas 59
7604 25 Feb 19 nicklas 60       // Kit
7604 25 Feb 19 nicklas 61       Buttons.addClickHandler('kit_id.select', bioassays.selectKit);
7604 25 Feb 19 nicklas 62       Events.addEventHandler('kit_id', 'base-selected', Items.onItemSelected);
7604 25 Feb 19 nicklas 63       
7604 25 Feb 19 nicklas 64       // Array slide
7604 25 Feb 19 nicklas 65       Buttons.addClickHandler('arrayslide_id.select', bioassays.selectArraySlide);
7604 25 Feb 19 nicklas 66       Events.addEventHandler('arrayslide_id', 'base-selected', Items.onItemSelected);
7604 25 Feb 19 nicklas 67       Events.addEventHandler('arrayslide_id', 'change', bioassays.arraySlideOnChange);
7604 25 Feb 19 nicklas 68       
7604 25 Feb 19 nicklas 69       // Parent extracts
7604 25 Feb 19 nicklas 70       Events.addEventHandler('extracts', 'change', bioassays.extractsOnChange);
7604 25 Feb 19 nicklas 71       Buttons.addClickHandler('btnAddExtracts', bioassays.addExtracts);
7604 25 Feb 19 nicklas 72       Events.addEventHandler('btnAddExtracts', 'base-selected', bioassays.addExtractCallback);
7604 25 Feb 19 nicklas 73       
7604 25 Feb 19 nicklas 74       // Used quantity and position
7604 25 Feb 19 nicklas 75       Events.addEventHandler('used_quantity', 'keypress', Events.numberOnly);
7604 25 Feb 19 nicklas 76       Events.addEventHandler('used_quantity', 'keyup', bioassays.usedQuantityOnBlur);
7604 25 Feb 19 nicklas 77       Events.addEventHandler('position', 'keypress', Events.integerOnly);
7604 25 Feb 19 nicklas 78       Events.addEventHandler('position', 'keyup', bioassays.usedQuantityOnBlur);
7604 25 Feb 19 nicklas 79     }
7604 25 Feb 19 nicklas 80     else if (pageId == 'view-page')
7604 25 Feb 19 nicklas 81     {
7604 25 Feb 19 nicklas 82       var itemId = Data.get('page-data', 'item-id');
7604 25 Feb 19 nicklas 83       var attributes = {'item-type': 'PHYSICALBIOASSAY', 'item-id': itemId};
7604 25 Feb 19 nicklas 84       
7604 25 Feb 19 nicklas 85       Buttons.addClickHandler('btnEdit', Buttons.editItem, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 86       Buttons.addClickHandler('btnDelete', Buttons.deleteItem, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 87       Buttons.addClickHandler('btnRestore', Buttons.restoreItem, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 88       Buttons.addClickHandler('btnUsingItems', Buttons.showUsingItems, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 89       Buttons.addClickHandler('btnDeletePermanently', Buttons.deleteItemPermanently, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 90       Buttons.addClickHandler('btnShare', Buttons.shareItem, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 91       Buttons.addClickHandler('btnSetOwner', Buttons.setOwner, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 92       Buttons.addClickHandler('btnNewDerivedBioAssay', bioassays.newDerivedBioAssay, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 93       Buttons.addClickHandler('btnExport', Buttons.runPlugin, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 94       Buttons.addClickHandler('btnImport', Buttons.runPlugin, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 95       Buttons.addClickHandler('btnRunPlugin', Buttons.runPlugin, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 96       
