www/views/reporterlists/reporters/index.jsp

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
2150 05 Apr 06 nicklas 1 <%-- $Id$
2150 05 Apr 06 nicklas 2   ------------------------------------------------------------------
5425 23 Sep 10 nicklas 3   Copyright (C) 2006 Jari Häkkinen, Nicklas Nordborg
2150 05 Apr 06 nicklas 4
2304 22 May 06 jari 5   This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
2304 22 May 06 jari 6   Available at http://base.thep.lu.se/
2150 05 Apr 06 nicklas 7
2150 05 Apr 06 nicklas 8   BASE is free software; you can redistribute it and/or
2150 05 Apr 06 nicklas 9   modify it under the terms of the GNU General Public License
4476 05 Sep 08 jari 10   as published by the Free Software Foundation; either version 3
2150 05 Apr 06 nicklas 11   of the License, or (at your option) any later version.
2150 05 Apr 06 nicklas 12
2150 05 Apr 06 nicklas 13   BASE is distributed in the hope that it will be useful,
2150 05 Apr 06 nicklas 14   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
2150 05 Apr 06 nicklas 15   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
2150 05 Apr 06 nicklas 16   GNU General Public License for more details.
2150 05 Apr 06 nicklas 17
2150 05 Apr 06 nicklas 18   You should have received a copy of the GNU General Public License
4511 11 Sep 08 jari 19   along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
2150 05 Apr 06 nicklas 20   ------------------------------------------------------------------
2150 05 Apr 06 nicklas 21
2150 05 Apr 06 nicklas 22   @author Nicklas
2150 05 Apr 06 nicklas 23   @version 2.0
2150 05 Apr 06 nicklas 24 --%>
7604 25 Feb 19 nicklas 25 <%@page import="net.sf.basedb.core.ReporterScore"%>
5426 24 Sep 10 nicklas 26 <%@ page pageEncoding="UTF-8" session="false"
2150 05 Apr 06 nicklas 27   import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
2150 05 Apr 06 nicklas 28   import="net.sf.basedb.core.DbControl"
2150 05 Apr 06 nicklas 29   import="net.sf.basedb.core.Item"
2150 05 Apr 06 nicklas 30   import="net.sf.basedb.core.ItemContext"
2428 27 Jun 06 nicklas 31   import="net.sf.basedb.core.Type"
2150 05 Apr 06 nicklas 32   import="net.sf.basedb.core.Reporter"
2150 05 Apr 06 nicklas 33   import="net.sf.basedb.core.ReporterList"
2150 05 Apr 06 nicklas 34   import="net.sf.basedb.core.ReporterScoreQuery"
2428 27 Jun 06 nicklas 35   import="net.sf.basedb.core.DataQuery"
2428 27 Jun 06 nicklas 36   import="net.sf.basedb.core.DataResultIterator"
2150 05 Apr 06 nicklas 37   import="net.sf.basedb.core.data.ReporterData"
2428 27 Jun 06 nicklas 38   import="net.sf.basedb.core.query.Restrictions"
2428 27 Jun 06 nicklas 39   import="net.sf.basedb.core.query.Expressions"
2428 27 Jun 06 nicklas 40   import="net.sf.basedb.core.query.Hql"
2150 05 Apr 06 nicklas 41   import="net.sf.basedb.core.Permission"
2150 05 Apr 06 nicklas 42   import="net.sf.basedb.core.PermissionDeniedException"
2150 05 Apr 06 nicklas 43   import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
2150 05 Apr 06 nicklas 44   import="net.sf.basedb.clients.web.WebException"
2753 20 Oct 06 nicklas 45   import="net.sf.basedb.util.Values"
2150 05 Apr 06 nicklas 46   import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
6040 30 Mar 12 nicklas 47   import="net.sf.basedb.core.plugin.GuiContext"
6040 30 Mar 12 nicklas 48   import="net.sf.basedb.util.extensions.ExtensionsInvoker"
6040 30 Mar 12 nicklas 49   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.ExtensionsControl"
6040 30 Mar 12 nicklas 50   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.JspContext"
6040 30 Mar 12 nicklas 51   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.list.ListColumnExportRenderer"
7604 25 Feb 19 nicklas 52   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.list.ListColumnAction"
6040 30 Mar 12 nicklas 53   import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.list.ListColumnUtil"
2428 27 Jun 06 nicklas 54   import="java.util.Arrays"
2150 05 Apr 06 nicklas 55 %>
2150 05 Apr 06 nicklas 56 <%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
2150 05 Apr 06 nicklas 57 <%!
