test/crossvalidation.cc

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
116 19 Jul 04 peter 1 // $Id$
116 19 Jul 04 peter 2
675 10 Oct 06 jari 3 /*
831 27 Mar 07 peter 4   Copyright (C) 2004, 2005 Peter Johansson
2121 13 Dec 09 peter 5   Copyright (C) 2006 Jari Häkkinen, Peter Johansson, Markus Ringnér
4359 23 Aug 23 peter 6   Copyright (C) 2007 Peter Johansson
4359 23 Aug 23 peter 7   Copyright (C) 2008 Jari Häkkinen, Peter Johansson
4359 23 Aug 23 peter 8   Copyright (C) 2012 Peter Johansson
116 19 Jul 04 peter 9
1437 25 Aug 08 peter 10   This file is part of the yat library, http://dev.thep.lu.se/yat
675 10 Oct 06 jari 11
675 10 Oct 06 jari 12   The yat library is free software; you can redistribute it and/or
675 10 Oct 06 jari 13   modify it under the terms of the GNU General Public License as
1486 09 Sep 08 jari 14   published by the Free Software Foundation; either version 3 of the
675 10 Oct 06 jari 15   License, or (at your option) any later version.
675 10 Oct 06 jari 16
675 10 Oct 06 jari 17   The yat library is distributed in the hope that it will be useful,
675 10 Oct 06 jari 18   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
675 10 Oct 06 jari 19   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU
675 10 Oct 06 jari 20   General Public License for more details.
675 10 Oct 06 jari 21
675 10 Oct 06 jari 22   You should have received a copy of the GNU General Public License
1487 10 Sep 08 jari 23   along with yat. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
675 10 Oct 06 jari 24 */
675 10 Oct 06 jari 25
2881 18 Nov 12 peter 26 #include <config.h>
2881 18 Nov 12 peter 27
675 10 Oct 06 jari 28 #include "yat/classifier/CrossValidationSampler.h"
675 10 Oct 06 jari 29 #include "yat/classifier/MatrixLookup.h"
675 10 Oct 06 jari 30 #include "yat/classifier/Target.h"
675 10 Oct 06 jari 31 #include "yat/utility/matrix.h"
675 10 Oct 06 jari 32
781 05 Mar 07 peter 33 #include <cassert>
116 19 Jul 04 peter 34 #include <cstdlib>
463 16 Dec 05 peter 35 #include <fstream>
116 19 Jul 04 peter 36 #include <iostream>
509 18 Feb 06 peter 37 #include <string>
463 16 Dec 05 peter 38 #include <vector>
116 19 Jul 04 peter 39
551 07 Mar 06 markus 40 // forward declaration
551 07 Mar 06 markus 41 void class_count_test(const std::vector<size_t>&, std::ostream*, bool&);
551 07 Mar 06 markus 42 void sample_count_test(const std::vector<size_t>&, std::ostream*, bool&);
551 07 Mar 06 markus 43
551 07 Mar 06 markus 44
463 16 Dec 05 peter 45 int main(const int argc,const char* argv[])
4200 19 Aug 22 peter 46 {
680 11 Oct 06 jari 47   using namespace theplu::yat;
4200 19 Aug 22 peter 48
463 16 Dec 05 peter 49   std::ostream* error;
463 16 Dec 05 peter 50   if (argc>1 && argv[1]==std::string("-v"))
463 16 Dec 05 peter 51     error = &std::cerr;
463 16 Dec 05 peter 52   else {
463 16 Dec 05 peter 53     error = new std::ofstream("/dev/null");
463 16 Dec 05 peter 54     if (argc>1)
463 16 Dec 05 peter 55       std::cout << "crossvalidation_test -v : for printing extra information\n";
463 16 Dec 05 peter 56   }
482 02 Jan 06 peter 57   *error << "testing crosssplitter" << std::endl;
463 16 Dec 05 peter 58   bool ok = true;
301 30 Apr 05 peter 59
463 16 Dec 05 peter 60   if (error!=&std::cerr)
463 16 Dec 05 peter 61     delete error;
4200 19 Aug 22 peter 62
482 02 Jan 06 peter 63   if (ok)
482 02 Jan 06 peter 64     return 0;
482 02 Jan 06 peter 65   return -1;
116 19 Jul 04 peter 66 }
551 07 Mar 06 markus 67
551 07 Mar 06 markus 68
4200 19 Aug 22 peter 69 void class_count_test(const std::vector<size_t>& class_count,
4200 19 Aug 22 peter 70                       std::ostream* error, bool& ok)
551 07 Mar 06 markus 71 {
551 07 Mar 06 markus 72   for (size_t i=0; i<class_count.size(); i++)
551 07 Mar 06 markus 73     if (class_count[i]==0){
551 07 Mar 06 markus 74       ok = false;
4200 19 Aug 22 peter 75       *error << "ERROR: class " << i << " was not in set."
4200 19 Aug 22 peter 76              << " Expected at least one sample from each class."
551 07 Mar 06 markus 77              << std::endl;
551 07 Mar 06 markus 78     }
551 07 Mar 06 markus 79 }
551 07 Mar 06 markus 80
4200 19 Aug 22 peter 81 void sample_count_test(const std::vector<size_t>& sample_count,
4200 19 Aug 22 peter 82                        std::ostream* error, bool& ok)
551 07 Mar 06 markus 83 {
551 07 Mar 06 markus 84   for (size_t i=0; i<sample_count.size(); i++){
551 07 Mar 06 markus 85     if (sample_count[i]!=1){
551 07 Mar 06 markus 86       ok = false;
4200 19 Aug 22 peter 87       *error << "ERROR: sample " << i << " was in a group " << sample_count[i]
551 07 Mar 06 markus 88              << " times." << " Expected to be 1 time" << std::endl;
551 07 Mar 06 markus 89     }
551 07 Mar 06 markus 90   }
551 07 Mar 06 markus 91 }

Generated on Sat Oct 14 02:20:49 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)