7604 25 Feb 19 nicklas 97       TabControl.addTabActivateListener('main.annotations', AnnotationsList.loadOnce);
7604 25 Feb 19 nicklas 98       TabControl.addTabActivateListener('main.overview', Overview.loadOnce);
7604 25 Feb 19 nicklas 99       TabControl.addTabActivateListener('main.history', History.loadOnce);
7604 25 Feb 19 nicklas 100     }
7604 25 Feb 19 nicklas 101     else if (pageId == 'list-page')
7604 25 Feb 19 nicklas 102     {
7604 25 Feb 19 nicklas 103       var attributes = {'item-type': 'PHYSICALBIOASSAY'};
7604 25 Feb 19 nicklas 104       var tableAttributes = {'table-id': 'bioassays'};
7604 25 Feb 19 nicklas 105       Buttons.addClickHandler('btnNewItem', Buttons.newItem, attributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 106       Buttons.addClickHandler('btnDeleteItems', Buttons.deleteItems, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 107       Buttons.addClickHandler('btnRestoreItems', Buttons.restoreItems, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 108       Buttons.addClickHandler('btnShareItems', Buttons.shareItems, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 109       Buttons.addClickHandler('btnSetOwner', Buttons.setOwnerOfItems, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 110       Buttons.addClickHandler('btnColumns', Buttons.configureColumns, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 111       Buttons.addClickHandler('btnInheritAnnotations', Buttons.inheritAnnotations, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 112       Buttons.addClickHandler('btnExport', Buttons.runListPlugin, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 113       Buttons.addClickHandler('btnImport', Buttons.runListPlugin, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 114       Buttons.addClickHandler('btnRunPlugin', Buttons.runListPlugin, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 115       Buttons.addClickHandler('btnNewMergedDerivedBioAssay', bioassays.newMergedDerivedBioAssay);
7604 25 Feb 19 nicklas 116       Buttons.addClickHandler('btnNewItemList', bioassays.newItemListOnClick);
7813 19 May 20 nicklas 117       Buttons.addClickHandler('btnAddToItemList', bioassays.addToItemListOnClick);
7604 25 Feb 19 nicklas 118
7604 25 Feb 19 nicklas 119       Buttons.addClickHandler('close', App.closeWindow);
7604 25 Feb 19 nicklas 120       Buttons.addClickHandler('btnOk', Buttons.returnSelected, tableAttributes);
7604 25 Feb 19 nicklas 121     }
7604 25 Feb 19 nicklas 122   }
7604 25 Feb 19 nicklas 123   
7604 25 Feb 19 nicklas 124   bioassays.initElements = function(element, autoInit)
7604 25 Feb 19 nicklas 125   {
7604 25 Feb 19 nicklas 126     if (autoInit == 'new-derived-bioassay')
7604 25 Feb 19 nicklas 127     {
7604 25 Feb 19 nicklas 128       Buttons.addClickHandler(element, bioassays.newDerivedBioAssay);
7604 25 Feb 19 nicklas 129     }
7604 25 Feb 19 nicklas 130   }
7604 25 Feb 19 nicklas 131   
7604 25 Feb 19 nicklas 132   bioassays.newMergedDerivedBioAssay = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 133   {