2150 05 Apr 06 nicklas 58   private static final ItemContext defaultContext = Base.createDefaultContext("score", "name,score,externalId,symbol,description");
2150 05 Apr 06 nicklas 59   private static final Item itemType = Item.REPORTERSCORE;
2150 05 Apr 06 nicklas 60   static
2150 05 Apr 06 nicklas 61   {
2150 05 Apr 06 nicklas 62     defaultContext.setSortDirection(ItemContext.SortDirection.DESC);
2150 05 Apr 06 nicklas 63   }
2150 05 Apr 06 nicklas 64 %>
2150 05 Apr 06 nicklas 65 <%
2150 05 Apr 06 nicklas 66 final int reporterListId = Values.getInt(request.getParameter("reporterlist_id"));
2150 05 Apr 06 nicklas 67
2150 05 Apr 06 nicklas 68 final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(pageContext, true);
2150 05 Apr 06 nicklas 69 final String ID = sc.getId();
2150 05 Apr 06 nicklas 70 final String cmd = request.getParameter("cmd");
2150 05 Apr 06 nicklas 71 final String root = request.getContextPath()+"/";
2150 05 Apr 06 nicklas 72 final String mode = request.getParameter("mode");
2150 05 Apr 06 nicklas 73 final String callback = request.getParameter("callback");
2150 05 Apr 06 nicklas 74 final String itemId = request.getParameter("item_id");
2150 05 Apr 06 nicklas 75 final String listPage = "list_reporters.jsp?ID="+ID
2150 05 Apr 06 nicklas 76   +"&reporterlist_id="+reporterListId
2150 05 Apr 06 nicklas 77   +(mode == null ? "" : "&mode="+mode)
2150 05 Apr 06 nicklas 78   +(callback == null ? "" : "&callback="+callback)
2150 05 Apr 06 nicklas 79   +(itemId == null ? "" : "&item_id="+itemId);
2150 05 Apr 06 nicklas 80 final String viewPage = "view_reporter.jsp?ID="+ID+"&reporterlist_id="+reporterListId;
2150 05 Apr 06 nicklas 81 final String editPage = "edit_reporter.jsp?ID="+ID+"&reporterlist_id="+reporterListId;
2150 05 Apr 06 nicklas 82
2150 05 Apr 06 nicklas 83 String forward = null;
2150 05 Apr 06 nicklas 84 String redirect = null;
2150 05 Apr 06 nicklas 85 String message = null;
2150 05 Apr 06 nicklas 86 DbControl dc = null;
2150 05 Apr 06 nicklas 87 try
2150 05 Apr 06 nicklas 88 {
2150 05 Apr 06 nicklas 89   if (cmd == null || "List".equals(cmd))
2150 05 Apr 06 nicklas 90   {
2150 05 Apr 06 nicklas 91     // Display the list page without updatinging the current context
2811 26 Oct 06 nicklas 92     Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, null, defaultContext, true);
2150 05 Apr 06 nicklas 93     redirect = listPage;
2150 05 Apr 06 nicklas 94   }
2150 05 Apr 06 nicklas 95   else if ("UpdateContext".equals(cmd))
2150 05 Apr 06 nicklas 96   {
2150 05 Apr 06 nicklas 97     // Display the list page after updating the current context from the request parameters
2150 05 Apr 06 nicklas 98     Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
2150 05 Apr 06 nicklas 99     redirect = listPage;
2150 05 Apr 06 nicklas 100   }
2150 05 Apr 06 nicklas 101   else if ("LoadContext".equals(cmd))
2150 05 Apr 06 nicklas 102   {
2150 05 Apr 06 nicklas 103     // Display the list page after loading a saved context
2150 05 Apr 06 nicklas 104     int contextId = Values.getInt(request.getParameter("context"));
2150 05 Apr 06 nicklas 105     Base.loadContext(sc, contextId, defaultContext);
2150 05 Apr 06 nicklas 106     redirect = listPage;
2150 05 Apr 06 nicklas 107   }
2150 05 Apr 06 nicklas 108   
2150 05 Apr 06 nicklas 109   else if ("DeleteItems".equals(cmd))
2150 05 Apr 06 nicklas 110   {
2150 05 Apr 06 nicklas 111     // Delete all selected items on the list page
7954 12 May 21 nicklas 112     dc = sc.newDbControl(":Delete "+itemType);
2150 05 Apr 06 nicklas 113     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
2150 05 Apr 06 nicklas 114     ReporterList reporterList = ReporterList.getById(dc, reporterListId);
2150 05 Apr 06 nicklas 115     for (int reporterId : cc.getSelected())
2150 05 Apr 06 nicklas 116     {