7604 25 Feb 19 nicklas 134     if (!Table.checkIfSelected('bioassays'))
7604 25 Feb 19 nicklas 135     {
7604 25 Feb 19 nicklas 136       return;
7604 25 Feb 19 nicklas 137     }
7604 25 Feb 19 nicklas 138     Table.submitToPopup('bioassays', 'NewMergedDerivedBioAssay', 750, 500);
7604 25 Feb 19 nicklas 139   }
7604 25 Feb 19 nicklas 140
7604 25 Feb 19 nicklas 141   bioassays.newDerivedBioAssay = function(event)
7604 25 Feb 19 nicklas 142   {
7604 25 Feb 19 nicklas 143     var parentId = Data.int(event.currentTarget, 'item-id');
7604 25 Feb 19 nicklas 144     Items.newItem('DERIVEDBIOASSAY', '&physicalbioassay_id='+parentId);
7604 25 Feb 19 nicklas 145   }
7813 19 May 20 nicklas 146   // Add selected bioassays to an existing item list
7813 19 May 20 nicklas 147   bioassays.addToItemListOnClick = function()
7813 19 May 20 nicklas 148   {
7813 19 May 20 nicklas 149     Table.submitToPopup('bioassays', 'AddItemsToList', 450, 300);
7813 19 May 20 nicklas 150   }
7604 25 Feb 19 nicklas 151   
7604 25 Feb 19 nicklas 152   // Create a new item list with the selected items as members
7604 25 Feb 19 nicklas 153   bioassays.newItemListOnClick = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 154   {
7604 25 Feb 19 nicklas 155     var controller = Items.getController('ITEMLIST');
7604 25 Feb 19 nicklas 156     Table.submitToPopup('bioassays', 'CreateItemList', controller.width, controller.height);
7604 25 Feb 19 nicklas 157   }
7604 25 Feb 19 nicklas 158
7604 25 Feb 19 nicklas 159   bioassays.validatePhysicalBioAssay = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 160   {
7604 25 Feb 19 nicklas 161     var frm = document.forms['bioassay'];
7604 25 Feb 19 nicklas 162     if (Strings.trim(frm.name.value) == '')
7604 25 Feb 19 nicklas 163     {
7604 25 Feb 19 nicklas 164       Forms.showNotification(frm.name, 'You must enter a name');
7604 25 Feb 19 nicklas 165       return false;
7604 25 Feb 19 nicklas 166     }
7604 25 Feb 19 nicklas 167     else if (!Numbers.isInteger(frm.size.value))
7604 25 Feb 19 nicklas 168     {
7604 25 Feb 19 nicklas 169       Forms.showNotification(frm.size, "'" + frm.size.value + "' is not a valid number");
7604 25 Feb 19 nicklas 170       return false;
7604 25 Feb 19 nicklas 171     }
7604 25 Feb 19 nicklas 172     else if (parseInt(frm.size.value) <= 0)
7604 25 Feb 19 nicklas 173     {
7604 25 Feb 19 nicklas 174       Forms.showNotification(frm.size, "Size must be &gt;0");
7604 25 Feb 19 nicklas 175       return false;
7604 25 Feb 19 nicklas 176     }
7604 25 Feb 19 nicklas 177     return true;
7604 25 Feb 19 nicklas 178   }
7604 25 Feb 19 nicklas 179
7604 25 Feb 19 nicklas 180   bioassays.save = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 181   {
7604 25 Feb 19 nicklas 182     var frm = document.forms['bioassay'];
7604 25 Feb 19 nicklas 183     if (TabControl.validateActiveTab('settings'))
7604 25 Feb 19 nicklas 184     {
7604 25 Feb 19 nicklas 185       Annotations.saveModifiedAnnotationsToForm(frm);
7604 25 Feb 19 nicklas 186       Link.exportActions('extracts');
7604 25 Feb 19 nicklas 187       frm.submit();
7604 25 Feb 19 nicklas 188     }
7604 25 Feb 19 nicklas 189   }
7604 25 Feb 19 nicklas 190
7604 25 Feb 19 nicklas 191   bioassays.loadAnnotationsFrame = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 192   {
7604 25 Feb 19 nicklas 193     Annotations.autoLoadEditFrame(bioassays.getProtocolId(), ItemSubtype.getSubtypeId('subtype_id'), bioassays.getParents());
7604 25 Feb 19 nicklas 194   }
7604 25 Feb 19 nicklas 195   
7604 25 Feb 19 nicklas 196   bioassays.getProtocolId = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 197   {
7604 25 Feb 19 nicklas 198     var frm = document.forms['bioassay'];
7604 25 Feb 19 nicklas 199     var protocolId = 0;
7604 25 Feb 19 nicklas 200     if (frm.protocol_id.length > 0 && !frm.protocol_id.disabled) 
7604 25 Feb 19 nicklas 201     {
7604 25 Feb 19 nicklas 202       protocolId = Math.abs(parseInt(frm.protocol_id.value));        
7604 25 Feb 19 nicklas 203     }
7604 25 Feb 19 nicklas 204     return protocolId;
7604 25 Feb 19 nicklas 205   }
7604 25 Feb 19 nicklas 206   
7604 25 Feb 19 nicklas 207   bioassays.getParents = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 208   {
7604 25 Feb 19 nicklas 209     var frm = document.forms['bioassay'];
7604 25 Feb 19 nicklas 210     var parents = [];
7604 25 Feb 19 nicklas 211
7604 25 Feb 19 nicklas 212     var arraySlideId = Math.abs(parseInt(frm.arrayslide_id.value));
7604 25 Feb 19 nicklas 213     if (arraySlideId > 0) parents[parents.length] = 'ARRAYSLIDE:'+arraySlideId;
7604 25 Feb 19 nicklas 214     var hardwareId = Math.abs(parseInt(frm.hardware_id.value));
7604 25 Feb 19 nicklas 215     if (hardwareId > 0) parents[parents.length] = 'HARDWARE:'+hardwareId;
7604 25 Feb 19 nicklas 216     var protocolId = Math.abs(parseInt(frm.protocol_id.value));
7604 25 Feb 19 nicklas 217     if (protocolId > 0) parents[parents.length] = 'PROTOCOL:'+protocolId;
7604 25 Feb 19 nicklas 218     var kitId = Math.abs(parseInt(frm.kit_id.value));
7604 25 Feb 19 nicklas 219     if (kitId > 0) parents[parents.length] = 'KIT:'+kitId;
7604 25 Feb 19 nicklas 220
7604 25 Feb 19 nicklas 221     var ids = Link.getIdsInList(frm.extracts, 'EXTRACT');
7604 25 Feb 19 nicklas 222     if (ids.length > 0)
7604 25 Feb 19 nicklas 223     {
7604 25 Feb 19 nicklas 224       parents[parents.length] = 'EXTRACT:'+ids.join(':');
7604 25 Feb 19 nicklas 225     }
7604 25 Feb 19 nicklas 226     return parents;
7604 25 Feb 19 nicklas 227   }
7604 25 Feb 19 nicklas 228
7604 25 Feb 19 nicklas 229   bioassays.selectProtocol = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 230   {
7604 25 Feb 19 nicklas 231     var frm = document.forms['bioassay'];
7604 25 Feb 19 nicklas 232     var url = '&resetTemporary=1';
7604 25 Feb 19 nicklas 233     url += ItemSubtype.createRelatedFilter('subtype_id', 'PROTOCOL');
7604 25 Feb 19 nicklas 234     if (frm.protocol_id.length > 1) 
7604 25 Feb 19 nicklas 235     {
7604 25 Feb 19 nicklas 236       var id = Math.abs(parseInt(frm.protocol_id[1].value));        
7604 25 Feb 19 nicklas 237       url += '&item_id='+id;
7604 25 Feb 19 nicklas 238     }
7604 25 Feb 19 nicklas 239     Dialogs.selectItem('PROTOCOL', 'protocol_id', 0, url);
7604 25 Feb 19 nicklas 240   }
7604 25 Feb 19 nicklas 241   