2150 05 Apr 06 nicklas 117       reporterList.removeReporter(Reporter.getById(dc, reporterId));
2150 05 Apr 06 nicklas 118     }
2150 05 Apr 06 nicklas 119     dc.commit();
2150 05 Apr 06 nicklas 120     redirect = listPage;
2150 05 Apr 06 nicklas 121   }
2150 05 Apr 06 nicklas 122   else if ("ExportItems".equals(cmd))
2150 05 Apr 06 nicklas 123   {
2150 05 Apr 06 nicklas 124     // Run an export plugin in a list context
2150 05 Apr 06 nicklas 125     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
7954 12 May 21 nicklas 126     dc = sc.newDbControl(":Export "+itemType);
2150 05 Apr 06 nicklas 127     ReporterList reporterList = ReporterList.getById(dc, reporterListId);
2150 05 Apr 06 nicklas 128     final ReporterScoreQuery query = reporterList.getReporterScores();
5319 20 Apr 10 nicklas 129     query.join(Hql.innerJoin(null, "reporter", "rpt", true));
7914 23 Feb 21 nicklas 130     JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, GuiContext.list(itemType), null);
7914 23 Feb 21 nicklas 131     cc.configureQuery(dc, query, jspContext, true);
2150 05 Apr 06 nicklas 132     cc.setQuery(query);
7604 25 Feb 19 nicklas 133     ExtensionsInvoker<ListColumnAction<ReporterScore,?>> listInvoker = ListColumnUtil.useExtensions(jspContext);
7604 25 Feb 19 nicklas 134     listInvoker.render(new ListColumnExportRenderer<ReporterScore>(cc));
6040 30 Mar 12 nicklas 135     dc.close();    
2150 05 Apr 06 nicklas 136     redirect = "../../../common/export/index.jsp?ID="+ID+"&cmd=SelectPlugin&item_type="+itemType.name()+"&context_type=LIST&title=Export+reporters";
2150 05 Apr 06 nicklas 137   }
2150 05 Apr 06 nicklas 138   else if ("ImportItems".equals(cmd))
2150 05 Apr 06 nicklas 139   {
2150 05 Apr 06 nicklas 140     // Run an import plugin in a list context
2150 05 Apr 06 nicklas 141     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
7954 12 May 21 nicklas 142     dc = sc.newDbControl(":Import "+itemType);
2150 05 Apr 06 nicklas 143     ReporterList reporterList = ReporterList.getById(dc, reporterListId);
2150 05 Apr 06 nicklas 144     final ReporterScoreQuery query = reporterList.getReporterScores();
5319 20 Apr 10 nicklas 145     query.join(Hql.innerJoin(null, "reporter", "rpt", true));
7914 23 Feb 21 nicklas 146     JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, GuiContext.list(itemType), null);
7914 23 Feb 21 nicklas 147     cc.configureQuery(dc, query, jspContext, true);
2150 05 Apr 06 nicklas 148     dc.close();
2150 05 Apr 06 nicklas 149     cc.setQuery(query);
2150 05 Apr 06 nicklas 150     redirect = "../../../common/import/index.jsp?ID="+ID+"&cmd=SelectPlugin&item_type="+itemType.name()+"&context_type=LIST&title=Import+reporters";
2150 05 Apr 06 nicklas 151   }
2150 05 Apr 06 nicklas 152   else if ("RunListPlugin".equals(cmd))
2150 05 Apr 06 nicklas 153   {
2150 05 Apr 06 nicklas 154     // Run another plugin in a list context
2150 05 Apr 06 nicklas 155     ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, pageContext, defaultContext);
7954 12 May 21 nicklas 156     dc = sc.newDbControl(":Run plugin "+itemType);
2150 05 Apr 06 nicklas 157     ReporterList reporterList = ReporterList.getById(dc, reporterListId);
2150 05 Apr 06 nicklas 158     final ReporterScoreQuery query = reporterList.getReporterScores();
5319 20 Apr 10 nicklas 159     query.join(Hql.innerJoin(null, "reporter", "rpt", true));
7914 23 Feb 21 nicklas 160     JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, GuiContext.list(itemType), null);
7914 23 Feb 21 nicklas 161     cc.configureQuery(dc, query, jspContext, true);
2150 05 Apr 06 nicklas 162     dc.close();
2150 05 Apr 06 nicklas 163     cc.setQuery(query);
2150 05 Apr 06 nicklas 164     redirect = "../../../common/plugin/index.jsp?ID="+ID+"&cmd=SelectPlugin&item_type="+itemType.name()+"&context_type=LIST&main_type=OTHER&title=Run+plugin";