7604 25 Feb 19 nicklas 242   bioassays.selectKit = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 243   {
7604 25 Feb 19 nicklas 244     var frm = document.forms['bioassay'];
7604 25 Feb 19 nicklas 245     var url = '&resetTemporary=1';
7604 25 Feb 19 nicklas 246     url += '&tmpfilter:BOOLEAN:inactive=0';
7604 25 Feb 19 nicklas 247     url += ItemSubtype.createRelatedFilter('subtype_id', 'KIT');
7604 25 Feb 19 nicklas 248     if (frm.kit_id.length > 1) 
7604 25 Feb 19 nicklas 249     {
7604 25 Feb 19 nicklas 250       var id = Math.abs(parseInt(frm.kit_id[1].value));        
7604 25 Feb 19 nicklas 251       url += '&item_id='+id;
7604 25 Feb 19 nicklas 252     }
7604 25 Feb 19 nicklas 253     Dialogs.selectItem('KIT', 'kit_id', 0, url);
7604 25 Feb 19 nicklas 254   }
7604 25 Feb 19 nicklas 255   
7604 25 Feb 19 nicklas 256   bioassays.subtypeOnChange = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 257   {
7604 25 Feb 19 nicklas 258     var frm = document.forms['bioassay'];
7604 25 Feb 19 nicklas 259     var subtypeId = ItemSubtype.getSubtypeId('subtype_id');
7604 25 Feb 19 nicklas 260     var recentInfo = ItemSubtype.getRelatedProjectDefaultAndRecentItems('PHYSICALBIOASSAY', subtypeId, ['PROTOCOL', 'HARDWARE', 'KIT']);
7604 25 Feb 19 nicklas 261     
7604 25 Feb 19 nicklas 262     ItemSubtype.updateSelectionList(frm.protocol_id, recentInfo.PROTOCOL['recent'], recentInfo.PROTOCOL['default']);
7604 25 Feb 19 nicklas 263     ItemSubtype.updateSelectionList(frm.hardware_id, recentInfo.HARDWARE['recent'], recentInfo.HARDWARE['default']);
7604 25 Feb 19 nicklas 264     ItemSubtype.updateSelectionList(frm.kit_id, recentInfo.KIT['recent']);
7604 25 Feb 19 nicklas 265   }
7604 25 Feb 19 nicklas 266
7604 25 Feb 19 nicklas 267   bioassays.selectHardware = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 268   {
7604 25 Feb 19 nicklas 269     var frm = document.forms['bioassay'];
7604 25 Feb 19 nicklas 270     var url = '&resetTemporary=1';
7604 25 Feb 19 nicklas 271     url += ItemSubtype.createRelatedFilter('subtype_id', 'HARDWARE');
7604 25 Feb 19 nicklas 272     if (frm.hardware_id.length > 1)
7604 25 Feb 19 nicklas 273     {
7604 25 Feb 19 nicklas 274       var id = Math.abs(parseInt(frm.hardware_id[1].value));        
7604 25 Feb 19 nicklas 275       url += '&item_id='+id;
7604 25 Feb 19 nicklas 276     }
7604 25 Feb 19 nicklas 277     Dialogs.selectItem('HARDWARE', 'hardware_id', 0, url);
7604 25 Feb 19 nicklas 278   }
7604 25 Feb 19 nicklas 279   
7604 25 Feb 19 nicklas 280   bioassays.selectArraySlide = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 281   {
7604 25 Feb 19 nicklas 282     var frm = document.forms['bioassay'];
7604 25 Feb 19 nicklas 283     var url = '';
7604 25 Feb 19 nicklas 284     if (frm.arrayslide_id.length > 1) 
7604 25 Feb 19 nicklas 285     {
7604 25 Feb 19 nicklas 286       var id = Math.abs(parseInt(frm.arrayslide_id[1].value));        
7604 25 Feb 19 nicklas 287       url += '&item_id='+id;
7604 25 Feb 19 nicklas 288     }
7604 25 Feb 19 nicklas 289     url += '&resetTemporary=1&tmpfilter:STRING:physicalBioAssay.name==';
7604 25 Feb 19 nicklas 290     url += '&tmpfilter:BOOLEAN:destroyed=false';
7604 25 Feb 19 nicklas 291     Dialogs.selectItem('ARRAYSLIDE', 'arrayslide_id', 0, url);
7604 25 Feb 19 nicklas 292   }
7604 25 Feb 19 nicklas 293   
7604 25 Feb 19 nicklas 294   bioassays.arraySlideOnChange = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 295   {
7604 25 Feb 19 nicklas 296     var frm = document.forms['bioassay'];
7604 25 Feb 19 nicklas 297     var arraySlideId = frm.arrayslide_id.value;
7604 25 Feb 19 nicklas 298     if (arraySlideId > 0) 
7604 25 Feb 19 nicklas 299     {
7604 25 Feb 19 nicklas 300       bioassays.updateSize(arraySlideId);
7604 25 Feb 19 nicklas 301     }
7604 25 Feb 19 nicklas 302   }
7604 25 Feb 19 nicklas 303   
7604 25 Feb 19 nicklas 304   bioassays.updateSize = function(arraySlideId)
7604 25 Feb 19 nicklas 305   {
7604 25 Feb 19 nicklas 306     var request = Ajax.getXmlHttpRequest();
7604 25 Feb 19 nicklas 307     if (request != null)
7604 25 Feb 19 nicklas 308     {
7604 25 Feb 19 nicklas 309       var url = '../../lims/arrayslides/ajax.jsp?ID='+App.getSessionId();
7604 25 Feb 19 nicklas 310       url += '&cmd=GetArrayDesign&item_id=' + arraySlideId;
7604 25 Feb 19 nicklas 311       request.open("GET", url, true);
7604 25 Feb 19 nicklas 312       Ajax.setReadyStateHandler(request, bioassays.updateSizeCallback);
7604 25 Feb 19 nicklas 313       request.send(null);
7604 25 Feb 19 nicklas 314     }
7604 25 Feb 19 nicklas 315     return request != null;
7604 25 Feb 19 nicklas 316   }
7604 25 Feb 19 nicklas 317   
7604 25 Feb 19 nicklas 318   bioassays.updateSizeCallback = function(request)
7604 25 Feb 19 nicklas 319   {
7604 25 Feb 19 nicklas 320     var frm = document.forms['bioassay'];
7604 25 Feb 19 nicklas 321     var response = JSON.parse(request.responseText);
7604 25 Feb 19 nicklas 322     if (response.status != 'ok')
7604 25 Feb 19 nicklas 323     {
7604 25 Feb 19 nicklas 324       alert(response.message);
7604 25 Feb 19 nicklas 325       return false;
7604 25 Feb 19 nicklas 326     }
7604 25 Feb 19 nicklas 327
7604 25 Feb 19 nicklas 328     if (response.numArrays)
7604 25 Feb 19 nicklas 329     {
7604 25 Feb 19 nicklas 330       frm.size.value = response.numArrays;
7604 25 Feb 19 nicklas 331     }
7604 25 Feb 19 nicklas 332   }
7604 25 Feb 19 nicklas 333   
7604 25 Feb 19 nicklas 334   bioassays.addExtracts = function(event)
7604 25 Feb 19 nicklas 335   {
7604 25 Feb 19 nicklas 336     var frm = document.forms['bioassay'];
7604 25 Feb 19 nicklas 337     var currentExtracts = Link.getIdsInList(frm.extracts, 'EXTRACT');
7604 25 Feb 19 nicklas 338     var url = "&resetTemporary=1&exclude="+currentExtracts.join(',');
7604 25 Feb 19 nicklas 339     url += ItemSubtype.createRelatedFilter('subtype_id', 'EXTRACT');
7604 25 Feb 19 nicklas 340     Dialogs.selectItem('EXTRACT', event.currentTarget.id, 1, url);
7604 25 Feb 19 nicklas 341   }
7604 25 Feb 19 nicklas 342
7604 25 Feb 19 nicklas 343   bioassays.addExtractCallback = function(event)
7604 25 Feb 19 nicklas 344   {
7604 25 Feb 19 nicklas 345     event.detail.name += ' [-]';
7604 25 Feb 19 nicklas 346     event.detail.value = ':1';
7604 25 Feb 19 nicklas 347     Link.addItem('extracts', 'EXTRACT', event.detail);
7604 25 Feb 19 nicklas 348     if (event.detail.remaining == 0)