2150 05 Apr 06 nicklas 165   }
2428 27 Jun 06 nicklas 166   else if ("AddReporters".equals(cmd))
2428 27 Jun 06 nicklas 167   {
7954 12 May 21 nicklas 168     dc = sc.newDbControl("Add reporters to reporter list");
2428 27 Jun 06 nicklas 169     ReporterList reporterList = ReporterList.getById(dc, reporterListId);
2428 27 Jun 06 nicklas 170     ItemContext reporterContext = sc.getCurrentContext(Item.REPORTER);
2428 27 Jun 06 nicklas 171     final DataQuery<ReporterData> query = Reporter.getQuery();
5590 16 Mar 11 nicklas 172     reporterContext.configureQuery(dc, query, true);
2428 27 Jun 06 nicklas 173     String which = request.getParameter("which");
2428 27 Jun 06 nicklas 174     if ("selected".equals(which))
2428 27 Jun 06 nicklas 175     {
2428 27 Jun 06 nicklas 176       query.setFirstResult(0);
2428 27 Jun 06 nicklas 177       query.setMaxResults(-1);
2428 27 Jun 06 nicklas 178       Integer[] itemIds = Values.getInt(request.getParameter("items").split(","));
2428 27 Jun 06 nicklas 179       query.restrict(
2428 27 Jun 06 nicklas 180         Restrictions.in(
2428 27 Jun 06 nicklas 181           Hql.property("id"),
2428 27 Jun 06 nicklas 182           Expressions.parameter("_selected_")
2428 27 Jun 06 nicklas 183         )
2428 27 Jun 06 nicklas 184       );
2428 27 Jun 06 nicklas 185       query.setParameter("_selected_", Arrays.asList(itemIds), Type.INT);      
2428 27 Jun 06 nicklas 186     }
2428 27 Jun 06 nicklas 187     else if ("all".equals(which))
2428 27 Jun 06 nicklas 188     {
2428 27 Jun 06 nicklas 189       query.setFirstResult(0);
2428 27 Jun 06 nicklas 190       query.setMaxResults(-1);
2428 27 Jun 06 nicklas 191     }
2428 27 Jun 06 nicklas 192     DataResultIterator<ReporterData> result = query.iterate(dc);
2428 27 Jun 06 nicklas 193     int count = 0;
5952 10 Feb 12 nicklas 194     int total = 0;
2428 27 Jun 06 nicklas 195     while (result.hasNext())
2428 27 Jun 06 nicklas 196     {
2428 27 Jun 06 nicklas 197       if (reporterList.addReporter(result.next(), null)) count++;
5952 10 Feb 12 nicklas 198       total++;
2428 27 Jun 06 nicklas 199     }
2428 27 Jun 06 nicklas 200     dc.commit();
5952 10 Feb 12 nicklas 201     message = count + " of " + total + " reporters added";
2428 27 Jun 06 nicklas 202   }
2150 05 Apr 06 nicklas 203   else
2150 05 Apr 06 nicklas 204   {
2150 05 Apr 06 nicklas 205     throw new WebException("popup", "Invalid command", "The command {1} is not recognised as a valid command.", cmd);
2150 05 Apr 06 nicklas 206   }
2150 05 Apr 06 nicklas 207 }
2150 05 Apr 06 nicklas 208 finally
2150 05 Apr 06 nicklas 209 {
2150 05 Apr 06 nicklas 210   if (dc != null) dc.close();
2150 05 Apr 06 nicklas 211 }
2150 05 Apr 06 nicklas 212
2150 05 Apr 06 nicklas 213 if (forward != null)
2150 05 Apr 06 nicklas 214 {
6192 31 Oct 12 nicklas 215   sc.setSessionSetting("alert-message", message);
2150 05 Apr 06 nicklas 216   pageContext.forward(forward);
2150 05 Apr 06 nicklas 217 }
2150 05 Apr 06 nicklas 218 else if (redirect != null)
2150 05 Apr 06 nicklas 219 {
6192 31 Oct 12 nicklas 220   sc.setSessionSetting("alert-message", message);
2150 05 Apr 06 nicklas 221   response.sendRedirect(redirect);
2150 05 Apr 06 nicklas 222 }
2150 05 Apr 06 nicklas 223 else if (message == null)
2150 05 Apr 06 nicklas 224 {
2150 05 Apr 06 nicklas 225   response.sendRedirect(root + "common/close_popup.jsp?refresh_opener=1&wait=0");
2150 05 Apr 06 nicklas 226 }
2150 05 Apr 06 nicklas 227 else
2150 05 Apr 06 nicklas 228 {
2150 05 Apr 06 nicklas 229   response.sendRedirect(root + "common/close_popup.jsp?refresh_opener=1&message="+HTML.urlEncode(message));
2150 05 Apr 06 nicklas 230 }
2150 05 Apr 06 nicklas 231 %>
2150 05 Apr 06 nicklas 232

Generated on Sat Oct  7 02:48:20 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)