7604 25 Feb 19 nicklas 349     {
7604 25 Feb 19 nicklas 350       bioassays.extractsOnChange();
7604 25 Feb 19 nicklas 351     }
7604 25 Feb 19 nicklas 352   }
7604 25 Feb 19 nicklas 353
7604 25 Feb 19 nicklas 354   bioassays.extractsOnChange = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 355   {
7604 25 Feb 19 nicklas 356     var frm = document.forms['bioassay'];
7604 25 Feb 19 nicklas 357     var item = frm.extracts[frm.extracts.selectedIndex].item;
7604 25 Feb 19 nicklas 358     if (item && item.id)
7604 25 Feb 19 nicklas 359     {
7604 25 Feb 19 nicklas 360       var i = item.value ? item.value.indexOf(':') : -1;
7604 25 Feb 19 nicklas 361       frm.used_quantity.value = i >= 0 ? item.value.substring(0, i) : item.value;
7604 25 Feb 19 nicklas 362       frm.position.value = i >= 0 ? item.value.substring(i+1) : '1';
7604 25 Feb 19 nicklas 363       frm.used_quantity.focus();
7604 25 Feb 19 nicklas 364     }
7604 25 Feb 19 nicklas 365     else
7604 25 Feb 19 nicklas 366     {
7604 25 Feb 19 nicklas 367       frm.used_quantity.value = '';
7604 25 Feb 19 nicklas 368       frm.position.value = '1';
7604 25 Feb 19 nicklas 369     }
7604 25 Feb 19 nicklas 370   }
7604 25 Feb 19 nicklas 371
7604 25 Feb 19 nicklas 372   bioassays.usedQuantityOnBlur = function()
7604 25 Feb 19 nicklas 373   {
7604 25 Feb 19 nicklas 374     var frm = document.forms['bioassay'];
7604 25 Feb 19 nicklas 375     var usedQuantity = frm.used_quantity.value;
7604 25 Feb 19 nicklas 376     var position = frm.position.value;
7604 25 Feb 19 nicklas 377     var size = parseInt(frm.size.value);
7604 25 Feb 19 nicklas 378     if (position != '' && (position > size || position <= 0))
7604 25 Feb 19 nicklas 379     {
7604 25 Feb 19 nicklas 380       Forms.showNotification(frm.position, 'Position must be between 1 and ' + size);
7604 25 Feb 19 nicklas 381       return;
7604 25 Feb 19 nicklas 382     }
7604 25 Feb 19 nicklas 383     if (position == '') position = 1;
7604 25 Feb 19 nicklas 384     var displayQuantity = usedQuantity == '' ? '-' : usedQuantity+' µg';
7604 25 Feb 19 nicklas 385     for (var i = 0; i < frm.extracts.length; i++)  // >
7604 25 Feb 19 nicklas 386     {
7604 25 Feb 19 nicklas 387       var option = frm.extracts[i];
7604 25 Feb 19 nicklas 388       if (option.selected && option.item.id)
7604 25 Feb 19 nicklas 389       {
7604 25 Feb 19 nicklas 390         option.item.value = usedQuantity + ':' + position;
7604 25 Feb 19 nicklas 391         var text = option.text.replace(/\[.*\]/, '['+displayQuantity+']');
7604 25 Feb 19 nicklas 392         text = text.replace(/\d*\:/, position + ':');
7604 25 Feb 19 nicklas 393         option.text = text; 
7604 25 Feb 19 nicklas 394       }
7604 25 Feb 19 nicklas 395     }
7604 25 Feb 19 nicklas 396   }
7604 25 Feb 19 nicklas 397
7604 25 Feb 19 nicklas 398   
7604 25 Feb 19 nicklas 399   return bioassays;
7604 25 Feb 19 nicklas 400 }();
7604 25 Feb 19 nicklas 401
7604 25 Feb 19 nicklas 402 Doc.onLoad(BioAssays.initPage);
7604 25 Feb 19 nicklas 403 Doc.addElementInitializer(BioAssays.initElements);
7604 25 Feb 19 nicklas 404

Generated on Sat Oct  7 02:48:11 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)